RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.32■■■■■ 7.09
SNX15-202ENST00000377244 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.08■■■■■ 5.93
SNX15-202ENST00000377244 ABCC9O60706 1549 aa49.98■■■■■ 5.59
SNX15-202ENST00000377244 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.55
SNX15-202ENST00000377244 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.24■■■■■ 5.47
SNX15-202ENST00000377244 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.99■■■■■ 5.43
SNX15-202ENST00000377244 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.68■■■■■ 5.38
SNX15-202ENST00000377244 NACADO15069 1562 aa48.65■■■■■ 5.38
SNX15-202ENST00000377244 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.44■■■■■ 5.34
SNX15-202ENST00000377244 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.93■■■■■ 5.26
SNX15-202ENST00000377244 SCRIBQ14160 1630 aa47.85■■■■■ 5.25
SNX15-202ENST00000377244 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.52■■■■■ 5.2
SNX15-202ENST00000377244 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.05■■■■■ 5.12
SNX15-202ENST00000377244 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.97■■■■■ 5.11
SNX15-202ENST00000377244 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.2■■■■■ 4.99
SNX15-202ENST00000377244 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.85■■■■■ 4.93
SNX15-202ENST00000377244 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.84■■■■■ 4.93
SNX15-202ENST00000377244 SMARCA4P51532 1647 aa45.79■■■■■ 4.92
SNX15-202ENST00000377244 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
SNX15-202ENST00000377244 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.9
SNX15-202ENST00000377244 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
SNX15-202ENST00000377244 WIZO95785 1651 aa45.44■■■■■ 4.86
SNX15-202ENST00000377244 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.22■■■■■ 4.83
SNX15-202ENST00000377244 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.21■■■■■ 4.83
SNX15-202ENST00000377244 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.2■■■■■ 4.83
SNX15-202ENST00000377244 SMARCA2P51531 1590 aa45.14■■■■■ 4.82
SNX15-202ENST00000377244 NCAPD3P42695 1498 aa44.91■■■■■ 4.78
SNX15-202ENST00000377244 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
SNX15-202ENST00000377244 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
SNX15-202ENST00000377244 HMGXB3Q12766 1538 aa44.8■■■■■ 4.76
SNX15-202ENST00000377244 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.78■■■■■ 4.76
SNX15-202ENST00000377244 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.43■■■■■ 4.7
SNX15-202ENST00000377244 CFTRP13569 1480 aa43.72■■■■■ 4.59
SNX15-202ENST00000377244 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.71■■■■■ 4.59
SNX15-202ENST00000377244 NESP48681 1621 aa43.66■■■■■ 4.58
SNX15-202ENST00000377244 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.53■■■■■ 4.56
SNX15-202ENST00000377244 PRDM2Q13029 1718 aa43.49■■■■■ 4.55
SNX15-202ENST00000377244 ABCC8Q09428 1581 aa43.32■■■■■ 4.53
SNX15-202ENST00000377244 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.3■■■■■ 4.52
SNX15-202ENST00000377244 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.25■■■■■ 4.51
SNX15-202ENST00000377244 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.18■■■■■ 4.5
SNX15-202ENST00000377244 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.14■■■■■ 4.5
SNX15-202ENST00000377244 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.06■■■■■ 4.48
SNX15-202ENST00000377244 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.06■■■■■ 4.48
SNX15-202ENST00000377244 SYNJ1O43426 1573 aa42.96■■■■■ 4.47
SNX15-202ENST00000377244 TRIM41Q8WV44 630 aa42.96■■■■■ 4.47
SNX15-202ENST00000377244 CUX1P39880 1505 aa42.91■■■■■ 4.46
SNX15-202ENST00000377244 ERCC6Q03468 1493 aa42.9■■■■■ 4.46
SNX15-202ENST00000377244 TOP2BQ02880 1626 aa42.81■■■■■ 4.44
SNX15-202ENST00000377244 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
SNX15-202ENST00000377244 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.78■■■■■ 4.44
SNX15-202ENST00000377244 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.73■■■■■ 4.43
SNX15-202ENST00000377244 TOPBP1Q92547 1522 aa42.71■■■■■ 4.43
SNX15-202ENST00000377244 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.71■■■■■ 4.43
SNX15-202ENST00000377244 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
SNX15-202ENST00000377244 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.55■■■■■ 4.4
SNX15-202ENST00000377244 WDR62O43379 1518 aa42.53■■■■■ 4.4
SNX15-202ENST00000377244 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
SNX15-202ENST00000377244 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.33■■■■■ 4.37
SNX15-202ENST00000377244 SOGA1O94964 1423 aa42.31■■■■■ 4.36
SNX15-202ENST00000377244 CUX2O14529 1486 aa42.24■■■■■ 4.35
SNX15-202ENST00000377244 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
SNX15-202ENST00000377244 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.22■■■■■ 4.35
SNX15-202ENST00000377244 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
SNX15-202ENST00000377244 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.12■■■■■ 4.33
SNX15-202ENST00000377244 WDR97A6NE52 1622 aa42.11■■■■■ 4.33
SNX15-202ENST00000377244 IFT140Q96RY7 1462 aa42.05■■■■■ 4.32
SNX15-202ENST00000377244 KIF27Q86VH2 1401 aa42.01■■■■■ 4.32
SNX15-202ENST00000377244 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
SNX15-202ENST00000377244 EEA1Q15075 1411 aa41.96■■■■■ 4.31
SNX15-202ENST00000377244 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
SNX15-202ENST00000377244 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.88■■■■■ 4.29
SNX15-202ENST00000377244 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.84■■■■■ 4.29
SNX15-202ENST00000377244 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
SNX15-202ENST00000377244 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.81■■■■■ 4.28
SNX15-202ENST00000377244 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
SNX15-202ENST00000377244 IGF1RP08069 1367 aa41.73■■■■■ 4.27
SNX15-202ENST00000377244 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.71■■■■■ 4.27
SNX15-202ENST00000377244 PBRM1Q86U86 1689 aa41.67■■■■■ 4.26
SNX15-202ENST00000377244 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.65■■■■■ 4.26
SNX15-202ENST00000377244 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.61■■■■■ 4.25
SNX15-202ENST00000377244 GRIN2BQ13224 1484 aa41.58■■■■■ 4.25
SNX15-202ENST00000377244 PRXQ9BXM0 1461 aa41.55■■■■■ 4.24
SNX15-202ENST00000377244 KIF21BO75037 1637 aa41.53■■■■■ 4.24
SNX15-202ENST00000377244 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.51■■■■■ 4.23
SNX15-202ENST00000377244 CUL7Q14999 1698 aa41.49■■■■■ 4.23
SNX15-202ENST00000377244 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.49■■■■■ 4.23
SNX15-202ENST00000377244 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.45■■■■■ 4.23
SNX15-202ENST00000377244 GOLGA3Q08378 1498 aa41.41■■■■■ 4.22
SNX15-202ENST00000377244 ADAMTS12P58397 1594 aa41.39■■■■■ 4.22
SNX15-202ENST00000377244 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
SNX15-202ENST00000377244 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.2
SNX15-202ENST00000377244 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
SNX15-202ENST00000377244 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
SNX15-202ENST00000377244 FBLN2P98095 1184 aa41.12■■■■■ 4.17
SNX15-202ENST00000377244 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.1■■■■■ 4.17
SNX15-202ENST00000377244 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
SNX15-202ENST00000377244 GRIN2AQ12879 1464 aa41.1■■■■■ 4.17
SNX15-202ENST00000377244 CHD1O14646 1710 aa41.02■■■■■ 4.16
SNX15-202ENST00000377244 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.95■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms