RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369484.7

CMC4-202, Transcript of C-X9-C motif containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMC4, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC4-202ENST00000369484 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.11■■■■■ 8.33
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CMC4-202ENST00000369484 ABCC9O60706 1549 aa60.31■■■■■ 7.24
CMC4-202ENST00000369484 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.44■■■■■ 6.79
CMC4-202ENST00000369484 NACADO15069 1562 aa57.03■■■■■ 6.72
CMC4-202ENST00000369484 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.62■■■■■ 6.65
CMC4-202ENST00000369484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.47■■■■■ 6.63
CMC4-202ENST00000369484 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.29■■■■■ 6.6
CMC4-202ENST00000369484 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.25■■■■■ 6.6
CMC4-202ENST00000369484 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.05■■■■■ 6.56
CMC4-202ENST00000369484 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.81■■■■■ 6.52
CMC4-202ENST00000369484 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.62■■■■■ 6.5
CMC4-202ENST00000369484 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.49■■■■■ 6.47
CMC4-202ENST00000369484 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.06■■■■■ 6.41
CMC4-202ENST00000369484 SCRIBQ14160 1630 aa54.91■■■■■ 6.38
CMC4-202ENST00000369484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.55■■■■■ 6.32
CMC4-202ENST00000369484 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.42■■■■■ 6.3
CMC4-202ENST00000369484 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.35■■■■■ 6.29
CMC4-202ENST00000369484 NCAPD3P42695 1498 aa52.62■■■■■ 6.01
CMC4-202ENST00000369484 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.43■■■■■ 5.98
CMC4-202ENST00000369484 SMARCA4P51532 1647 aa52.42■■■■■ 5.98
CMC4-202ENST00000369484 SMARCA2P51531 1590 aa52.32■■■■■ 5.97
CMC4-202ENST00000369484 HMGXB3Q12766 1538 aa52.27■■■■■ 5.96
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CMC4-202ENST00000369484 CUX2O14529 1486 aa52.08■■■■■ 5.93
CMC4-202ENST00000369484 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.07■■■■■ 5.93
CMC4-202ENST00000369484 ERCC6Q03468 1493 aa52.06■■■■■ 5.92
CMC4-202ENST00000369484 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.94■■■■■ 5.91
CMC4-202ENST00000369484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.92■■■■■ 5.9
CMC4-202ENST00000369484 NESP48681 1621 aa51.8■■■■■ 5.88
CMC4-202ENST00000369484 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.7■■■■■ 5.87
CMC4-202ENST00000369484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.49■■■■■ 5.83
CMC4-202ENST00000369484 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.4■■■■■ 5.82
CMC4-202ENST00000369484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.24■■■■■ 5.79
CMC4-202ENST00000369484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.12■■■■■ 5.77
CMC4-202ENST00000369484 WIZO95785 1651 aa51.11■■■■■ 5.77
CMC4-202ENST00000369484 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.97■■■■■ 5.75
CMC4-202ENST00000369484 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.71■■■■■ 5.71
CMC4-202ENST00000369484 WDR62O43379 1518 aa50.64■■■■■ 5.7
CMC4-202ENST00000369484 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.56■■■■■ 5.68
CMC4-202ENST00000369484 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.49■■■■■ 5.67
CMC4-202ENST00000369484 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.46■■■■■ 5.67
CMC4-202ENST00000369484 CFTRP13569 1480 aa50.41■■■■■ 5.66
CMC4-202ENST00000369484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.41■■■■■ 5.66
CMC4-202ENST00000369484 PRDM2Q13029 1718 aa50.09■■■■■ 5.61
CMC4-202ENST00000369484 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
CMC4-202ENST00000369484 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.83■■■■■ 5.57
CMC4-202ENST00000369484 TRIM41Q8WV44 630 aa49.68■■■■■ 5.54
CMC4-202ENST00000369484 OSCARQ8IYS5 282 aa49.57■■■■■ 5.53
CMC4-202ENST00000369484 IFT140Q96RY7 1462 aa49.49■■■■■ 5.51
CMC4-202ENST00000369484 TOPBP1Q92547 1522 aa49.47■■■■■ 5.51
CMC4-202ENST00000369484 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.4■■■■■ 5.5
CMC4-202ENST00000369484 ABCC8Q09428 1581 aa49.36■■■■■ 5.49
CMC4-202ENST00000369484 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.32■■■■■ 5.49
CMC4-202ENST00000369484 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
CMC4-202ENST00000369484 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
CMC4-202ENST00000369484 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.08■■■■■ 5.45
CMC4-202ENST00000369484 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.08■■■■■ 5.45
CMC4-202ENST00000369484 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.08■■■■■ 5.45
CMC4-202ENST00000369484 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.96■■■■■ 5.43
CMC4-202ENST00000369484 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.92■■■■■ 5.42
CMC4-202ENST00000369484 CHD1O14646 1710 aa48.9■■■■■ 5.42
CMC4-202ENST00000369484 ARHGEF11O15085 1522 aa48.88■■■■■ 5.41
CMC4-202ENST00000369484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.74■■■■■ 5.39
CMC4-202ENST00000369484 SOGA1O94964 1423 aa48.67■■■■■ 5.38
CMC4-202ENST00000369484 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.63■■■■■ 5.38
CMC4-202ENST00000369484 WDR97A6NE52 1622 aa48.62■■■■■ 5.37
CMC4-202ENST00000369484 CUX1P39880 1505 aa48.59■■■■■ 5.37
CMC4-202ENST00000369484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.57■■■■■ 5.37
CMC4-202ENST00000369484 FBLN2P98095 1184 aa48.52■■■■■ 5.36
CMC4-202ENST00000369484 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.45■■■■■ 5.35
CMC4-202ENST00000369484 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.4■■■■■ 5.34
CMC4-202ENST00000369484 ARAP1Q96P48 1450 aa48.38■■■■■ 5.34
CMC4-202ENST00000369484 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.35■■■■■ 5.33
CMC4-202ENST00000369484 GRIN2BQ13224 1484 aa48.3■■■■■ 5.32
CMC4-202ENST00000369484 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.29■■■■■ 5.32
CMC4-202ENST00000369484 SYNJ1O43426 1573 aa48.23■■■■■ 5.31
CMC4-202ENST00000369484 PBRM1Q86U86 1689 aa48.23■■■■■ 5.31
CMC4-202ENST00000369484 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.18■■■■■ 5.3
CMC4-202ENST00000369484 SYNJ2O15056 1496 aa48.16■■■■■ 5.3
CMC4-202ENST00000369484 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.12■■■■■ 5.29
CMC4-202ENST00000369484 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
CMC4-202ENST00000369484 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.09■■■■■ 5.29
CMC4-202ENST00000369484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.09■■■■■ 5.29
CMC4-202ENST00000369484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.86■■■■■ 5.25
CMC4-202ENST00000369484 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.86■■■■■ 5.25
CMC4-202ENST00000369484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.82■■■■■ 5.25
CMC4-202ENST00000369484 TOP2BQ02880 1626 aa47.82■■■■■ 5.25
CMC4-202ENST00000369484 ADAMTS12P58397 1594 aa47.72■■■■■ 5.23
CMC4-202ENST00000369484 GRIN2AQ12879 1464 aa47.71■■■■■ 5.23
CMC4-202ENST00000369484 CEP170Q5SW79 1584 aa47.57■■■■■ 5.21
CMC4-202ENST00000369484 NUP160Q12769 1436 aa47.56■■■■■ 5.2
CMC4-202ENST00000369484 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.5■■■■■ 5.19
CMC4-202ENST00000369484 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.5■■■■■ 5.19
CMC4-202ENST00000369484 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.49■■■■■ 5.19
CMC4-202ENST00000369484 SHROOM2Q13796 1616 aa47.43■■■■■ 5.18
CMC4-202ENST00000369484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.05■■■■■ 5.12
CMC4-202ENST00000369484 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
CMC4-202ENST00000369484 JPH4Q96JJ6 628 aa46.97■■■■■ 5.11
CMC4-202ENST00000369484 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.89■■■■■ 5.1
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