RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378634.6

COPRS-202, Transcript of coordinator of PRMT5 and differentiation stimulator, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene COPRS, Length 1,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPRS-202ENST00000378634 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.54■■■■■ 8.08
COPRS-202ENST00000378634 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.71■■■■■ 6.99
COPRS-202ENST00000378634 ABCC9O60706 1549 aa58.22■■■■■ 6.91
COPRS-202ENST00000378634 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.7■■■■■ 6.51
COPRS-202ENST00000378634 NACADO15069 1562 aa55.41■■■■■ 6.46
COPRS-202ENST00000378634 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.05■■■■■ 6.4
COPRS-202ENST00000378634 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.83■■■■■ 6.37
COPRS-202ENST00000378634 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.42■■■■■ 6.3
COPRS-202ENST00000378634 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.3■■■■■ 6.28
COPRS-202ENST00000378634 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.24■■■■■ 6.27
COPRS-202ENST00000378634 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.22■■■■■ 6.27
COPRS-202ENST00000378634 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.17■■■■■ 6.26
COPRS-202ENST00000378634 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.97■■■■■ 6.23
COPRS-202ENST00000378634 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.48■■■■■ 6.15
COPRS-202ENST00000378634 SCRIBQ14160 1630 aa53.43■■■■■ 6.14
COPRS-202ENST00000378634 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.65■■■■■ 6.02
COPRS-202ENST00000378634 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.64■■■■■ 6.02
COPRS-202ENST00000378634 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.45■■■■■ 5.99
COPRS-202ENST00000378634 NCAPD3P42695 1498 aa51.12■■■■■ 5.77
COPRS-202ENST00000378634 SMARCA4P51532 1647 aa51.05■■■■■ 5.76
COPRS-202ENST00000378634 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.99■■■■■ 5.75
COPRS-202ENST00000378634 SMARCA2P51531 1590 aa50.94■■■■■ 5.75
COPRS-202ENST00000378634 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.9■■■■■ 5.74
COPRS-202ENST00000378634 HMGXB3Q12766 1538 aa50.82■■■■■ 5.73
COPRS-202ENST00000378634 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.59■■■■■ 5.69
COPRS-202ENST00000378634 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.55■■■■■ 5.68
COPRS-202ENST00000378634 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.47■■■■■ 5.67
COPRS-202ENST00000378634 ERCC6Q03468 1493 aa50.32■■■■■ 5.65
COPRS-202ENST00000378634 CUX2O14529 1486 aa50.14■■■■■ 5.62
COPRS-202ENST00000378634 NESP48681 1621 aa50.1■■■■■ 5.61
COPRS-202ENST00000378634 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.94■■■■■ 5.59
COPRS-202ENST00000378634 WIZO95785 1651 aa49.85■■■■■ 5.57
COPRS-202ENST00000378634 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.64■■■■■ 5.54
COPRS-202ENST00000378634 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.58■■■■■ 5.53
COPRS-202ENST00000378634 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.58■■■■■ 5.53
COPRS-202ENST00000378634 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.58■■■■■ 5.53
COPRS-202ENST00000378634 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.57■■■■■ 5.53
COPRS-202ENST00000378634 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.49■■■■■ 5.51
COPRS-202ENST00000378634 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.34■■■■■ 5.49
COPRS-202ENST00000378634 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.17■■■■■ 5.46
COPRS-202ENST00000378634 CFTRP13569 1480 aa49.1■■■■■ 5.45
COPRS-202ENST00000378634 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.06■■■■■ 5.44
COPRS-202ENST00000378634 WDR62O43379 1518 aa49.03■■■■■ 5.44
COPRS-202ENST00000378634 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.01■■■■■ 5.44
COPRS-202ENST00000378634 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.73■■■■■ 5.39
COPRS-202ENST00000378634 PRDM2Q13029 1718 aa48.64■■■■■ 5.38
COPRS-202ENST00000378634 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
COPRS-202ENST00000378634 ABCC8Q09428 1581 aa48.13■■■■■ 5.29
COPRS-202ENST00000378634 TOPBP1Q92547 1522 aa48.12■■■■■ 5.29
COPRS-202ENST00000378634 IFT140Q96RY7 1462 aa48.08■■■■■ 5.29
COPRS-202ENST00000378634 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.01■■■■■ 5.28
COPRS-202ENST00000378634 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.86■■■■■ 5.25
COPRS-202ENST00000378634 OSCARQ8IYS5 282 aa47.84■■■■■ 5.25
COPRS-202ENST00000378634 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.68■■■■■ 5.22
COPRS-202ENST00000378634 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
COPRS-202ENST00000378634 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
COPRS-202ENST00000378634 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
COPRS-202ENST00000378634 TRIM41Q8WV44 630 aa47.52■■■■■ 5.2
COPRS-202ENST00000378634 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.47■■■■■ 5.19
COPRS-202ENST00000378634 SOGA1O94964 1423 aa47.44■■■■■ 5.18
COPRS-202ENST00000378634 CUX1P39880 1505 aa47.41■■■■■ 5.18
COPRS-202ENST00000378634 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.41■■■■■ 5.18
COPRS-202ENST00000378634 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.4■■■■■ 5.18
COPRS-202ENST00000378634 WDR97A6NE52 1622 aa47.32■■■■■ 5.17
COPRS-202ENST00000378634 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.16
COPRS-202ENST00000378634 CHD1O14646 1710 aa47.2■■■■■ 5.15
COPRS-202ENST00000378634 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.16■■■■■ 5.14
COPRS-202ENST00000378634 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.16■■■■■ 5.14
COPRS-202ENST00000378634 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.16■■■■■ 5.14
COPRS-202ENST00000378634 FBLN2P98095 1184 aa47.1■■■■■ 5.13
COPRS-202ENST00000378634 ARHGEF11O15085 1522 aa47.08■■■■■ 5.13
COPRS-202ENST00000378634 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.06■■■■■ 5.12
COPRS-202ENST00000378634 GRIN2BQ13224 1484 aa47.02■■■■■ 5.12
COPRS-202ENST00000378634 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
COPRS-202ENST00000378634 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.93■■■■■ 5.1
COPRS-202ENST00000378634 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.89■■■■■ 5.1
COPRS-202ENST00000378634 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
COPRS-202ENST00000378634 SYNJ2O15056 1496 aa46.82■■■■■ 5.09
COPRS-202ENST00000378634 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.82■■■■■ 5.09
COPRS-202ENST00000378634 PBRM1Q86U86 1689 aa46.82■■■■■ 5.09
COPRS-202ENST00000378634 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.8■■■■■ 5.08
COPRS-202ENST00000378634 TOP2BQ02880 1626 aa46.79■■■■■ 5.08
COPRS-202ENST00000378634 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.79■■■■■ 5.08
COPRS-202ENST00000378634 SYNJ1O43426 1573 aa46.77■■■■■ 5.08
COPRS-202ENST00000378634 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.73■■■■■ 5.07
COPRS-202ENST00000378634 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.64■■■■■ 5.06
COPRS-202ENST00000378634 ARAP1Q96P48 1450 aa46.63■■■■■ 5.05
COPRS-202ENST00000378634 ADAMTS12P58397 1594 aa46.43■■■■■ 5.02
COPRS-202ENST00000378634 GRIN2AQ12879 1464 aa46.4■■■■■ 5.02
COPRS-202ENST00000378634 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.37■■■■■ 5.01
COPRS-202ENST00000378634 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.34■■■■■ 5.01
COPRS-202ENST00000378634 NUP160Q12769 1436 aa46.24■■■■■ 4.99
COPRS-202ENST00000378634 CEP170Q5SW79 1584 aa46.18■■■■■ 4.98
COPRS-202ENST00000378634 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
COPRS-202ENST00000378634 SHROOM2Q13796 1616 aa45.99■■■■■ 4.95
COPRS-202ENST00000378634 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.93■■■■■ 4.94
COPRS-202ENST00000378634 KIF27Q86VH2 1401 aa45.91■■■■■ 4.94
COPRS-202ENST00000378634 IGF1RP08069 1367 aa45.79■■■■■ 4.92
COPRS-202ENST00000378634 CUL7Q14999 1698 aa45.78■■■■■ 4.92
COPRS-202ENST00000378634 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.77■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms