RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458121.6

PARD6A-202, Transcript of par-6 family cell polarity regulator alpha, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PARD6A, Length 1,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6A-202ENST00000458121 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.26■■■■■ 8.52
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PARD6A-202ENST00000458121 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.73■■■■■ 6.99
PARD6A-202ENST00000458121 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.52■■■■■ 6.96
PARD6A-202ENST00000458121 NACADO15069 1562 aa58.26■■■■■ 6.92
PARD6A-202ENST00000458121 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.62■■■■■ 6.81
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PARD6A-202ENST00000458121 SMARCA4P51532 1647 aa53.31■■■■■ 6.12
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PARD6A-202ENST00000458121 WDR62O43379 1518 aa51.82■■■■■ 5.89
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PARD6A-202ENST00000458121 CFTRP13569 1480 aa51.45■■■■■ 5.83
PARD6A-202ENST00000458121 TRIM41Q8WV44 630 aa51.38■■■■■ 5.82
PARD6A-202ENST00000458121 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.31■■■■■ 5.8
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PARD6A-202ENST00000458121 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.52■■■■■ 5.68
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PARD6A-202ENST00000458121 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.83■■■■■ 5.57
PARD6A-202ENST00000458121 ARAP1Q96P48 1450 aa49.69■■■■■ 5.55
PARD6A-202ENST00000458121 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.69■■■■■ 5.54
PARD6A-202ENST00000458121 FBLN2P98095 1184 aa49.68■■■■■ 5.54
PARD6A-202ENST00000458121 SOGA1O94964 1423 aa49.68■■■■■ 5.54
PARD6A-202ENST00000458121 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.61■■■■■ 5.53
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PARD6A-202ENST00000458121 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.5■■■■■ 5.51
PARD6A-202ENST00000458121 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.47■■■■■ 5.51
PARD6A-202ENST00000458121 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.41■■■■■ 5.5
PARD6A-202ENST00000458121 CUX1P39880 1505 aa49.39■■■■■ 5.5
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PARD6A-202ENST00000458121 GRIN2BQ13224 1484 aa49.32■■■■■ 5.49
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PARD6A-202ENST00000458121 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.06■■■■■ 5.44
PARD6A-202ENST00000458121 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.99■■■■■ 5.43
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PARD6A-202ENST00000458121 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.91■■■■■ 5.42
PARD6A-202ENST00000458121 GRIN2AQ12879 1464 aa48.67■■■■■ 5.38
PARD6A-202ENST00000458121 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.66■■■■■ 5.38
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PARD6A-202ENST00000458121 TOP2BQ02880 1626 aa48.49■■■■■ 5.35
PARD6A-202ENST00000458121 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.48■■■■■ 5.35
PARD6A-202ENST00000458121 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.46■■■■■ 5.35
PARD6A-202ENST00000458121 SHROOM2Q13796 1616 aa48.4■■■■■ 5.34
PARD6A-202ENST00000458121 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.36■■■■■ 5.33
PARD6A-202ENST00000458121 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.3■■■■■ 5.32
PARD6A-202ENST00000458121 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.07■■■■■ 5.29
PARD6A-202ENST00000458121 JPH4Q96JJ6 628 aa48.05■■■■■ 5.28
PARD6A-202ENST00000458121 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.92■■■■■ 5.26
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