Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC3A1Q07837 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC3A1Q07837 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC3A1Q07837 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms