Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 520.13■□□□□ 0.811e-16■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.811e-16■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.451e-16■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-16■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.411e-16■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-16■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 HDAC6-224ENST00000481929 591 ntTSL 414.2□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 HDAC6-206ENST00000426196 882 ntTSL 313.47□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 HDAC6-233ENST00000489352 585 ntTSL 410.9□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 34.3
PRPF4O43172 HDAC6-210ENST00000441703 599 ntTSL 36.51□□□□□ -1.372e-9■■■■■ 34.3
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PRPF4O43172 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.92e-21■■■■■ 34.2
PRPF4O43172 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.92e-21■■■■■ 34.2
PRPF4O43172 G6PC-202ENST00000585489 1097 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.785e-12■■■■■ 34.1
PRPF4O43172 G6PC-204ENST00000592383 987 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.025e-12■■■■■ 34.1
PRPF4O43172 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.245e-12■■■■■ 34.1
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PRPF4O43172 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 34.1
PRPF4O43172 PUF60-217ENST00000531951 973 ntTSL 318.39■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 34.1
PRPF4O43172 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 34.1
PRPF4O43172 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 34.1
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PRPF4O43172 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 214.04□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 34.1
PRPF4O43172 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 34.1
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PRPF4O43172 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 34.1
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PRPF4O43172 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.373e-10■■■■■ 34
PRPF4O43172 TICRR-203ENST00000561095 2367 ntTSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.083e-10■■■■■ 34
PRPF4O43172 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 34
PRPF4O43172 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.51e-9■■■■■ 34
PRPF4O43172 ACSF3-203ENST00000393145 7020 nt12.49□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 34
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PRPF4O43172 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.145e-8■■■■■ 33.9
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PRPF4O43172 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 33.7
PRPF4O43172 ENKD1-204ENST00000602531 888 ntTSL 320.88■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 33.7
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PRPF4O43172 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 33.7
PRPF4O43172 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 33.7
PRPF4O43172 CSGALNACT1-216ENST00000524213 554 ntTSL 215.83■□□□□ 0.126e-21■■■■■ 33.6
PRPF4O43172 CSGALNACT1-213ENST00000523262 792 ntTSL 215.15■□□□□ 0.026e-21■■■■■ 33.6
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PRPF4O43172 CSGALNACT1-209ENST00000522573 405 ntTSL 57.97□□□□□ -1.136e-21■■■■■ 33.6
PRPF4O43172 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 TMCC1-212ENST00000512902 533 ntTSL 315.99■□□□□ 0.154e-19■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 TMCC1-214ENST00000515024 557 ntTSL 315.52■□□□□ 0.084e-19■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 TMCC1-205ENST00000505616 402 ntTSL 29.92□□□□□ -0.824e-19■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.024e-19■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 TMCC1-206ENST00000505924 665 ntTSL 54.53□□□□□ -1.684e-19■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 TMCC1-208ENST00000508869 467 ntTSL 34.19□□□□□ -1.744e-19■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 ZNHIT3-207ENST00000619482 561 ntTSL 216.97■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 ZNHIT3-202ENST00000612728 1981 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.261e-9■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 ZNHIT3-206ENST00000619446 819 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-9■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 ZNHIT3-209ENST00000620324 834 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-9■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 ZNHIT3-204ENST00000617429 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.131e-9■■■■■ 33.5
PRPF4O43172 ZNHIT3-210ENST00000620863 881 ntTSL 28.02□□□□□ -1.131e-9■■■■■ 33.5
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