RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301944.2

NXNL1-201, Transcript of nucleoredoxin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NXNL1, Length 946 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1-201ENST00000301944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.9■■■■■ 8.14
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NXNL1-201ENST00000301944 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.63■■■■■ 6.66
NXNL1-201ENST00000301944 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.26■■■■■ 6.6
NXNL1-201ENST00000301944 NACADO15069 1562 aa56.16■■■■■ 6.58
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NXNL1-201ENST00000301944 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.36■■■■■ 6.45
NXNL1-201ENST00000301944 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.27■■■■■ 6.44
NXNL1-201ENST00000301944 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.98■■■■■ 6.39
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NXNL1-201ENST00000301944 SCRIBQ14160 1630 aa53.98■■■■■ 6.23
NXNL1-201ENST00000301944 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.86■■■■■ 6.21
NXNL1-201ENST00000301944 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.76■■■■■ 6.2
NXNL1-201ENST00000301944 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.66■■■■■ 6.18
NXNL1-201ENST00000301944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.95■■■■■ 5.91
NXNL1-201ENST00000301944 NCAPD3P42695 1498 aa51.85■■■■■ 5.89
NXNL1-201ENST00000301944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.62■■■■■ 5.85
NXNL1-201ENST00000301944 CUX2O14529 1486 aa51.55■■■■■ 5.84
NXNL1-201ENST00000301944 ERCC6Q03468 1493 aa51.51■■■■■ 5.84
NXNL1-201ENST00000301944 SMARCA4P51532 1647 aa51.48■■■■■ 5.83
NXNL1-201ENST00000301944 SMARCA2P51531 1590 aa51.48■■■■■ 5.83
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NXNL1-201ENST00000301944 NESP48681 1621 aa51.12■■■■■ 5.77
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NXNL1-201ENST00000301944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.74■■■■■ 5.71
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NXNL1-201ENST00000301944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.45■■■■■ 5.67
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NXNL1-201ENST00000301944 WIZO95785 1651 aa50.15■■■■■ 5.62
NXNL1-201ENST00000301944 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.02■■■■■ 5.6
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NXNL1-201ENST00000301944 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.76■■■■■ 5.56
NXNL1-201ENST00000301944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.67■■■■■ 5.54
NXNL1-201ENST00000301944 CFTRP13569 1480 aa49.6■■■■■ 5.53
NXNL1-201ENST00000301944 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.59■■■■■ 5.53
NXNL1-201ENST00000301944 TRIM41Q8WV44 630 aa49.5■■■■■ 5.51
NXNL1-201ENST00000301944 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.48■■■■■ 5.51
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NXNL1-201ENST00000301944 PRDM2Q13029 1718 aa49.1■■■■■ 5.45
NXNL1-201ENST00000301944 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.93■■■■■ 5.42
NXNL1-201ENST00000301944 IFT140Q96RY7 1462 aa48.78■■■■■ 5.4
NXNL1-201ENST00000301944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.72■■■■■ 5.39
NXNL1-201ENST00000301944 TOPBP1Q92547 1522 aa48.69■■■■■ 5.39
NXNL1-201ENST00000301944 ABCC8Q09428 1581 aa48.6■■■■■ 5.37
NXNL1-201ENST00000301944 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.54■■■■■ 5.36
NXNL1-201ENST00000301944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.54■■■■■ 5.36
NXNL1-201ENST00000301944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.54■■■■■ 5.36
NXNL1-201ENST00000301944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.48■■■■■ 5.35
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NXNL1-201ENST00000301944 ARHGEF11O15085 1522 aa48.34■■■■■ 5.33
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NXNL1-201ENST00000301944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.24■■■■■ 5.31
NXNL1-201ENST00000301944 CHD1O14646 1710 aa48.17■■■■■ 5.3
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NXNL1-201ENST00000301944 FBLN2P98095 1184 aa48.01■■■■■ 5.28
NXNL1-201ENST00000301944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.99■■■■■ 5.27
NXNL1-201ENST00000301944 SOGA1O94964 1423 aa47.96■■■■■ 5.27
NXNL1-201ENST00000301944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
NXNL1-201ENST00000301944 ARAP1Q96P48 1450 aa47.84■■■■■ 5.25
NXNL1-201ENST00000301944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.81■■■■■ 5.24
NXNL1-201ENST00000301944 WDR97A6NE52 1622 aa47.79■■■■■ 5.24
NXNL1-201ENST00000301944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.73■■■■■ 5.23
NXNL1-201ENST00000301944 CUX1P39880 1505 aa47.72■■■■■ 5.23
NXNL1-201ENST00000301944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.62■■■■■ 5.21
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NXNL1-201ENST00000301944 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
NXNL1-201ENST00000301944 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.6■■■■■ 5.21
NXNL1-201ENST00000301944 GRIN2BQ13224 1484 aa47.58■■■■■ 5.21
NXNL1-201ENST00000301944 SYNJ1O43426 1573 aa47.54■■■■■ 5.2
NXNL1-201ENST00000301944 SYNJ2O15056 1496 aa47.46■■■■■ 5.19
NXNL1-201ENST00000301944 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.37■■■■■ 5.17
NXNL1-201ENST00000301944 PBRM1Q86U86 1689 aa47.37■■■■■ 5.17
NXNL1-201ENST00000301944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.26■■■■■ 5.16
NXNL1-201ENST00000301944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.21■■■■■ 5.15
NXNL1-201ENST00000301944 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
NXNL1-201ENST00000301944 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.01■■■■■ 5.12
NXNL1-201ENST00000301944 GRIN2AQ12879 1464 aa46.96■■■■■ 5.11
NXNL1-201ENST00000301944 ADAMTS12P58397 1594 aa46.88■■■■■ 5.1
NXNL1-201ENST00000301944 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.87■■■■■ 5.09
NXNL1-201ENST00000301944 TOP2BQ02880 1626 aa46.87■■■■■ 5.09
NXNL1-201ENST00000301944 NUP160Q12769 1436 aa46.82■■■■■ 5.09
NXNL1-201ENST00000301944 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.81■■■■■ 5.08
NXNL1-201ENST00000301944 CEP170Q5SW79 1584 aa46.8■■■■■ 5.08
NXNL1-201ENST00000301944 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.75■■■■■ 5.07
NXNL1-201ENST00000301944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.67■■■■■ 5.06
NXNL1-201ENST00000301944 SHROOM2Q13796 1616 aa46.66■■■■■ 5.06
NXNL1-201ENST00000301944 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
NXNL1-201ENST00000301944 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
NXNL1-201ENST00000301944 JPH4Q96JJ6 628 aa46.37■■■■■ 5.01
NXNL1-201ENST00000301944 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.24■■■■■ 4.99
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