RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557846.5

CIB2-204, Transcript of calcium and integrin binding family member 2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CIB2, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2-204ENST00000557846 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.65■■■■■ 7.78
CIB2-204ENST00000557846 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.59■■■■■ 6.65
CIB2-204ENST00000557846 ABCC9O60706 1549 aa55.79■■■■■ 6.52
CIB2-204ENST00000557846 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.64■■■■■ 6.18
CIB2-204ENST00000557846 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.49■■■■■ 6.15
CIB2-204ENST00000557846 NACADO15069 1562 aa53.34■■■■■ 6.13
CIB2-204ENST00000557846 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.93■■■■■ 6.06
CIB2-204ENST00000557846 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.87■■■■■ 6.05
CIB2-204ENST00000557846 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.58■■■■■ 6.01
CIB2-204ENST00000557846 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.19■■■■■ 5.95
CIB2-204ENST00000557846 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.12■■■■■ 5.93
CIB2-204ENST00000557846 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.77■■■■■ 5.88
CIB2-204ENST00000557846 SCRIBQ14160 1630 aa51.75■■■■■ 5.88
CIB2-204ENST00000557846 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.38■■■■■ 5.82
CIB2-204ENST00000557846 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.22■■■■■ 5.79
CIB2-204ENST00000557846 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.49■■■■■ 5.67
CIB2-204ENST00000557846 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.36■■■■■ 5.65
CIB2-204ENST00000557846 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.13■■■■■ 5.62
CIB2-204ENST00000557846 SMARCA4P51532 1647 aa49.42■■■■■ 5.5
CIB2-204ENST00000557846 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.36■■■■■ 5.49
CIB2-204ENST00000557846 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.25■■■■■ 5.47
CIB2-204ENST00000557846 NCAPD3P42695 1498 aa49.24■■■■■ 5.47
CIB2-204ENST00000557846 SMARCA2P51531 1590 aa49.18■■■■■ 5.46
CIB2-204ENST00000557846 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.06■■■■■ 5.44
CIB2-204ENST00000557846 HMGXB3Q12766 1538 aa48.93■■■■■ 5.42
CIB2-204ENST00000557846 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.42
CIB2-204ENST00000557846 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.86■■■■■ 5.41
CIB2-204ENST00000557846 WIZO95785 1651 aa48.51■■■■■ 5.36
CIB2-204ENST00000557846 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
CIB2-204ENST00000557846 ERCC6Q03468 1493 aa48.16■■■■■ 5.3
CIB2-204ENST00000557846 NESP48681 1621 aa48.16■■■■■ 5.3
CIB2-204ENST00000557846 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
CIB2-204ENST00000557846 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.96■■■■■ 5.27
CIB2-204ENST00000557846 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.86■■■■■ 5.25
CIB2-204ENST00000557846 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.75■■■■■ 5.23
CIB2-204ENST00000557846 CUX2O14529 1486 aa47.6■■■■■ 5.21
CIB2-204ENST00000557846 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.5■■■■■ 5.19
CIB2-204ENST00000557846 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.47■■■■■ 5.19
CIB2-204ENST00000557846 CFTRP13569 1480 aa47.46■■■■■ 5.19
CIB2-204ENST00000557846 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
CIB2-204ENST00000557846 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
CIB2-204ENST00000557846 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.3■■■■■ 5.16
CIB2-204ENST00000557846 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.27■■■■■ 5.16
CIB2-204ENST00000557846 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.22■■■■■ 5.15
CIB2-204ENST00000557846 WDR62O43379 1518 aa47■■■■■ 5.11
CIB2-204ENST00000557846 PRDM2Q13029 1718 aa46.96■■■■■ 5.11
CIB2-204ENST00000557846 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
CIB2-204ENST00000557846 ABCC8Q09428 1581 aa46.51■■■■■ 5.04
CIB2-204ENST00000557846 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.49■■■■■ 5.03
CIB2-204ENST00000557846 TOPBP1Q92547 1522 aa46.49■■■■■ 5.03
CIB2-204ENST00000557846 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.39■■■■■ 5.02
CIB2-204ENST00000557846 IFT140Q96RY7 1462 aa46.27■■■■■ 5
CIB2-204ENST00000557846 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
CIB2-204ENST00000557846 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
CIB2-204ENST00000557846 CUX1P39880 1505 aa46.03■■■■■ 4.96
CIB2-204ENST00000557846 SOGA1O94964 1423 aa45.98■■■■■ 4.95
CIB2-204ENST00000557846 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.95■■■■■ 4.95
CIB2-204ENST00000557846 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.93■■■■■ 4.94
CIB2-204ENST00000557846 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
CIB2-204ENST00000557846 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
CIB2-204ENST00000557846 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
CIB2-204ENST00000557846 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
CIB2-204ENST00000557846 OSCARQ8IYS5 282 aa45.76■■■■■ 4.92
CIB2-204ENST00000557846 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.74■■■■■ 4.91
CIB2-204ENST00000557846 TOP2BQ02880 1626 aa45.56■■■■■ 4.88
CIB2-204ENST00000557846 SYNJ1O43426 1573 aa45.54■■■■■ 4.88
CIB2-204ENST00000557846 WDR97A6NE52 1622 aa45.53■■■■■ 4.88
CIB2-204ENST00000557846 FBLN2P98095 1184 aa45.53■■■■■ 4.88
CIB2-204ENST00000557846 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.52■■■■■ 4.88
CIB2-204ENST00000557846 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.46■■■■■ 4.87
CIB2-204ENST00000557846 GRIN2BQ13224 1484 aa45.42■■■■■ 4.86
CIB2-204ENST00000557846 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.4■■■■■ 4.86
CIB2-204ENST00000557846 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.37■■■■■ 4.85
CIB2-204ENST00000557846 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
CIB2-204ENST00000557846 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
CIB2-204ENST00000557846 CHD1O14646 1710 aa45.28■■■■■ 4.84
CIB2-204ENST00000557846 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.23■■■■■ 4.83
CIB2-204ENST00000557846 PBRM1Q86U86 1689 aa45.21■■■■■ 4.83
CIB2-204ENST00000557846 SYNJ2O15056 1496 aa45.13■■■■■ 4.82
CIB2-204ENST00000557846 TRIM41Q8WV44 630 aa45.03■■■■■ 4.8
CIB2-204ENST00000557846 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.91■■■■■ 4.78
CIB2-204ENST00000557846 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.87■■■■■ 4.77
CIB2-204ENST00000557846 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.86■■■■■ 4.77
CIB2-204ENST00000557846 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.86■■■■■ 4.77
CIB2-204ENST00000557846 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.86■■■■■ 4.77
CIB2-204ENST00000557846 ARHGEF11O15085 1522 aa44.86■■■■■ 4.77
CIB2-204ENST00000557846 ADAMTS12P58397 1594 aa44.85■■■■■ 4.77
CIB2-204ENST00000557846 KIF27Q86VH2 1401 aa44.83■■■■■ 4.77
CIB2-204ENST00000557846 GRIN2AQ12879 1464 aa44.8■■■■■ 4.76
CIB2-204ENST00000557846 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.76■■■■■ 4.76
CIB2-204ENST00000557846 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.65■■■■■ 4.74
CIB2-204ENST00000557846 IGF1RP08069 1367 aa44.64■■■■■ 4.74
CIB2-204ENST00000557846 NUP160Q12769 1436 aa44.58■■■■■ 4.73
CIB2-204ENST00000557846 CEP170Q5SW79 1584 aa44.55■■■■■ 4.72
CIB2-204ENST00000557846 ARAP1Q96P48 1450 aa44.47■■■■■ 4.71
CIB2-204ENST00000557846 CUL7Q14999 1698 aa44.45■■■■■ 4.71
CIB2-204ENST00000557846 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.42■■■■■ 4.7
CIB2-204ENST00000557846 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.3■■■■■ 4.68
CIB2-204ENST00000557846 JPH4Q96JJ6 628 aa44.28■■■■■ 4.68
CIB2-204ENST00000557846 SHROOM2Q13796 1616 aa44.19■■■■■ 4.66
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