RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586123.5

ZNF444-202, Transcript of zinc finger protein 444, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF444, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444-202ENST00000586123 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.27■■■■■ 7.08
ZNF444-202ENST00000586123 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.91■■■■■ 6.06
ZNF444-202ENST00000586123 ABCC9O60706 1549 aa52.83■■■■■ 6.05
ZNF444-202ENST00000586123 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.33■■■■■ 5.65
ZNF444-202ENST00000586123 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.18■■■■■ 5.62
ZNF444-202ENST00000586123 NACADO15069 1562 aa50.06■■■■■ 5.6
ZNF444-202ENST00000586123 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.44■■■■■ 5.5
ZNF444-202ENST00000586123 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.37■■■■■ 5.49
ZNF444-202ENST00000586123 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.49
ZNF444-202ENST00000586123 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.14■■■■■ 5.46
ZNF444-202ENST00000586123 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.05■■■■■ 5.44
ZNF444-202ENST00000586123 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.92■■■■■ 5.42
ZNF444-202ENST00000586123 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.81■■■■■ 5.4
ZNF444-202ENST00000586123 SCRIBQ14160 1630 aa48.35■■■■■ 5.33
ZNF444-202ENST00000586123 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.18■■■■■ 5.3
ZNF444-202ENST00000586123 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.66■■■■■ 5.22
ZNF444-202ENST00000586123 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.63■■■■■ 5.22
ZNF444-202ENST00000586123 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.55■■■■■ 5.2
ZNF444-202ENST00000586123 NCAPD3P42695 1498 aa46.27■■■■■ 5
ZNF444-202ENST00000586123 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.17■■■■■ 4.98
ZNF444-202ENST00000586123 SMARCA4P51532 1647 aa46.12■■■■■ 4.97
ZNF444-202ENST00000586123 SMARCA2P51531 1590 aa46.01■■■■■ 4.96
ZNF444-202ENST00000586123 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
ZNF444-202ENST00000586123 HMGXB3Q12766 1538 aa45.86■■■■■ 4.93
ZNF444-202ENST00000586123 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
ZNF444-202ENST00000586123 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.68■■■■■ 4.9
ZNF444-202ENST00000586123 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.64■■■■■ 4.9
ZNF444-202ENST00000586123 ERCC6Q03468 1493 aa45.61■■■■■ 4.89
ZNF444-202ENST00000586123 NESP48681 1621 aa45.44■■■■■ 4.87
ZNF444-202ENST00000586123 CUX2O14529 1486 aa45.35■■■■■ 4.85
ZNF444-202ENST00000586123 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.12■■■■■ 4.81
ZNF444-202ENST00000586123 WIZO95785 1651 aa45.11■■■■■ 4.81
ZNF444-202ENST00000586123 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.11■■■■■ 4.81
ZNF444-202ENST00000586123 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.95■■■■■ 4.79
ZNF444-202ENST00000586123 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.93■■■■■ 4.78
ZNF444-202ENST00000586123 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
ZNF444-202ENST00000586123 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
ZNF444-202ENST00000586123 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.74■■■■■ 4.75
ZNF444-202ENST00000586123 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
ZNF444-202ENST00000586123 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.49■■■■■ 4.71
ZNF444-202ENST00000586123 CFTRP13569 1480 aa44.42■■■■■ 4.7
ZNF444-202ENST00000586123 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.38■■■■■ 4.69
ZNF444-202ENST00000586123 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.38■■■■■ 4.69
ZNF444-202ENST00000586123 WDR62O43379 1518 aa44.31■■■■■ 4.68
ZNF444-202ENST00000586123 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.14■■■■■ 4.66
ZNF444-202ENST00000586123 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
ZNF444-202ENST00000586123 PRDM2Q13029 1718 aa43.79■■■■■ 4.6
ZNF444-202ENST00000586123 TOPBP1Q92547 1522 aa43.54■■■■■ 4.56
ZNF444-202ENST00000586123 OSCARQ8IYS5 282 aa43.5■■■■■ 4.55
ZNF444-202ENST00000586123 IFT140Q96RY7 1462 aa43.49■■■■■ 4.55
ZNF444-202ENST00000586123 ABCC8Q09428 1581 aa43.49■■■■■ 4.55
ZNF444-202ENST00000586123 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
ZNF444-202ENST00000586123 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.37■■■■■ 4.53
ZNF444-202ENST00000586123 TRIM41Q8WV44 630 aa43.34■■■■■ 4.53
ZNF444-202ENST00000586123 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
ZNF444-202ENST00000586123 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
ZNF444-202ENST00000586123 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.1■■■■■ 4.491e-6■■■■□ 23.4
ZNF444-202ENST00000586123 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
ZNF444-202ENST00000586123 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.48
ZNF444-202ENST00000586123 SOGA1O94964 1423 aa43.02■■■■■ 4.48
ZNF444-202ENST00000586123 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43■■■■■ 4.47
ZNF444-202ENST00000586123 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
ZNF444-202ENST00000586123 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.9■■■■■ 4.46
ZNF444-202ENST00000586123 CUX1P39880 1505 aa42.89■■■■■ 4.46
ZNF444-202ENST00000586123 FBLN2P98095 1184 aa42.87■■■■■ 4.45
ZNF444-202ENST00000586123 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.7■■■■■ 4.43
ZNF444-202ENST00000586123 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.7■■■■■ 4.43
ZNF444-202ENST00000586123 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.7■■■■■ 4.43
ZNF444-202ENST00000586123 CHD1O14646 1710 aa42.66■■■■■ 4.42
ZNF444-202ENST00000586123 ARHGEF11O15085 1522 aa42.64■■■■■ 4.42
ZNF444-202ENST00000586123 WDR97A6NE52 1622 aa42.62■■■■■ 4.41
ZNF444-202ENST00000586123 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.61■■■■■ 4.41
ZNF444-202ENST00000586123 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
ZNF444-202ENST00000586123 GRIN2BQ13224 1484 aa42.55■■■■■ 4.4
ZNF444-202ENST00000586123 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.49■■■■■ 4.39
ZNF444-202ENST00000586123 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
ZNF444-202ENST00000586123 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.45■■■■■ 4.39
ZNF444-202ENST00000586123 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.41■■■■■ 4.38
ZNF444-202ENST00000586123 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.38■■■■■ 4.38
ZNF444-202ENST00000586123 SYNJ2O15056 1496 aa42.36■■■■■ 4.37
ZNF444-202ENST00000586123 SYNJ1O43426 1573 aa42.27■■■■■ 4.36
ZNF444-202ENST00000586123 PBRM1Q86U86 1689 aa42.25■■■■■ 4.35
ZNF444-202ENST00000586123 TOP2BQ02880 1626 aa42.25■■■■■ 4.35
ZNF444-202ENST00000586123 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.24■■■■■ 4.35
ZNF444-202ENST00000586123 ARAP1Q96P48 1450 aa42.24■■■■■ 4.35
ZNF444-202ENST00000586123 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.23■■■■■ 4.35
ZNF444-202ENST00000586123 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.2■■■■■ 4.35
ZNF444-202ENST00000586123 GRIN2AQ12879 1464 aa41.98■■■■■ 4.31
ZNF444-202ENST00000586123 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
ZNF444-202ENST00000586123 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.93■■■■■ 4.3
ZNF444-202ENST00000586123 ADAMTS12P58397 1594 aa41.93■■■■■ 4.3
ZNF444-202ENST00000586123 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.88■■■■■ 4.29
ZNF444-202ENST00000586123 NUP160Q12769 1436 aa41.83■■■■■ 4.29
ZNF444-202ENST00000586123 CEP170Q5SW79 1584 aa41.77■■■■■ 4.28
ZNF444-202ENST00000586123 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.64■■■■■ 4.26
ZNF444-202ENST00000586123 KIF27Q86VH2 1401 aa41.55■■■■■ 4.24
ZNF444-202ENST00000586123 JPH4Q96JJ6 628 aa41.54■■■■■ 4.24
ZNF444-202ENST00000586123 IGF1RP08069 1367 aa41.53■■■■■ 4.24
ZNF444-202ENST00000586123 SHROOM2Q13796 1616 aa41.51■■■■■ 4.24
ZNF444-202ENST00000586123 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms