Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEDO75530 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEDO75530 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEDO75530 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEDO75530 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEDO75530 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEDO75530 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEDO75530 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEDO75530 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEDO75530 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEDO75530 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEDO75530 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEDO75530 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEDO75530 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEDO75530 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEDO75530 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEDO75530 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEDO75530 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EEDO75530 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEDO75530 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEDO75530 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEDO75530 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEDO75530 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEDO75530 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEDO75530 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EEDO75530 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EEDO75530 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEDO75530 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEDO75530 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEDO75530 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEDO75530 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEDO75530 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EEDO75530 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEDO75530 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEDO75530 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEDO75530 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEDO75530 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EEDO75530 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEDO75530 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEDO75530 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEDO75530 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEDO75530 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEDO75530 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEDO75530 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEDO75530 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEDO75530 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEDO75530 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEDO75530 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEDO75530 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEDO75530 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEDO75530 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEDO75530 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEDO75530 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEDO75530 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEDO75530 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEDO75530 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEDO75530 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EEDO75530 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEDO75530 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEDO75530 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEDO75530 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEDO75530 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEDO75530 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEDO75530 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEDO75530 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEDO75530 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEDO75530 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEDO75530 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEDO75530 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEDO75530 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEDO75530 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEDO75530 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEDO75530 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEDO75530 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEDO75530 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EEDO75530 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEDO75530 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EEDO75530 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEDO75530 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEDO75530 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EEDO75530 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EEDO75530 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EEDO75530 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEDO75530 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEDO75530 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEDO75530 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEDO75530 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEDO75530 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEDO75530 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEDO75530 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEDO75530 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEDO75530 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEDO75530 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEDO75530 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEDO75530 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEDO75530 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEDO75530 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEDO75530 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEDO75530 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEDO75530 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms