RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.37■■■■■ 4.69
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.4■■■■□ 3.9
PTPRN2-204ENST00000404321 ABCC9O60706 1549 aa39■■■■□ 3.83
PTPRN2-204ENST00000404321 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.37■■■■□ 3.57
PTPRN2-204ENST00000404321 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.28■■■■□ 3.56
PTPRN2-204ENST00000404321 NACADO15069 1562 aa37.16■■■■□ 3.54
PTPRN2-204ENST00000404321 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PTPRN2-204ENST00000404321 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.81■■■■□ 3.48
PTPRN2-204ENST00000404321 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.6■■■■□ 3.45
PTPRN2-204ENST00000404321 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.48■■■■□ 3.43
PTPRN2-204ENST00000404321 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.36■■■■□ 3.41
PTPRN2-204ENST00000404321 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.18■■■■□ 3.38
PTPRN2-204ENST00000404321 SCRIBQ14160 1630 aa36.12■■■■□ 3.37
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPRN2-204ENST00000404321 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
PTPRN2-204ENST00000404321 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.18■■■■□ 3.22
PTPRN2-204ENST00000404321 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.03■■■■□ 3.2
PTPRN2-204ENST00000404321 SMARCA4P51532 1647 aa34.45■■■■□ 3.11
PTPRN2-204ENST00000404321 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.36■■■■□ 3.09
PTPRN2-204ENST00000404321 NCAPD3P42695 1498 aa34.34■■■■□ 3.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SMARCA2P51531 1590 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPRN2-204ENST00000404321 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.24■■■■□ 3.07
PTPRN2-204ENST00000404321 HMGXB3Q12766 1538 aa34.1■■■■□ 3.05
PTPRN2-204ENST00000404321 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
PTPRN2-204ENST00000404321 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.06■■■■□ 3.04
PTPRN2-204ENST00000404321 WIZO95785 1651 aa33.83■■■■□ 3.01
PTPRN2-204ENST00000404321 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
PTPRN2-204ENST00000404321 NESP48681 1621 aa33.69■■■□□ 2.98
PTPRN2-204ENST00000404321 ERCC6Q03468 1493 aa33.61■■■□□ 2.97
PTPRN2-204ENST00000404321 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
PTPRN2-204ENST00000404321 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.42■■■□□ 2.94
PTPRN2-204ENST00000404321 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.37■■■□□ 2.93
PTPRN2-204ENST00000404321 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.27■■■□□ 2.92
PTPRN2-204ENST00000404321 CUX2O14529 1486 aa33.22■■■□□ 2.91
PTPRN2-204ENST00000404321 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.15■■■□□ 2.9
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.1■■■□□ 2.89
PTPRN2-204ENST00000404321 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
PTPRN2-204ENST00000404321 CFTRP13569 1480 aa33.1■■■□□ 2.89
PTPRN2-204ENST00000404321 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33■■■□□ 2.87
PTPRN2-204ENST00000404321 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.96■■■□□ 2.87
PTPRN2-204ENST00000404321 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.95■■■□□ 2.87
PTPRN2-204ENST00000404321 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
PTPRN2-204ENST00000404321 WDR62O43379 1518 aa32.81■■■□□ 2.84
PTPRN2-204ENST00000404321 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
PTPRN2-204ENST00000404321 PRDM2Q13029 1718 aa32.67■■■□□ 2.82
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.55■■■□□ 2.8
PTPRN2-204ENST00000404321 TOPBP1Q92547 1522 aa32.44■■■□□ 2.78
PTPRN2-204ENST00000404321 ABCC8Q09428 1581 aa32.33■■■□□ 2.77
PTPRN2-204ENST00000404321 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.33■■■□□ 2.77
PTPRN2-204ENST00000404321 IFT140Q96RY7 1462 aa32.26■■■□□ 2.76
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
PTPRN2-204ENST00000404321 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
PTPRN2-204ENST00000404321 CUX1P39880 1505 aa32.13■■■□□ 2.73
PTPRN2-204ENST00000404321 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.08■■■□□ 2.73
PTPRN2-204ENST00000404321 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.06■■■□□ 2.72
PTPRN2-204ENST00000404321 SOGA1O94964 1423 aa32.04■■■□□ 2.72
PTPRN2-204ENST00000404321 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
PTPRN2-204ENST00000404321 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.01■■■□□ 2.725e-8■■□□□ 14.1
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
PTPRN2-204ENST00000404321 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
PTPRN2-204ENST00000404321 OSCARQ8IYS5 282 aa31.9■■■□□ 2.7
PTPRN2-204ENST00000404321 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
PTPRN2-204ENST00000404321 SYNJ1O43426 1573 aa31.77■■■□□ 2.68
PTPRN2-204ENST00000404321 FBLN2P98095 1184 aa31.75■■■□□ 2.67
PTPRN2-204ENST00000404321 TOP2BQ02880 1626 aa31.73■■■□□ 2.67
PTPRN2-204ENST00000404321 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.69■■■□□ 2.66
PTPRN2-204ENST00000404321 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.68■■■□□ 2.66
PTPRN2-204ENST00000404321 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.68■■■□□ 2.66
PTPRN2-204ENST00000404321 WDR97A6NE52 1622 aa31.68■■■□□ 2.66
PTPRN2-204ENST00000404321 GRIN2BQ13224 1484 aa31.65■■■□□ 2.66
PTPRN2-204ENST00000404321 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.64■■■□□ 2.66
PTPRN2-204ENST00000404321 CHD1O14646 1710 aa31.6■■■□□ 2.65
PTPRN2-204ENST00000404321 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
PTPRN2-204ENST00000404321 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
PTPRN2-204ENST00000404321 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.55■■■□□ 2.64
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM41Q8WV44 630 aa31.51■■■□□ 2.63
PTPRN2-204ENST00000404321 PBRM1Q86U86 1689 aa31.5■■■□□ 2.63
PTPRN2-204ENST00000404321 SYNJ2O15056 1496 aa31.47■■■□□ 2.63
PTPRN2-204ENST00000404321 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRN2-204ENST00000404321 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRN2-204ENST00000404321 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGEF11O15085 1522 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRN2-204ENST00000404321 ADAMTS12P58397 1594 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRN2-204ENST00000404321 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRN2-204ENST00000404321 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRN2-204ENST00000404321 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.26■■■□□ 2.6
PTPRN2-204ENST00000404321 GRIN2AQ12879 1464 aa31.25■■■□□ 2.59
PTPRN2-204ENST00000404321 KIF27Q86VH2 1401 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRN2-204ENST00000404321 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRN2-204ENST00000404321 IGF1RP08069 1367 aa31.12■■■□□ 2.57
PTPRN2-204ENST00000404321 ARAP1Q96P48 1450 aa31.12■■■□□ 2.57
PTPRN2-204ENST00000404321 CEP170Q5SW79 1584 aa31.11■■■□□ 2.57
PTPRN2-204ENST00000404321 NUP160Q12769 1436 aa31.1■■■□□ 2.57
PTPRN2-204ENST00000404321 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.93■■■□□ 2.54
PTPRN2-204ENST00000404321 CUL7Q14999 1698 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRN2-204ENST00000404321 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRN2-204ENST00000404321 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRN2-204ENST00000404321 JPH4Q96JJ6 628 aa30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms