RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592949.5

ZNF444-211, Transcript of zinc finger protein 444, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF444, Length 1,906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444-211ENST00000592949 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.07■■■■■ 5.93
ZNF444-211ENST00000592949 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.33■■■■■ 4.85
ZNF444-211ENST00000592949 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
ZNF444-211ENST00000592949 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.09■■■■■ 4.49
ZNF444-211ENST00000592949 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.74■■■■■ 4.43
ZNF444-211ENST00000592949 ABCC9O60706 1549 aa42.61■■■■■ 4.41
ZNF444-211ENST00000592949 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.51■■■■■ 4.4
ZNF444-211ENST00000592949 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.5■■■■■ 4.39
ZNF444-211ENST00000592949 NACADO15069 1562 aa42.14■■■■■ 4.34
ZNF444-211ENST00000592949 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.71■■■■■ 4.27
ZNF444-211ENST00000592949 SCRIBQ14160 1630 aa41.66■■■■■ 4.26
ZNF444-211ENST00000592949 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.99■■■■■ 4.15
ZNF444-211ENST00000592949 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
ZNF444-211ENST00000592949 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.55■■■■■ 4.08
ZNF444-211ENST00000592949 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
ZNF444-211ENST00000592949 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.45■■■■■ 4.07
ZNF444-211ENST00000592949 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.25■■■■■ 4.03
ZNF444-211ENST00000592949 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.032e-6■■□□□ 12.1
ZNF444-211ENST00000592949 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
ZNF444-211ENST00000592949 SMARCA4P51532 1647 aa39.99■■■■□ 3.99
ZNF444-211ENST00000592949 WIZO95785 1651 aa39.93■■■■□ 3.98
ZNF444-211ENST00000592949 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.54■■■■□ 3.92
ZNF444-211ENST00000592949 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
ZNF444-211ENST00000592949 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.4■■■■□ 3.9
ZNF444-211ENST00000592949 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.28■■■■□ 3.88
ZNF444-211ENST00000592949 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
ZNF444-211ENST00000592949 SMARCA2P51531 1590 aa39.23■■■■□ 3.87
ZNF444-211ENST00000592949 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.1■■■■□ 3.85
ZNF444-211ENST00000592949 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
ZNF444-211ENST00000592949 NCAPD3P42695 1498 aa38.91■■■■□ 3.82
ZNF444-211ENST00000592949 HMGXB3Q12766 1538 aa38.88■■■■□ 3.81
ZNF444-211ENST00000592949 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.61■■■■□ 3.77
ZNF444-211ENST00000592949 TRIM41Q8WV44 630 aa38.5■■■■□ 3.75
ZNF444-211ENST00000592949 ABCC8Q09428 1581 aa38.33■■■■□ 3.73
ZNF444-211ENST00000592949 CFTRP13569 1480 aa38.11■■■■□ 3.69
ZNF444-211ENST00000592949 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.04■■■■□ 3.68
ZNF444-211ENST00000592949 PRDM2Q13029 1718 aa37.95■■■■□ 3.67
ZNF444-211ENST00000592949 SYNJ1O43426 1573 aa37.93■■■■□ 3.66
ZNF444-211ENST00000592949 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.89■■■■□ 3.66
ZNF444-211ENST00000592949 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.87■■■■□ 3.65
ZNF444-211ENST00000592949 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
ZNF444-211ENST00000592949 TOP2BQ02880 1626 aa37.77■■■■□ 3.64
ZNF444-211ENST00000592949 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.73■■■■□ 3.63
ZNF444-211ENST00000592949 SOGA1O94964 1423 aa37.65■■■■□ 3.62
ZNF444-211ENST00000592949 CUX1P39880 1505 aa37.62■■■■□ 3.61
ZNF444-211ENST00000592949 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.61■■■■□ 3.61
ZNF444-211ENST00000592949 EEA1Q15075 1411 aa37.6■■■■□ 3.61
ZNF444-211ENST00000592949 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.54■■■■□ 3.6
ZNF444-211ENST00000592949 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.53■■■■□ 3.6
ZNF444-211ENST00000592949 NESP48681 1621 aa37.52■■■■□ 3.6
ZNF444-211ENST00000592949 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.47■■■■□ 3.59
ZNF444-211ENST00000592949 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.34■■■■□ 3.57
ZNF444-211ENST00000592949 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.2■■■■□ 3.55
ZNF444-211ENST00000592949 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.19■■■■□ 3.54
ZNF444-211ENST00000592949 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.19■■■■□ 3.54
ZNF444-211ENST00000592949 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.19■■■■□ 3.54
ZNF444-211ENST00000592949 KIF21BO75037 1637 aa37.14■■■■□ 3.54
ZNF444-211ENST00000592949 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.13■■■■□ 3.54
ZNF444-211ENST00000592949 TOPBP1Q92547 1522 aa37.11■■■■□ 3.53
ZNF444-211ENST00000592949 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.09■■■■□ 3.53
ZNF444-211ENST00000592949 GOLGA3Q08378 1498 aa37.08■■■■□ 3.53
ZNF444-211ENST00000592949 KIF27Q86VH2 1401 aa37.04■■■■□ 3.52
ZNF444-211ENST00000592949 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
ZNF444-211ENST00000592949 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.02■■■■□ 3.52
ZNF444-211ENST00000592949 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
ZNF444-211ENST00000592949 PRXQ9BXM0 1461 aa36.92■■■■□ 3.5
ZNF444-211ENST00000592949 CUX2O14529 1486 aa36.91■■■■□ 3.5
ZNF444-211ENST00000592949 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.88■■■■□ 3.49
ZNF444-211ENST00000592949 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.85■■■■□ 3.49
ZNF444-211ENST00000592949 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.84■■■■□ 3.49
ZNF444-211ENST00000592949 CEP162Q5TB80 1403 aa36.82■■■■□ 3.48
ZNF444-211ENST00000592949 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.82■■■■□ 3.48
ZNF444-211ENST00000592949 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
ZNF444-211ENST00000592949 WDR97A6NE52 1622 aa36.76■■■■□ 3.47
ZNF444-211ENST00000592949 IGF1RP08069 1367 aa36.74■■■■□ 3.47
ZNF444-211ENST00000592949 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.73■■■■□ 3.47
ZNF444-211ENST00000592949 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
ZNF444-211ENST00000592949 WDR62O43379 1518 aa36.57■■■■□ 3.44
ZNF444-211ENST00000592949 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.55■■■■□ 3.44
ZNF444-211ENST00000592949 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.52■■■■□ 3.44
ZNF444-211ENST00000592949 CLIP1P30622 1438 aa36.48■■■■□ 3.43
ZNF444-211ENST00000592949 ERCC6Q03468 1493 aa36.45■■■■□ 3.43
ZNF444-211ENST00000592949 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
ZNF444-211ENST00000592949 CUL7Q14999 1698 aa36.44■■■■□ 3.42
ZNF444-211ENST00000592949 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
ZNF444-211ENST00000592949 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.4■■■■□ 3.42
ZNF444-211ENST00000592949 IFT140Q96RY7 1462 aa36.31■■■■□ 3.4
ZNF444-211ENST00000592949 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.28■■■■□ 3.4
ZNF444-211ENST00000592949 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
ZNF444-211ENST00000592949 PBRM1Q86U86 1689 aa36.22■■■■□ 3.39
ZNF444-211ENST00000592949 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.21■■■■□ 3.39
ZNF444-211ENST00000592949 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.387e-7■■■■□ 22.1
ZNF444-211ENST00000592949 ARAP1Q96P48 1450 aa36.17■■■■□ 3.38
ZNF444-211ENST00000592949 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
ZNF444-211ENST00000592949 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.12■■■■□ 3.37
ZNF444-211ENST00000592949 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
ZNF444-211ENST00000592949 GRIN2BQ13224 1484 aa36.09■■■■□ 3.37
ZNF444-211ENST00000592949 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.08■■■■□ 3.37
ZNF444-211ENST00000592949 ADAMTS12P58397 1594 aa36.04■■■■□ 3.36
ZNF444-211ENST00000592949 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms