RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383282.3

NPHP3-202, Transcript of nephrocystin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3, Length 782 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-202ENST00000383282 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.9■■■■■ 8.14
NPHP3-202ENST00000383282 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.06■■■■■ 7.04
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC9O60706 1549 aa59.02■■■■■ 7.04
NPHP3-202ENST00000383282 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.24■■■■■ 6.59
NPHP3-202ENST00000383282 NACADO15069 1562 aa55.87■■■■■ 6.53
NPHP3-202ENST00000383282 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.68■■■■■ 6.5
NPHP3-202ENST00000383282 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.21■■■■■ 6.43
NPHP3-202ENST00000383282 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.14■■■■■ 6.42
NPHP3-202ENST00000383282 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.98■■■■■ 6.39
NPHP3-202ENST00000383282 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.79■■■■■ 6.36
NPHP3-202ENST00000383282 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.64■■■■■ 6.34
NPHP3-202ENST00000383282 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.49■■■■■ 6.31
NPHP3-202ENST00000383282 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.45■■■■■ 6.31
NPHP3-202ENST00000383282 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.91■■■■■ 6.22
NPHP3-202ENST00000383282 SCRIBQ14160 1630 aa53.84■■■■■ 6.21
NPHP3-202ENST00000383282 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.28■■■■■ 6.12
NPHP3-202ENST00000383282 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.22■■■■■ 6.11
NPHP3-202ENST00000383282 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.18■■■■■ 6.1
NPHP3-202ENST00000383282 NCAPD3P42695 1498 aa51.58■■■■■ 5.85
NPHP3-202ENST00000383282 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.43■■■■■ 5.82
NPHP3-202ENST00000383282 SMARCA4P51532 1647 aa51.36■■■■■ 5.81
NPHP3-202ENST00000383282 SMARCA2P51531 1590 aa51.32■■■■■ 5.81
NPHP3-202ENST00000383282 HMGXB3Q12766 1538 aa51.2■■■■■ 5.79
NPHP3-202ENST00000383282 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.18■■■■■ 5.78
NPHP3-202ENST00000383282 ERCC6Q03468 1493 aa51.03■■■■■ 5.76
NPHP3-202ENST00000383282 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.97■■■■■ 5.75
NPHP3-202ENST00000383282 CUX2O14529 1486 aa50.88■■■■■ 5.74
NPHP3-202ENST00000383282 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.87■■■■■ 5.73
NPHP3-202ENST00000383282 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.75■■■■■ 5.71
NPHP3-202ENST00000383282 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.72■■■■■ 5.71
NPHP3-202ENST00000383282 NESP48681 1621 aa50.68■■■■■ 5.7
NPHP3-202ENST00000383282 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.4■■■■■ 5.66
NPHP3-202ENST00000383282 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.17■■■■■ 5.62
NPHP3-202ENST00000383282 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.14■■■■■ 5.62
NPHP3-202ENST00000383282 WIZO95785 1651 aa50.11■■■■■ 5.61
NPHP3-202ENST00000383282 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.04■■■■■ 5.6
NPHP3-202ENST00000383282 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.99■■■■■ 5.59
NPHP3-202ENST00000383282 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
NPHP3-202ENST00000383282 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.69■■■■■ 5.54
NPHP3-202ENST00000383282 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
NPHP3-202ENST00000383282 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.52■■■■■ 5.52
NPHP3-202ENST00000383282 WDR62O43379 1518 aa49.52■■■■■ 5.52
NPHP3-202ENST00000383282 CFTRP13569 1480 aa49.46■■■■■ 5.51
NPHP3-202ENST00000383282 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.46■■■■■ 5.51
NPHP3-202ENST00000383282 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49■■■■■ 5.43
NPHP3-202ENST00000383282 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.99■■■■■ 5.43
NPHP3-202ENST00000383282 PRDM2Q13029 1718 aa48.88■■■■■ 5.42
NPHP3-202ENST00000383282 OSCARQ8IYS5 282 aa48.6■■■■■ 5.37
NPHP3-202ENST00000383282 TRIM41Q8WV44 630 aa48.58■■■■■ 5.37
NPHP3-202ENST00000383282 IFT140Q96RY7 1462 aa48.55■■■■■ 5.36
NPHP3-202ENST00000383282 TOPBP1Q92547 1522 aa48.52■■■■■ 5.36
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC8Q09428 1581 aa48.48■■■■■ 5.35
NPHP3-202ENST00000383282 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.38■■■■■ 5.34
NPHP3-202ENST00000383282 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.34■■■■■ 5.33
NPHP3-202ENST00000383282 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
NPHP3-202ENST00000383282 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.03■■■■■ 5.28
NPHP3-202ENST00000383282 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
NPHP3-202ENST00000383282 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.98■■■■■ 5.27
NPHP3-202ENST00000383282 SOGA1O94964 1423 aa47.85■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.85■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.85■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.85■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.84■■■■■ 5.25
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGEF11O15085 1522 aa47.75■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.74■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 FBLN2P98095 1184 aa47.73■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
NPHP3-202ENST00000383282 CHD1O14646 1710 aa47.69■■■■■ 5.22
NPHP3-202ENST00000383282 CUX1P39880 1505 aa47.68■■■■■ 5.22
NPHP3-202ENST00000383282 WDR97A6NE52 1622 aa47.62■■■■■ 5.21
NPHP3-202ENST00000383282 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.52■■■■■ 5.2
NPHP3-202ENST00000383282 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.44■■■■■ 5.18
NPHP3-202ENST00000383282 GRIN2BQ13224 1484 aa47.42■■■■■ 5.18
NPHP3-202ENST00000383282 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
NPHP3-202ENST00000383282 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
NPHP3-202ENST00000383282 ARAP1Q96P48 1450 aa47.27■■■■■ 5.16
NPHP3-202ENST00000383282 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.26■■■■■ 5.16
NPHP3-202ENST00000383282 SYNJ2O15056 1496 aa47.25■■■■■ 5.15
NPHP3-202ENST00000383282 SYNJ1O43426 1573 aa47.24■■■■■ 5.15
NPHP3-202ENST00000383282 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.22■■■■■ 5.15
NPHP3-202ENST00000383282 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.2■■■■■ 5.15
NPHP3-202ENST00000383282 PBRM1Q86U86 1689 aa47.14■■■■■ 5.14
NPHP3-202ENST00000383282 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.09■■■■■ 5.13
NPHP3-202ENST00000383282 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.08■■■■■ 5.13
NPHP3-202ENST00000383282 TOP2BQ02880 1626 aa46.95■■■■■ 5.11
NPHP3-202ENST00000383282 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.94■■■■■ 5.1
NPHP3-202ENST00000383282 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
NPHP3-202ENST00000383282 GRIN2AQ12879 1464 aa46.79■■■■■ 5.08
NPHP3-202ENST00000383282 ADAMTS12P58397 1594 aa46.74■■■■■ 5.07
NPHP3-202ENST00000383282 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.69■■■■■ 5.06
NPHP3-202ENST00000383282 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.64■■■■■ 5.06
NPHP3-202ENST00000383282 NUP160Q12769 1436 aa46.62■■■■■ 5.05
NPHP3-202ENST00000383282 CEP170Q5SW79 1584 aa46.56■■■■■ 5.04
NPHP3-202ENST00000383282 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.43■■■■■ 5.02
NPHP3-202ENST00000383282 SHROOM2Q13796 1616 aa46.35■■■■■ 5.01
NPHP3-202ENST00000383282 JPH4Q96JJ6 628 aa46.2■■■■■ 4.99
NPHP3-202ENST00000383282 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
NPHP3-202ENST00000383282 KIF27Q86VH2 1401 aa46.12■■■■■ 4.97
NPHP3-202ENST00000383282 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.08■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms