RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413642.7

VEGFA-207, Transcript of vascular endothelial growth factor A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,197 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFA-207ENST00000413642 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.69■■■■■ 7.95
VEGFA-207ENST00000413642 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.54■■■■■ 6.8
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VEGFA-207ENST00000413642 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.48■■■■■ 6.31
VEGFA-207ENST00000413642 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.47■■■■■ 6.31
VEGFA-207ENST00000413642 NACADO15069 1562 aa54.29■■■■■ 6.28
VEGFA-207ENST00000413642 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.77■■■■■ 6.2
VEGFA-207ENST00000413642 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.77■■■■■ 6.2
VEGFA-207ENST00000413642 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.38■■■■■ 6.14
VEGFA-207ENST00000413642 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.35■■■■■ 6.13
VEGFA-207ENST00000413642 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.19■■■■■ 6.11
VEGFA-207ENST00000413642 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.96■■■■■ 6.07
VEGFA-207ENST00000413642 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.94■■■■■ 6.07
VEGFA-207ENST00000413642 SCRIBQ14160 1630 aa52.66■■■■■ 6.02
VEGFA-207ENST00000413642 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.15■■■■■ 5.94
VEGFA-207ENST00000413642 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.56■■■■■ 5.84
VEGFA-207ENST00000413642 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.48■■■■■ 5.83
VEGFA-207ENST00000413642 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.27■■■■■ 5.8
VEGFA-207ENST00000413642 SMARCA4P51532 1647 aa50.25■■■■■ 5.64
VEGFA-207ENST00000413642 NCAPD3P42695 1498 aa50.19■■■■■ 5.62
VEGFA-207ENST00000413642 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.19■■■■■ 5.62
VEGFA-207ENST00000413642 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.11■■■■■ 5.61
VEGFA-207ENST00000413642 SMARCA2P51531 1590 aa49.98■■■■■ 5.59
VEGFA-207ENST00000413642 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.92■■■■■ 5.58
VEGFA-207ENST00000413642 HMGXB3Q12766 1538 aa49.81■■■■■ 5.56
VEGFA-207ENST00000413642 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.71■■■■■ 5.55
VEGFA-207ENST00000413642 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.7■■■■■ 5.55
VEGFA-207ENST00000413642 WIZO95785 1651 aa49.31■■■■■ 5.48
VEGFA-207ENST00000413642 NESP48681 1621 aa49.25■■■■■ 5.47
VEGFA-207ENST00000413642 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.18■■■■■ 5.46
VEGFA-207ENST00000413642 ERCC6Q03468 1493 aa49.13■■■■■ 5.46
VEGFA-207ENST00000413642 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.85■■■■■ 5.41
VEGFA-207ENST00000413642 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.75■■■■■ 5.39
VEGFA-207ENST00000413642 CUX2O14529 1486 aa48.71■■■■■ 5.39
VEGFA-207ENST00000413642 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
VEGFA-207ENST00000413642 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.61■■■■■ 5.37
VEGFA-207ENST00000413642 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.47■■■■■ 5.35
VEGFA-207ENST00000413642 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.45■■■■■ 5.35
VEGFA-207ENST00000413642 CFTRP13569 1480 aa48.31■■■■■ 5.32
VEGFA-207ENST00000413642 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.23■■■■■ 5.31
VEGFA-207ENST00000413642 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.17■■■■■ 5.3
VEGFA-207ENST00000413642 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.16■■■■■ 5.3
VEGFA-207ENST00000413642 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.11■■■■■ 5.29
VEGFA-207ENST00000413642 WDR62O43379 1518 aa47.98■■■■■ 5.27
VEGFA-207ENST00000413642 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.93■■■■■ 5.26
VEGFA-207ENST00000413642 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
VEGFA-207ENST00000413642 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
VEGFA-207ENST00000413642 PRDM2Q13029 1718 aa47.66■■■■■ 5.22
VEGFA-207ENST00000413642 TOPBP1Q92547 1522 aa47.35■■■■■ 5.17
VEGFA-207ENST00000413642 ABCC8Q09428 1581 aa47.2■■■■■ 5.15
VEGFA-207ENST00000413642 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.18■■■■■ 5.14
VEGFA-207ENST00000413642 IFT140Q96RY7 1462 aa47.13■■■■■ 5.13
VEGFA-207ENST00000413642 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
VEGFA-207ENST00000413642 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
VEGFA-207ENST00000413642 CUX1P39880 1505 aa46.84■■■■■ 5.09
VEGFA-207ENST00000413642 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.82■■■■■ 5.09
VEGFA-207ENST00000413642 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.82■■■■■ 5.09
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VEGFA-207ENST00000413642 SOGA1O94964 1423 aa46.75■■■■■ 5.07
VEGFA-207ENST00000413642 OSCARQ8IYS5 282 aa46.73■■■■■ 5.07
VEGFA-207ENST00000413642 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
VEGFA-207ENST00000413642 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
VEGFA-207ENST00000413642 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.35■■■■■ 5.011e-6■■■■□ 26.4
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VEGFA-207ENST00000413642 SYNJ1O43426 1573 aa46.26■■■■■ 5
VEGFA-207ENST00000413642 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.25■■■■■ 5
VEGFA-207ENST00000413642 WDR97A6NE52 1622 aa46.25■■■■■ 4.99
VEGFA-207ENST00000413642 TRIM41Q8WV44 630 aa46.24■■■■■ 4.99
VEGFA-207ENST00000413642 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.22■■■■■ 4.99
VEGFA-207ENST00000413642 TOP2BQ02880 1626 aa46.21■■■■■ 4.99
VEGFA-207ENST00000413642 GRIN2BQ13224 1484 aa46.2■■■■■ 4.99
VEGFA-207ENST00000413642 CHD1O14646 1710 aa46.2■■■■■ 4.99
VEGFA-207ENST00000413642 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.17■■■■■ 4.98
VEGFA-207ENST00000413642 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.16■■■■■ 4.98
VEGFA-207ENST00000413642 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
VEGFA-207ENST00000413642 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
VEGFA-207ENST00000413642 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.04■■■■■ 4.96
VEGFA-207ENST00000413642 PBRM1Q86U86 1689 aa45.97■■■■■ 4.95
VEGFA-207ENST00000413642 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.96■■■■■ 4.95
VEGFA-207ENST00000413642 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.96■■■■■ 4.95
VEGFA-207ENST00000413642 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.96■■■■■ 4.95
VEGFA-207ENST00000413642 SYNJ2O15056 1496 aa45.95■■■■■ 4.95
VEGFA-207ENST00000413642 ARHGEF11O15085 1522 aa45.93■■■■■ 4.94
VEGFA-207ENST00000413642 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.75■■■■■ 4.91
VEGFA-207ENST00000413642 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.66■■■■■ 4.9
VEGFA-207ENST00000413642 ADAMTS12P58397 1594 aa45.66■■■■■ 4.9
VEGFA-207ENST00000413642 GRIN2AQ12879 1464 aa45.61■■■■■ 4.89
VEGFA-207ENST00000413642 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.61■■■■■ 4.89
VEGFA-207ENST00000413642 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.6■■■■■ 4.89
VEGFA-207ENST00000413642 ARAP1Q96P48 1450 aa45.56■■■■■ 4.88
VEGFA-207ENST00000413642 NUP160Q12769 1436 aa45.43■■■■■ 4.86
VEGFA-207ENST00000413642 CEP170Q5SW79 1584 aa45.41■■■■■ 4.86
VEGFA-207ENST00000413642 KIF27Q86VH2 1401 aa45.39■■■■■ 4.86
VEGFA-207ENST00000413642 IGF1RP08069 1367 aa45.35■■■■■ 4.85
VEGFA-207ENST00000413642 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.2■■■■■ 4.83
VEGFA-207ENST00000413642 SHROOM2Q13796 1616 aa45.07■■■■■ 4.81
VEGFA-207ENST00000413642 JPH4Q96JJ6 628 aa45.05■■■■■ 4.8
VEGFA-207ENST00000413642 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.05■■■■■ 4.8
VEGFA-207ENST00000413642 CUL7Q14999 1698 aa45.04■■■■■ 4.8
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