RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554894.5

LINC01578-204, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC01578, Length 556 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-204ENST00000554894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.79■■■■■ 8.76
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LINC01578-204ENST00000554894 SCRIBQ14160 1630 aa56.88■■■■■ 6.7
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LINC01578-204ENST00000554894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.64■■■■■ 6.5
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LINC01578-204ENST00000554894 SMARCA2P51531 1590 aa54.03■■■■■ 6.24
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LINC01578-204ENST00000554894 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.76■■■■■ 6.2
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LINC01578-204ENST00000554894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.52■■■■■ 6
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LINC01578-204ENST00000554894 MRC2Q9UBG0 1479 aa52■■■■■ 5.92
LINC01578-204ENST00000554894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.97■■■■■ 5.91
LINC01578-204ENST00000554894 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.97■■■■■ 5.91
LINC01578-204ENST00000554894 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.94■■■■■ 5.91
LINC01578-204ENST00000554894 WDR62O43379 1518 aa51.88■■■■■ 5.9
LINC01578-204ENST00000554894 PRDM2Q13029 1718 aa51.82■■■■■ 5.89
LINC01578-204ENST00000554894 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.63■■■■■ 5.86
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LINC01578-204ENST00000554894 WDR97A6NE52 1622 aa50.14■■■■■ 5.62
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LINC01578-204ENST00000554894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.97■■■■■ 5.59
LINC01578-204ENST00000554894 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.94■■■■■ 5.58
LINC01578-204ENST00000554894 TOP2BQ02880 1626 aa49.93■■■■■ 5.58
LINC01578-204ENST00000554894 SYNJ1O43426 1573 aa49.92■■■■■ 5.58
LINC01578-204ENST00000554894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.91■■■■■ 5.58
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LINC01578-204ENST00000554894 PBRM1Q86U86 1689 aa49.84■■■■■ 5.57
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LINC01578-204ENST00000554894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
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LINC01578-204ENST00000554894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.56■■■■■ 5.52
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LINC01578-204ENST00000554894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.28■■■■■ 5.48
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LINC01578-204ENST00000554894 ARAP1Q96P48 1450 aa49.18■■■■■ 5.46
LINC01578-204ENST00000554894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.17■■■■■ 5.46
LINC01578-204ENST00000554894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.1■■■■■ 5.45
LINC01578-204ENST00000554894 CEP170Q5SW79 1584 aa49.07■■■■■ 5.45
LINC01578-204ENST00000554894 NUP160Q12769 1436 aa49.01■■■■■ 5.44
LINC01578-204ENST00000554894 KIF27Q86VH2 1401 aa48.92■■■■■ 5.42
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LINC01578-204ENST00000554894 SHROOM2Q13796 1616 aa48.77■■■■■ 5.4
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LINC01578-204ENST00000554894 IGF1RP08069 1367 aa48.75■■■■■ 5.39
LINC01578-204ENST00000554894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.67■■■■■ 5.38
LINC01578-204ENST00000554894 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.47■■■■■ 5.35
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