RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554894.5

LINC01578-204, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC01578, Length 556 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-204ENST00000554894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.79■■■■■ 8.76
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LINC01578-204ENST00000554894 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.93■■■■■ 7.02
LINC01578-204ENST00000554894 NACADO15069 1562 aa58.69■■■■■ 6.99
LINC01578-204ENST00000554894 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.46■■■■■ 6.95
LINC01578-204ENST00000554894 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.12■■■■■ 6.9
LINC01578-204ENST00000554894 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.04■■■■■ 6.88
LINC01578-204ENST00000554894 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.7■■■■■ 6.83
LINC01578-204ENST00000554894 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.69■■■■■ 6.83
LINC01578-204ENST00000554894 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.33■■■■■ 6.77
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LINC01578-204ENST00000554894 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.9■■■■■ 6.7
LINC01578-204ENST00000554894 SCRIBQ14160 1630 aa56.88■■■■■ 6.7
LINC01578-204ENST00000554894 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.47■■■■■ 6.63
LINC01578-204ENST00000554894 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.72■■■■■ 6.51
LINC01578-204ENST00000554894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.64■■■■■ 6.5
LINC01578-204ENST00000554894 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.31■■■■■ 6.45
LINC01578-204ENST00000554894 SMARCA4P51532 1647 aa54.33■■■■■ 6.29
LINC01578-204ENST00000554894 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.13■■■■■ 6.26
LINC01578-204ENST00000554894 NCAPD3P42695 1498 aa54.12■■■■■ 6.25
LINC01578-204ENST00000554894 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.1■■■■■ 6.25
LINC01578-204ENST00000554894 SMARCA2P51531 1590 aa54.03■■■■■ 6.24
LINC01578-204ENST00000554894 HMGXB3Q12766 1538 aa53.88■■■■■ 6.22
LINC01578-204ENST00000554894 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.8■■■■■ 6.2
LINC01578-204ENST00000554894 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.76■■■■■ 6.2
LINC01578-204ENST00000554894 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.65■■■■■ 6.18
LINC01578-204ENST00000554894 WIZO95785 1651 aa53.25■■■■■ 6.11
LINC01578-204ENST00000554894 NESP48681 1621 aa53.09■■■■■ 6.09
LINC01578-204ENST00000554894 ERCC6Q03468 1493 aa53.06■■■■■ 6.08
LINC01578-204ENST00000554894 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.93■■■■■ 6.06
LINC01578-204ENST00000554894 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.85■■■■■ 6.05
LINC01578-204ENST00000554894 CUX2O14529 1486 aa52.68■■■■■ 6.02
LINC01578-204ENST00000554894 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.61■■■■■ 6.01
LINC01578-204ENST00000554894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.52■■■■■ 6
LINC01578-204ENST00000554894 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.51■■■■■ 6
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LINC01578-204ENST00000554894 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.45■■■■■ 5.99
LINC01578-204ENST00000554894 CFTRP13569 1480 aa52.12■■■■■ 5.93
LINC01578-204ENST00000554894 MRC2Q9UBG0 1479 aa52■■■■■ 5.92
LINC01578-204ENST00000554894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.97■■■■■ 5.91
LINC01578-204ENST00000554894 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.97■■■■■ 5.91
LINC01578-204ENST00000554894 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.94■■■■■ 5.91
LINC01578-204ENST00000554894 WDR62O43379 1518 aa51.88■■■■■ 5.9
LINC01578-204ENST00000554894 PRDM2Q13029 1718 aa51.82■■■■■ 5.89
LINC01578-204ENST00000554894 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.63■■■■■ 5.86
LINC01578-204ENST00000554894 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.51■■■■■ 5.84
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LINC01578-204ENST00000554894 TOPBP1Q92547 1522 aa51.08■■■■■ 5.77
LINC01578-204ENST00000554894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51■■■■■ 5.75
LINC01578-204ENST00000554894 ABCC8Q09428 1581 aa50.98■■■■■ 5.75
LINC01578-204ENST00000554894 IFT140Q96RY7 1462 aa50.87■■■■■ 5.73
LINC01578-204ENST00000554894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.73■■■■■ 5.71
LINC01578-204ENST00000554894 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.62■■■■■ 5.69
LINC01578-204ENST00000554894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
LINC01578-204ENST00000554894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.57■■■■■ 5.69
LINC01578-204ENST00000554894 CUX1P39880 1505 aa50.52■■■■■ 5.68
LINC01578-204ENST00000554894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.43■■■■■ 5.66
LINC01578-204ENST00000554894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.4■■■■■ 5.66
LINC01578-204ENST00000554894 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.34■■■■■ 5.652e-20■■■■□ 22
LINC01578-204ENST00000554894 SOGA1O94964 1423 aa50.34■■■■■ 5.65
LINC01578-204ENST00000554894 OSCARQ8IYS5 282 aa50.3■■■■■ 5.64
LINC01578-204ENST00000554894 WDR97A6NE52 1622 aa50.14■■■■■ 5.62
LINC01578-204ENST00000554894 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.14■■■■■ 5.62
LINC01578-204ENST00000554894 CHD1O14646 1710 aa50.07■■■■■ 5.61
LINC01578-204ENST00000554894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.97■■■■■ 5.59
LINC01578-204ENST00000554894 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.94■■■■■ 5.58
LINC01578-204ENST00000554894 TOP2BQ02880 1626 aa49.93■■■■■ 5.58
LINC01578-204ENST00000554894 SYNJ1O43426 1573 aa49.92■■■■■ 5.58
LINC01578-204ENST00000554894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.91■■■■■ 5.58
LINC01578-204ENST00000554894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.88■■■■■ 5.58
LINC01578-204ENST00000554894 GRIN2BQ13224 1484 aa49.85■■■■■ 5.57
LINC01578-204ENST00000554894 PBRM1Q86U86 1689 aa49.84■■■■■ 5.57
LINC01578-204ENST00000554894 FBLN2P98095 1184 aa49.81■■■■■ 5.56
LINC01578-204ENST00000554894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.8■■■■■ 5.56
LINC01578-204ENST00000554894 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.78■■■■■ 5.56
LINC01578-204ENST00000554894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.78■■■■■ 5.56
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LINC01578-204ENST00000554894 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
LINC01578-204ENST00000554894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.73■■■■■ 5.55
LINC01578-204ENST00000554894 ARHGEF11O15085 1522 aa49.62■■■■■ 5.53
LINC01578-204ENST00000554894 SYNJ2O15056 1496 aa49.6■■■■■ 5.53
LINC01578-204ENST00000554894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.56■■■■■ 5.52
LINC01578-204ENST00000554894 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.45■■■■■ 5.51
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LINC01578-204ENST00000554894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.28■■■■■ 5.48
LINC01578-204ENST00000554894 GRIN2AQ12879 1464 aa49.23■■■■■ 5.47
LINC01578-204ENST00000554894 ARAP1Q96P48 1450 aa49.18■■■■■ 5.46
LINC01578-204ENST00000554894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.17■■■■■ 5.46
LINC01578-204ENST00000554894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.1■■■■■ 5.45
LINC01578-204ENST00000554894 CEP170Q5SW79 1584 aa49.07■■■■■ 5.45
LINC01578-204ENST00000554894 NUP160Q12769 1436 aa49.01■■■■■ 5.44
LINC01578-204ENST00000554894 KIF27Q86VH2 1401 aa48.92■■■■■ 5.42
LINC01578-204ENST00000554894 CUL7Q14999 1698 aa48.78■■■■■ 5.4
LINC01578-204ENST00000554894 SHROOM2Q13796 1616 aa48.77■■■■■ 5.4
LINC01578-204ENST00000554894 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.75■■■■■ 5.39
LINC01578-204ENST00000554894 IGF1RP08069 1367 aa48.75■■■■■ 5.39
LINC01578-204ENST00000554894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.67■■■■■ 5.38
LINC01578-204ENST00000554894 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.47■■■■■ 5.35
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