RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587467.5

ZNF444-205, Transcript of zinc finger protein 444, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF444, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444-205ENST00000587467 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.77■■■■■ 6.52
ZNF444-205ENST00000587467 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.09■■■■■ 5.61
ZNF444-205ENST00000587467 ABCC9O60706 1549 aa50.05■■■■■ 5.6
ZNF444-205ENST00000587467 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.67■■■■■ 5.22
ZNF444-205ENST00000587467 NACADO15069 1562 aa47.35■■■■■ 5.17
ZNF444-205ENST00000587467 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.96■■■■■ 5.11
ZNF444-205ENST00000587467 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.94■■■■■ 5.1
ZNF444-205ENST00000587467 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.72■■■■■ 5.07
ZNF444-205ENST00000587467 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.59■■■■■ 5.05
ZNF444-205ENST00000587467 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.56■■■■■ 5.04
ZNF444-205ENST00000587467 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.3■■■■■ 5
ZNF444-205ENST00000587467 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
ZNF444-205ENST00000587467 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.11■■■■■ 4.97
ZNF444-205ENST00000587467 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.72■■■■■ 4.91
ZNF444-205ENST00000587467 SCRIBQ14160 1630 aa45.6■■■■■ 4.89
ZNF444-205ENST00000587467 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.24■■■■■ 4.83
ZNF444-205ENST00000587467 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
ZNF444-205ENST00000587467 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.1■■■■■ 4.81
ZNF444-205ENST00000587467 NCAPD3P42695 1498 aa43.7■■■■■ 4.59
ZNF444-205ENST00000587467 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.57■■■■■ 4.56
ZNF444-205ENST00000587467 SMARCA4P51532 1647 aa43.52■■■■■ 4.56
ZNF444-205ENST00000587467 SMARCA2P51531 1590 aa43.46■■■■■ 4.55
ZNF444-205ENST00000587467 HMGXB3Q12766 1538 aa43.41■■■■■ 4.54
ZNF444-205ENST00000587467 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
ZNF444-205ENST00000587467 ERCC6Q03468 1493 aa43.23■■■■■ 4.51
ZNF444-205ENST00000587467 CUX2O14529 1486 aa43.2■■■■■ 4.51
ZNF444-205ENST00000587467 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.14■■■■■ 4.5
ZNF444-205ENST00000587467 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
ZNF444-205ENST00000587467 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.12■■■■■ 4.49
ZNF444-205ENST00000587467 NESP48681 1621 aa43■■■■■ 4.47
ZNF444-205ENST00000587467 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.97■■■■■ 4.47
ZNF444-205ENST00000587467 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.73■■■■■ 4.43
ZNF444-205ENST00000587467 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
ZNF444-205ENST00000587467 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.47■■■■■ 4.39
ZNF444-205ENST00000587467 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.46■■■■■ 4.39
ZNF444-205ENST00000587467 WIZO95785 1651 aa42.44■■■■■ 4.38
ZNF444-205ENST00000587467 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.36■■■■■ 4.37
ZNF444-205ENST00000587467 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.11■■■■■ 4.33
ZNF444-205ENST00000587467 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
ZNF444-205ENST00000587467 WDR62O43379 1518 aa42.03■■■■■ 4.32
ZNF444-205ENST00000587467 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.94■■■■■ 4.3
ZNF444-205ENST00000587467 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
ZNF444-205ENST00000587467 CFTRP13569 1480 aa41.89■■■■■ 4.3
ZNF444-205ENST00000587467 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.89■■■■■ 4.3
ZNF444-205ENST00000587467 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
ZNF444-205ENST00000587467 PRDM2Q13029 1718 aa41.49■■■■■ 4.23
ZNF444-205ENST00000587467 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.42■■■■■ 4.22
ZNF444-205ENST00000587467 TRIM41Q8WV44 630 aa41.2■■■■■ 4.19
ZNF444-205ENST00000587467 OSCARQ8IYS5 282 aa41.15■■■■■ 4.18
ZNF444-205ENST00000587467 IFT140Q96RY7 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
ZNF444-205ENST00000587467 TOPBP1Q92547 1522 aa41.09■■■■■ 4.17
ZNF444-205ENST00000587467 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
ZNF444-205ENST00000587467 ABCC8Q09428 1581 aa41■■■■■ 4.15
ZNF444-205ENST00000587467 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.95■■■■■ 4.15
ZNF444-205ENST00000587467 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
ZNF444-205ENST00000587467 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
ZNF444-205ENST00000587467 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
ZNF444-205ENST00000587467 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
ZNF444-205ENST00000587467 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
ZNF444-205ENST00000587467 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
ZNF444-205ENST00000587467 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.64■■■■■ 4.11e-6■■■■□ 23.4
ZNF444-205ENST00000587467 ARHGEF11O15085 1522 aa40.55■■■■■ 4.08
ZNF444-205ENST00000587467 CHD1O14646 1710 aa40.51■■■■■ 4.08
ZNF444-205ENST00000587467 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.5■■■■■ 4.07
ZNF444-205ENST00000587467 SOGA1O94964 1423 aa40.45■■■■■ 4.07
ZNF444-205ENST00000587467 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.4■■■■■ 4.06
ZNF444-205ENST00000587467 CUX1P39880 1505 aa40.38■■■■■ 4.06
ZNF444-205ENST00000587467 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
ZNF444-205ENST00000587467 WDR97A6NE52 1622 aa40.36■■■■■ 4.05
ZNF444-205ENST00000587467 FBLN2P98095 1184 aa40.32■■■■■ 4.05
ZNF444-205ENST00000587467 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.25■■■■■ 4.03
ZNF444-205ENST00000587467 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.17■■■■■ 4.02
ZNF444-205ENST00000587467 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
ZNF444-205ENST00000587467 ARAP1Q96P48 1450 aa40.15■■■■■ 4.02
ZNF444-205ENST00000587467 GRIN2BQ13224 1484 aa40.13■■■■■ 4.02
ZNF444-205ENST00000587467 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
ZNF444-205ENST00000587467 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.07■■■■■ 4.01
ZNF444-205ENST00000587467 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
ZNF444-205ENST00000587467 SYNJ1O43426 1573 aa40.03■■■■■ 4
ZNF444-205ENST00000587467 SYNJ2O15056 1496 aa40.01■■■■■ 4
ZNF444-205ENST00000587467 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.99■■■■□ 3.99
ZNF444-205ENST00000587467 PBRM1Q86U86 1689 aa39.99■■■■□ 3.99
ZNF444-205ENST00000587467 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.97■■■■□ 3.99
ZNF444-205ENST00000587467 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.92■■■■□ 3.98
ZNF444-205ENST00000587467 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.78■■■■□ 3.96
ZNF444-205ENST00000587467 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.74■■■■□ 3.95
ZNF444-205ENST00000587467 TOP2BQ02880 1626 aa39.73■■■■□ 3.95
ZNF444-205ENST00000587467 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
ZNF444-205ENST00000587467 GRIN2AQ12879 1464 aa39.63■■■■□ 3.94
ZNF444-205ENST00000587467 ADAMTS12P58397 1594 aa39.63■■■■□ 3.93
ZNF444-205ENST00000587467 NUP160Q12769 1436 aa39.51■■■■□ 3.92
ZNF444-205ENST00000587467 CEP170Q5SW79 1584 aa39.49■■■■□ 3.91
ZNF444-205ENST00000587467 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.48■■■■□ 3.91
ZNF444-205ENST00000587467 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.47■■■■□ 3.91
ZNF444-205ENST00000587467 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.42■■■■□ 3.9
ZNF444-205ENST00000587467 SHROOM2Q13796 1616 aa39.34■■■■□ 3.89
ZNF444-205ENST00000587467 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
ZNF444-205ENST00000587467 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.06■■■■□ 3.84
ZNF444-205ENST00000587467 JPH4Q96JJ6 628 aa39.04■■■■□ 3.84
ZNF444-205ENST00000587467 KIF27Q86VH2 1401 aa38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms