RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615917.4

EI24-212, Transcript of EI24, autophagy associated transmembrane protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EI24, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EI24-212ENST00000615917 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.52■■■■■ 7.6
EI24-212ENST00000615917 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.48■■■■■ 6.47
EI24-212ENST00000615917 ABCC9O60706 1549 aa53.89■■■■■ 6.22
EI24-212ENST00000615917 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.16■■■■■ 5.94
EI24-212ENST00000615917 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.11■■■■■ 5.93
EI24-212ENST00000615917 NACADO15069 1562 aa52.08■■■■■ 5.93
EI24-212ENST00000615917 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.06■■■■■ 5.93
EI24-212ENST00000615917 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.89■■■■■ 5.9
EI24-212ENST00000615917 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.79■■■■■ 5.88
EI24-212ENST00000615917 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.8■■■■■ 5.72
EI24-212ENST00000615917 SCRIBQ14160 1630 aa50.6■■■■■ 5.69
EI24-212ENST00000615917 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.38■■■■■ 5.66
EI24-212ENST00000615917 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.38■■■■■ 5.65
EI24-212ENST00000615917 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.01■■■■■ 5.6
EI24-212ENST00000615917 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.07■■■■■ 5.45
EI24-212ENST00000615917 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.03■■■■■ 5.44
EI24-212ENST00000615917 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.78■■■■■ 5.4
EI24-212ENST00000615917 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.62■■■■■ 5.37
EI24-212ENST00000615917 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.49■■■■■ 5.35
EI24-212ENST00000615917 SMARCA4P51532 1647 aa48.45■■■■■ 5.35
EI24-212ENST00000615917 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.16■■■■■ 5.3
EI24-212ENST00000615917 SMARCA2P51531 1590 aa48.1■■■■■ 5.29
EI24-212ENST00000615917 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.08■■■■■ 5.29
EI24-212ENST00000615917 NCAPD3P42695 1498 aa48.02■■■■■ 5.28
EI24-212ENST00000615917 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.98■■■■■ 5.27
EI24-212ENST00000615917 HMGXB3Q12766 1538 aa47.85■■■■■ 5.25
EI24-212ENST00000615917 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.24
EI24-212ENST00000615917 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.23
EI24-212ENST00000615917 WIZO95785 1651 aa47.67■■■■■ 5.22
EI24-212ENST00000615917 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
EI24-212ENST00000615917 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
EI24-212ENST00000615917 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.73■■■■■ 5.07
EI24-212ENST00000615917 NESP48681 1621 aa46.71■■■■■ 5.07
EI24-212ENST00000615917 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.65■■■■■ 5.06
EI24-212ENST00000615917 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.64■■■■■ 5.06
EI24-212ENST00000615917 ERCC6Q03468 1493 aa46.49■■■■■ 5.03
EI24-212ENST00000615917 CFTRP13569 1480 aa46.44■■■■■ 5.02
EI24-212ENST00000615917 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.42■■■■■ 5.02
EI24-212ENST00000615917 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.2■■■■■ 4.99
EI24-212ENST00000615917 PRDM2Q13029 1718 aa46.15■■■■■ 4.98
EI24-212ENST00000615917 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.11■■■■■ 4.97
EI24-212ENST00000615917 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.05■■■■■ 4.96
EI24-212ENST00000615917 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
EI24-212ENST00000615917 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.89■■■■■ 4.94
EI24-212ENST00000615917 CUX2O14529 1486 aa45.86■■■■■ 4.93
EI24-212ENST00000615917 WDR62O43379 1518 aa45.71■■■■■ 4.91
EI24-212ENST00000615917 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
EI24-212ENST00000615917 ABCC8Q09428 1581 aa45.5■■■■■ 4.87
EI24-212ENST00000615917 TOPBP1Q92547 1522 aa45.41■■■■■ 4.86
EI24-212ENST00000615917 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.41■■■■■ 4.86
EI24-212ENST00000615917 CUX1P39880 1505 aa45.18■■■■■ 4.82
EI24-212ENST00000615917 IFT140Q96RY7 1462 aa45.07■■■■■ 4.81
EI24-212ENST00000615917 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.06■■■■■ 4.8
EI24-212ENST00000615917 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
EI24-212ENST00000615917 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.99■■■■■ 4.79
EI24-212ENST00000615917 TOP2BQ02880 1626 aa44.92■■■■■ 4.78
EI24-212ENST00000615917 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.91■■■■■ 4.78
EI24-212ENST00000615917 SOGA1O94964 1423 aa44.88■■■■■ 4.77
EI24-212ENST00000615917 SYNJ1O43426 1573 aa44.88■■■■■ 4.77
EI24-212ENST00000615917 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
EI24-212ENST00000615917 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.8■■■■■ 4.76
EI24-212ENST00000615917 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
EI24-212ENST00000615917 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
EI24-212ENST00000615917 WDR97A6NE52 1622 aa44.62■■■■■ 4.73
EI24-212ENST00000615917 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.58■■■■■ 4.73
EI24-212ENST00000615917 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.56■■■■■ 4.725e-7■■■■□ 26.3
EI24-212ENST00000615917 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
EI24-212ENST00000615917 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.38■■■■■ 4.69
EI24-212ENST00000615917 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.36■■■■■ 4.69
EI24-212ENST00000615917 GRIN2BQ13224 1484 aa44.33■■■■■ 4.69
EI24-212ENST00000615917 TRIM41Q8WV44 630 aa44.26■■■■■ 4.68
EI24-212ENST00000615917 PBRM1Q86U86 1689 aa44.26■■■■■ 4.68
EI24-212ENST00000615917 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.19■■■■■ 4.67
EI24-212ENST00000615917 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.66
EI24-212ENST00000615917 KIF27Q86VH2 1401 aa44.12■■■■■ 4.65
EI24-212ENST00000615917 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.08■■■■■ 4.65
EI24-212ENST00000615917 FBLN2P98095 1184 aa44.02■■■■■ 4.64
EI24-212ENST00000615917 OSCARQ8IYS5 282 aa44.02■■■■■ 4.64
EI24-212ENST00000615917 CHD1O14646 1710 aa44■■■■■ 4.63
EI24-212ENST00000615917 SYNJ2O15056 1496 aa44■■■■■ 4.63
EI24-212ENST00000615917 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.98■■■■■ 4.63
EI24-212ENST00000615917 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
EI24-212ENST00000615917 ADAMTS12P58397 1594 aa43.92■■■■■ 4.62
EI24-212ENST00000615917 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.89■■■■■ 4.62
EI24-212ENST00000615917 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.89■■■■■ 4.62
EI24-212ENST00000615917 IGF1RP08069 1367 aa43.83■■■■■ 4.61
EI24-212ENST00000615917 CUL7Q14999 1698 aa43.77■■■■■ 4.6
EI24-212ENST00000615917 GRIN2AQ12879 1464 aa43.74■■■■■ 4.59
EI24-212ENST00000615917 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.71■■■■■ 4.59
EI24-212ENST00000615917 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.61■■■■■ 4.57
EI24-212ENST00000615917 EEA1Q15075 1411 aa43.54■■■■■ 4.56
EI24-212ENST00000615917 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.53■■■■■ 4.56
EI24-212ENST00000615917 NUP160Q12769 1436 aa43.53■■■■■ 4.56
EI24-212ENST00000615917 CEP170Q5SW79 1584 aa43.48■■■■■ 4.55
EI24-212ENST00000615917 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.41■■■■■ 4.54
EI24-212ENST00000615917 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.38■■■■■ 4.53
EI24-212ENST00000615917 PRXQ9BXM0 1461 aa43.31■■■■■ 4.52
EI24-212ENST00000615917 ARHGEF11O15085 1522 aa43.28■■■■■ 4.52
EI24-212ENST00000615917 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
EI24-212ENST00000615917 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.23■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms