RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597743.5

CALM3-209, Transcript of calmodulin 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene CALM3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3-209ENST00000597743 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.28■■■■■ 7.72
CALM3-209ENST00000597743 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.79■■■■■ 6.68
CALM3-209ENST00000597743 ABCC9O60706 1549 aa56.79■■■■■ 6.68
CALM3-209ENST00000597743 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.11■■■■■ 6.25
CALM3-209ENST00000597743 NACADO15069 1562 aa53.73■■■■■ 6.19
CALM3-209ENST00000597743 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.55■■■■■ 6.16
CALM3-209ENST00000597743 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.22■■■■■ 6.11
CALM3-209ENST00000597743 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.98■■■■■ 6.07
CALM3-209ENST00000597743 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.89■■■■■ 6.06
CALM3-209ENST00000597743 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.77■■■■■ 6.04
CALM3-209ENST00000597743 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.42■■■■■ 5.98
CALM3-209ENST00000597743 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.41■■■■■ 5.98
CALM3-209ENST00000597743 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.3■■■■■ 5.96
CALM3-209ENST00000597743 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.83■■■■■ 5.89
CALM3-209ENST00000597743 SCRIBQ14160 1630 aa51.72■■■■■ 5.87
CALM3-209ENST00000597743 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.29■■■■■ 5.8
CALM3-209ENST00000597743 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.18■■■■■ 5.78
CALM3-209ENST00000597743 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.18■■■■■ 5.78
CALM3-209ENST00000597743 NCAPD3P42695 1498 aa49.59■■■■■ 5.53
CALM3-209ENST00000597743 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.41■■■■■ 5.5
CALM3-209ENST00000597743 SMARCA4P51532 1647 aa49.34■■■■■ 5.49
CALM3-209ENST00000597743 SMARCA2P51531 1590 aa49.33■■■■■ 5.49
CALM3-209ENST00000597743 HMGXB3Q12766 1538 aa49.2■■■■■ 5.47
CALM3-209ENST00000597743 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.16■■■■■ 5.46
CALM3-209ENST00000597743 ERCC6Q03468 1493 aa49.12■■■■■ 5.45
CALM3-209ENST00000597743 CUX2O14529 1486 aa48.99■■■■■ 5.43
CALM3-209ENST00000597743 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.98■■■■■ 5.43
CALM3-209ENST00000597743 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.98■■■■■ 5.43
CALM3-209ENST00000597743 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.87■■■■■ 5.41
CALM3-209ENST00000597743 NESP48681 1621 aa48.74■■■■■ 5.39
CALM3-209ENST00000597743 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.73■■■■■ 5.39
CALM3-209ENST00000597743 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.48■■■■■ 5.35
CALM3-209ENST00000597743 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.26■■■■■ 5.32
CALM3-209ENST00000597743 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
CALM3-209ENST00000597743 WIZO95785 1651 aa48.15■■■■■ 5.3
CALM3-209ENST00000597743 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.12■■■■■ 5.29
CALM3-209ENST00000597743 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.11■■■■■ 5.29
CALM3-209ENST00000597743 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.78■■■■■ 5.24
CALM3-209ENST00000597743 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.74■■■■■ 5.23
CALM3-209ENST00000597743 WDR62O43379 1518 aa47.62■■■■■ 5.21
CALM3-209ENST00000597743 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.61■■■■■ 5.21
CALM3-209ENST00000597743 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
CALM3-209ENST00000597743 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.54■■■■■ 5.2
CALM3-209ENST00000597743 CFTRP13569 1480 aa47.53■■■■■ 5.2
CALM3-209ENST00000597743 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
CALM3-209ENST00000597743 PRDM2Q13029 1718 aa47.04■■■■■ 5.12
CALM3-209ENST00000597743 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.03■■■■■ 5.12
CALM3-209ENST00000597743 TRIM41Q8WV44 630 aa46.85■■■■■ 5.09
CALM3-209ENST00000597743 OSCARQ8IYS5 282 aa46.83■■■■■ 5.09
CALM3-209ENST00000597743 IFT140Q96RY7 1462 aa46.66■■■■■ 5.06
CALM3-209ENST00000597743 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
CALM3-209ENST00000597743 ABCC8Q09428 1581 aa46.62■■■■■ 5.05
CALM3-209ENST00000597743 TOPBP1Q92547 1522 aa46.62■■■■■ 5.05
CALM3-209ENST00000597743 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
CALM3-209ENST00000597743 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.46■■■■■ 5.03
CALM3-209ENST00000597743 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
CALM3-209ENST00000597743 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
CALM3-209ENST00000597743 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.13■■■■■ 4.981e-10■■□□□ 12.6
CALM3-209ENST00000597743 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
CALM3-209ENST00000597743 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.09■■■■■ 4.97
CALM3-209ENST00000597743 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.09■■■■■ 4.97
CALM3-209ENST00000597743 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.09■■■■■ 4.97
CALM3-209ENST00000597743 SOGA1O94964 1423 aa45.99■■■■■ 4.95
CALM3-209ENST00000597743 ARHGEF11O15085 1522 aa45.97■■■■■ 4.95
CALM3-209ENST00000597743 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.96■■■■■ 4.95
CALM3-209ENST00000597743 FBLN2P98095 1184 aa45.94■■■■■ 4.94
CALM3-209ENST00000597743 CHD1O14646 1710 aa45.92■■■■■ 4.94
CALM3-209ENST00000597743 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
CALM3-209ENST00000597743 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.86■■■■■ 4.93
CALM3-209ENST00000597743 CUX1P39880 1505 aa45.78■■■■■ 4.92
CALM3-209ENST00000597743 WDR97A6NE52 1622 aa45.78■■■■■ 4.92
CALM3-209ENST00000597743 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.71■■■■■ 4.91
CALM3-209ENST00000597743 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.66■■■■■ 4.9
CALM3-209ENST00000597743 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
CALM3-209ENST00000597743 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
CALM3-209ENST00000597743 GRIN2BQ13224 1484 aa45.58■■■■■ 4.89
CALM3-209ENST00000597743 ARAP1Q96P48 1450 aa45.49■■■■■ 4.87
CALM3-209ENST00000597743 SYNJ1O43426 1573 aa45.45■■■■■ 4.87
CALM3-209ENST00000597743 SYNJ2O15056 1496 aa45.42■■■■■ 4.86
CALM3-209ENST00000597743 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.42■■■■■ 4.86
CALM3-209ENST00000597743 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.39■■■■■ 4.86
CALM3-209ENST00000597743 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.36■■■■■ 4.85
CALM3-209ENST00000597743 PBRM1Q86U86 1689 aa45.34■■■■■ 4.85
CALM3-209ENST00000597743 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
CALM3-209ENST00000597743 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.24■■■■■ 4.83
CALM3-209ENST00000597743 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.23■■■■■ 4.83
CALM3-209ENST00000597743 TOP2BQ02880 1626 aa45.08■■■■■ 4.81
CALM3-209ENST00000597743 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.06■■■■■ 4.8
CALM3-209ENST00000597743 GRIN2AQ12879 1464 aa44.97■■■■■ 4.79
CALM3-209ENST00000597743 ADAMTS12P58397 1594 aa44.9■■■■■ 4.78
CALM3-209ENST00000597743 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.85■■■■■ 4.77
CALM3-209ENST00000597743 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
CALM3-209ENST00000597743 NUP160Q12769 1436 aa44.8■■■■■ 4.76
CALM3-209ENST00000597743 CEP170Q5SW79 1584 aa44.76■■■■■ 4.76
CALM3-209ENST00000597743 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.64■■■■■ 4.74
CALM3-209ENST00000597743 SHROOM2Q13796 1616 aa44.58■■■■■ 4.73
CALM3-209ENST00000597743 JPH4Q96JJ6 628 aa44.43■■■■■ 4.7
CALM3-209ENST00000597743 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
CALM3-209ENST00000597743 KIF27Q86VH2 1401 aa44.28■■■■■ 4.68
CALM3-209ENST00000597743 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.26■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms