RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.65■■■■■ 7.46
GKAP1-202ENST00000376365 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.61■■■■■ 6.33
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC9O60706 1549 aa52.88■■■■■ 6.06
GKAP1-202ENST00000376365 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.46■■■■■ 5.83
GKAP1-202ENST00000376365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.38■■■■■ 5.82
GKAP1-202ENST00000376365 NACADO15069 1562 aa51.19■■■■■ 5.79
GKAP1-202ENST00000376365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.13■■■■■ 5.78
GKAP1-202ENST00000376365 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.01■■■■■ 5.76
GKAP1-202ENST00000376365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.01■■■■■ 5.76
GKAP1-202ENST00000376365 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.01■■■■■ 5.6
GKAP1-202ENST00000376365 SCRIBQ14160 1630 aa49.89■■■■■ 5.58
GKAP1-202ENST00000376365 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.5■■■■■ 5.51
GKAP1-202ENST00000376365 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.5■■■■■ 5.51
GKAP1-202ENST00000376365 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.09■■■■■ 5.45
GKAP1-202ENST00000376365 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.3
GKAP1-202ENST00000376365 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.93■■■■■ 5.26
GKAP1-202ENST00000376365 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.93■■■■■ 5.26
GKAP1-202ENST00000376365 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.86■■■■■ 5.25
GKAP1-202ENST00000376365 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
GKAP1-202ENST00000376365 SMARCA4P51532 1647 aa47.74■■■■■ 5.23
GKAP1-202ENST00000376365 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.51■■■■■ 5.2
GKAP1-202ENST00000376365 SMARCA2P51531 1590 aa47.33■■■■■ 5.17
GKAP1-202ENST00000376365 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.3■■■■■ 5.16
GKAP1-202ENST00000376365 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.23■■■■■ 5.15
GKAP1-202ENST00000376365 NCAPD3P42695 1498 aa47.19■■■■■ 5.14
GKAP1-202ENST00000376365 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.17■■■■■ 5.14
GKAP1-202ENST00000376365 WIZO95785 1651 aa47.08■■■■■ 5.13
GKAP1-202ENST00000376365 HMGXB3Q12766 1538 aa47.04■■■■■ 5.12
GKAP1-202ENST00000376365 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47■■■■■ 5.12
GKAP1-202ENST00000376365 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
GKAP1-202ENST00000376365 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
GKAP1-202ENST00000376365 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.02■■■■■ 4.96
GKAP1-202ENST00000376365 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.91■■■■■ 4.94
GKAP1-202ENST00000376365 NESP48681 1621 aa45.9■■■■■ 4.94
GKAP1-202ENST00000376365 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.86■■■■■ 4.93
GKAP1-202ENST00000376365 CFTRP13569 1480 aa45.7■■■■■ 4.91
GKAP1-202ENST00000376365 ERCC6Q03468 1493 aa45.6■■■■■ 4.89
GKAP1-202ENST00000376365 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.59■■■■■ 4.89
GKAP1-202ENST00000376365 PRDM2Q13029 1718 aa45.51■■■■■ 4.88
GKAP1-202ENST00000376365 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.44■■■■■ 4.86
GKAP1-202ENST00000376365 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.36■■■■■ 4.85
GKAP1-202ENST00000376365 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.28■■■■■ 4.84
GKAP1-202ENST00000376365 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
GKAP1-202ENST00000376365 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.07■■■■■ 4.81
GKAP1-202ENST00000376365 WDR62O43379 1518 aa44.88■■■■■ 4.78
GKAP1-202ENST00000376365 CUX2O14529 1486 aa44.84■■■■■ 4.77
GKAP1-202ENST00000376365 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC8Q09428 1581 aa44.75■■■■■ 4.75
GKAP1-202ENST00000376365 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.7■■■■■ 4.75
GKAP1-202ENST00000376365 TOPBP1Q92547 1522 aa44.69■■■■■ 4.74
GKAP1-202ENST00000376365 CUX1P39880 1505 aa44.55■■■■■ 4.72
GKAP1-202ENST00000376365 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.49■■■■■ 4.71
GKAP1-202ENST00000376365 SYNJ1O43426 1573 aa44.34■■■■■ 4.69
GKAP1-202ENST00000376365 TOP2BQ02880 1626 aa44.34■■■■■ 4.69
GKAP1-202ENST00000376365 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.34■■■■■ 4.69
GKAP1-202ENST00000376365 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
GKAP1-202ENST00000376365 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.33■■■■■ 4.69
GKAP1-202ENST00000376365 IFT140Q96RY7 1462 aa44.28■■■■■ 4.68
GKAP1-202ENST00000376365 SOGA1O94964 1423 aa44.19■■■■■ 4.66
GKAP1-202ENST00000376365 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
GKAP1-202ENST00000376365 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.14■■■■■ 4.66
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
GKAP1-202ENST00000376365 WDR97A6NE52 1622 aa43.94■■■■■ 4.63
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.91■■■■■ 4.62
GKAP1-202ENST00000376365 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
GKAP1-202ENST00000376365 TRIM41Q8WV44 630 aa43.89■■■■■ 4.62
GKAP1-202ENST00000376365 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
GKAP1-202ENST00000376365 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.7■■■■■ 4.59
GKAP1-202ENST00000376365 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.69■■■■■ 4.59
GKAP1-202ENST00000376365 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.64■■■■■ 4.58
GKAP1-202ENST00000376365 PBRM1Q86U86 1689 aa43.61■■■■■ 4.57
GKAP1-202ENST00000376365 GRIN2BQ13224 1484 aa43.61■■■■■ 4.57
GKAP1-202ENST00000376365 KIF27Q86VH2 1401 aa43.54■■■■■ 4.56
GKAP1-202ENST00000376365 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.47■■■■■ 4.55
GKAP1-202ENST00000376365 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
GKAP1-202ENST00000376365 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.42■■■■■ 4.54
GKAP1-202ENST00000376365 FBLN2P98095 1184 aa43.28■■■■■ 4.52
GKAP1-202ENST00000376365 CHD1O14646 1710 aa43.28■■■■■ 4.52
GKAP1-202ENST00000376365 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.26■■■■■ 4.52
GKAP1-202ENST00000376365 SYNJ2O15056 1496 aa43.26■■■■■ 4.52
GKAP1-202ENST00000376365 ADAMTS12P58397 1594 aa43.26■■■■■ 4.51
GKAP1-202ENST00000376365 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
GKAP1-202ENST00000376365 IGF1RP08069 1367 aa43.23■■■■■ 4.51
GKAP1-202ENST00000376365 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.2■■■■■ 4.51
GKAP1-202ENST00000376365 CUL7Q14999 1698 aa43.17■■■■■ 4.5
GKAP1-202ENST00000376365 OSCARQ8IYS5 282 aa43.12■■■■■ 4.49
GKAP1-202ENST00000376365 EEA1Q15075 1411 aa43.08■■■■■ 4.49
GKAP1-202ENST00000376365 GRIN2AQ12879 1464 aa43.04■■■■■ 4.48
GKAP1-202ENST00000376365 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.03■■■■■ 4.48
GKAP1-202ENST00000376365 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
GKAP1-202ENST00000376365 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.93■■■■■ 4.46
GKAP1-202ENST00000376365 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.85■■■■■ 4.45
GKAP1-202ENST00000376365 CEP170Q5SW79 1584 aa42.8■■■■■ 4.44
GKAP1-202ENST00000376365 PRXQ9BXM0 1461 aa42.79■■■■■ 4.44
GKAP1-202ENST00000376365 NUP160Q12769 1436 aa42.79■■■■■ 4.44
GKAP1-202ENST00000376365 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.78■■■■■ 4.44
GKAP1-202ENST00000376365 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.74■■■■■ 4.43
GKAP1-202ENST00000376365 KIF21BO75037 1637 aa42.59■■■■■ 4.41
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.55■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms