RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554669.5

LINC01578-203, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01578, Length 578 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-203ENST00000554669 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.49■■■■■ 8.87
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LINC01578-203ENST00000554669 NACADO15069 1562 aa59.05■■■■■ 7.04
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LINC01578-203ENST00000554669 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.74■■■■■ 6.67
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LINC01578-203ENST00000554669 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.84■■■■■ 6.53
LINC01578-203ENST00000554669 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.51■■■■■ 6.48
LINC01578-203ENST00000554669 SMARCA4P51532 1647 aa54.73■■■■■ 6.35
LINC01578-203ENST00000554669 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.59■■■■■ 6.33
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LINC01578-203ENST00000554669 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.56■■■■■ 6.32
LINC01578-203ENST00000554669 SMARCA2P51531 1590 aa54.38■■■■■ 6.3
LINC01578-203ENST00000554669 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.37■■■■■ 6.29
LINC01578-203ENST00000554669 HMGXB3Q12766 1538 aa54.22■■■■■ 6.27
LINC01578-203ENST00000554669 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.21■■■■■ 6.27
LINC01578-203ENST00000554669 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.03■■■■■ 6.24
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LINC01578-203ENST00000554669 NESP48681 1621 aa53.42■■■■■ 6.14
LINC01578-203ENST00000554669 ERCC6Q03468 1493 aa53.17■■■■■ 6.1
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LINC01578-203ENST00000554669 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.94■■■■■ 6.07
LINC01578-203ENST00000554669 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.74■■■■■ 6.03
LINC01578-203ENST00000554669 CUX2O14529 1486 aa52.74■■■■■ 6.03
LINC01578-203ENST00000554669 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.68■■■■■ 6.02
LINC01578-203ENST00000554669 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.62■■■■■ 6.01
LINC01578-203ENST00000554669 CFTRP13569 1480 aa52.57■■■■■ 6.01
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LINC01578-203ENST00000554669 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.33■■■■■ 5.97
LINC01578-203ENST00000554669 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.27■■■■■ 5.96
LINC01578-203ENST00000554669 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.25■■■■■ 5.96
LINC01578-203ENST00000554669 WDR62O43379 1518 aa52.13■■■■■ 5.94
LINC01578-203ENST00000554669 PRDM2Q13029 1718 aa52.01■■■■■ 5.92
LINC01578-203ENST00000554669 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.97■■■■■ 5.91
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LINC01578-203ENST00000554669 TOPBP1Q92547 1522 aa51.48■■■■■ 5.83
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LINC01578-203ENST00000554669 ABCC8Q09428 1581 aa51.33■■■■■ 5.81
LINC01578-203ENST00000554669 IFT140Q96RY7 1462 aa51.18■■■■■ 5.78
LINC01578-203ENST00000554669 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.09■■■■■ 5.77
LINC01578-203ENST00000554669 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.03■■■■■ 5.76
LINC01578-203ENST00000554669 CUX1P39880 1505 aa51.02■■■■■ 5.76
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LINC01578-203ENST00000554669 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.85■■■■■ 5.73
LINC01578-203ENST00000554669 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.85■■■■■ 5.73
LINC01578-203ENST00000554669 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.8■■■■■ 5.72
LINC01578-203ENST00000554669 SOGA1O94964 1423 aa50.79■■■■■ 5.72
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LINC01578-203ENST00000554669 SYNJ1O43426 1573 aa50.46■■■■■ 5.67
LINC01578-203ENST00000554669 WDR97A6NE52 1622 aa50.43■■■■■ 5.66
LINC01578-203ENST00000554669 TOP2BQ02880 1626 aa50.42■■■■■ 5.66
LINC01578-203ENST00000554669 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.41■■■■■ 5.66
LINC01578-203ENST00000554669 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.33■■■■■ 5.65
LINC01578-203ENST00000554669 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.22■■■■■ 5.63
LINC01578-203ENST00000554669 GRIN2BQ13224 1484 aa50.2■■■■■ 5.63
LINC01578-203ENST00000554669 CHD1O14646 1710 aa50.19■■■■■ 5.62
LINC01578-203ENST00000554669 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.18■■■■■ 5.62
LINC01578-203ENST00000554669 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.16■■■■■ 5.62
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LINC01578-203ENST00000554669 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.78■■■■■ 5.56
LINC01578-203ENST00000554669 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.78■■■■■ 5.56
LINC01578-203ENST00000554669 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.78■■■■■ 5.56
LINC01578-203ENST00000554669 ARHGEF11O15085 1522 aa49.74■■■■■ 5.55
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LINC01578-203ENST00000554669 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.7■■■■■ 5.55
LINC01578-203ENST00000554669 ADAMTS12P58397 1594 aa49.7■■■■■ 5.55
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LINC01578-203ENST00000554669 CEP170Q5SW79 1584 aa49.4■■■■■ 5.5
LINC01578-203ENST00000554669 IGF1RP08069 1367 aa49.38■■■■■ 5.5
LINC01578-203ENST00000554669 ARAP1Q96P48 1450 aa49.37■■■■■ 5.49
LINC01578-203ENST00000554669 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.29■■■■■ 5.48
LINC01578-203ENST00000554669 CUL7Q14999 1698 aa49.13■■■■■ 5.46
LINC01578-203ENST00000554669 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.07■■■■■ 5.45
LINC01578-203ENST00000554669 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.06■■■■■ 5.44
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LINC01578-203ENST00000554669 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.02■■■■■ 5.44
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