RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617642.1

PIK3R2-208, Transcript of phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PIK3R2, Length 1,446 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R2-208ENST00000617642 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.63■■■■■ 7.62
PIK3R2-208ENST00000617642 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.28■■■■■ 6.44
PIK3R2-208ENST00000617642 ABCC9O60706 1549 aa53.23■■■■■ 6.11
PIK3R2-208ENST00000617642 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.36■■■■■ 5.97
PIK3R2-208ENST00000617642 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.03■■■■■ 5.92
PIK3R2-208ENST00000617642 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.84■■■■■ 5.89
PIK3R2-208ENST00000617642 NACADO15069 1562 aa51.75■■■■■ 5.88
PIK3R2-208ENST00000617642 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.71■■■■■ 5.87
PIK3R2-208ENST00000617642 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.61■■■■■ 5.85
PIK3R2-208ENST00000617642 SCRIBQ14160 1630 aa50.55■■■■■ 5.68
PIK3R2-208ENST00000617642 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.46■■■■■ 5.67
PIK3R2-208ENST00000617642 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.09■■■■■ 5.61
PIK3R2-208ENST00000617642 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.98■■■■■ 5.59
PIK3R2-208ENST00000617642 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.9■■■■■ 5.58
PIK3R2-208ENST00000617642 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.69■■■■■ 5.38
PIK3R2-208ENST00000617642 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.61■■■■■ 5.37
PIK3R2-208ENST00000617642 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.49■■■■■ 5.35
PIK3R2-208ENST00000617642 SMARCA4P51532 1647 aa48.42■■■■■ 5.34
PIK3R2-208ENST00000617642 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.28■■■■■ 5.32
PIK3R2-208ENST00000617642 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.19■■■■■ 5.31
PIK3R2-208ENST00000617642 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.06■■■■■ 5.28
PIK3R2-208ENST00000617642 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.98■■■■■ 5.27
PIK3R2-208ENST00000617642 SMARCA2P51531 1590 aa47.91■■■■■ 5.26
PIK3R2-208ENST00000617642 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.91■■■■■ 5.26
PIK3R2-208ENST00000617642 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.9■■■■■ 5.26
PIK3R2-208ENST00000617642 WIZO95785 1651 aa47.84■■■■■ 5.25
PIK3R2-208ENST00000617642 NCAPD3P42695 1498 aa47.73■■■■■ 5.23
PIK3R2-208ENST00000617642 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
PIK3R2-208ENST00000617642 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
PIK3R2-208ENST00000617642 HMGXB3Q12766 1538 aa47.59■■■■■ 5.21
PIK3R2-208ENST00000617642 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
PIK3R2-208ENST00000617642 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.81■■■■■ 5.08
PIK3R2-208ENST00000617642 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.4■■■■■ 5.02
PIK3R2-208ENST00000617642 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.35■■■■■ 5.01
PIK3R2-208ENST00000617642 NESP48681 1621 aa46.33■■■■■ 5.01
PIK3R2-208ENST00000617642 CFTRP13569 1480 aa46.31■■■■■ 5
PIK3R2-208ENST00000617642 PRDM2Q13029 1718 aa46.09■■■■■ 4.97
PIK3R2-208ENST00000617642 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.02■■■■■ 4.96
PIK3R2-208ENST00000617642 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.89■■■■■ 4.94
PIK3R2-208ENST00000617642 ERCC6Q03468 1493 aa45.83■■■■■ 4.93
PIK3R2-208ENST00000617642 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.83■■■■■ 4.93
PIK3R2-208ENST00000617642 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.76■■■■■ 4.92
PIK3R2-208ENST00000617642 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.48■■■■■ 4.87
PIK3R2-208ENST00000617642 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
PIK3R2-208ENST00000617642 ABCC8Q09428 1581 aa45.4■■■■■ 4.86
PIK3R2-208ENST00000617642 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
PIK3R2-208ENST00000617642 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.32■■■■■ 4.85
PIK3R2-208ENST00000617642 WDR62O43379 1518 aa45.29■■■■■ 4.84
PIK3R2-208ENST00000617642 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.28■■■■■ 4.84
PIK3R2-208ENST00000617642 TOPBP1Q92547 1522 aa45.26■■■■■ 4.84
PIK3R2-208ENST00000617642 CUX1P39880 1505 aa45.25■■■■■ 4.83
PIK3R2-208ENST00000617642 SYNJ1O43426 1573 aa45.15■■■■■ 4.82
PIK3R2-208ENST00000617642 TOP2BQ02880 1626 aa45.11■■■■■ 4.81
PIK3R2-208ENST00000617642 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.1■■■■■ 4.81
PIK3R2-208ENST00000617642 CUX2O14529 1486 aa44.97■■■■■ 4.79
PIK3R2-208ENST00000617642 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.97■■■■■ 4.79
PIK3R2-208ENST00000617642 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.93■■■■■ 4.78
PIK3R2-208ENST00000617642 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
PIK3R2-208ENST00000617642 TRIM41Q8WV44 630 aa44.92■■■■■ 4.78
PIK3R2-208ENST00000617642 SOGA1O94964 1423 aa44.78■■■■■ 4.76
PIK3R2-208ENST00000617642 IFT140Q96RY7 1462 aa44.74■■■■■ 4.75
PIK3R2-208ENST00000617642 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.73■■■■■ 4.75
PIK3R2-208ENST00000617642 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
PIK3R2-208ENST00000617642 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.56■■■■■ 4.72
PIK3R2-208ENST00000617642 WDR97A6NE52 1622 aa44.54■■■■■ 4.72
PIK3R2-208ENST00000617642 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
PIK3R2-208ENST00000617642 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
PIK3R2-208ENST00000617642 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
PIK3R2-208ENST00000617642 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.33■■■■■ 4.695e-7■■■■□ 22.1
PIK3R2-208ENST00000617642 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.3■■■■■ 4.68
PIK3R2-208ENST00000617642 KIF27Q86VH2 1401 aa44.3■■■■■ 4.68
PIK3R2-208ENST00000617642 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.27■■■■■ 4.68
PIK3R2-208ENST00000617642 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.17■■■■■ 4.66
PIK3R2-208ENST00000617642 PBRM1Q86U86 1689 aa44.15■■■■■ 4.66
PIK3R2-208ENST00000617642 GRIN2BQ13224 1484 aa44.14■■■■■ 4.66
PIK3R2-208ENST00000617642 EEA1Q15075 1411 aa44.07■■■■■ 4.65
PIK3R2-208ENST00000617642 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.05■■■■■ 4.64
PIK3R2-208ENST00000617642 IGF1RP08069 1367 aa43.98■■■■■ 4.63
PIK3R2-208ENST00000617642 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
PIK3R2-208ENST00000617642 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.95■■■■■ 4.63
PIK3R2-208ENST00000617642 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
PIK3R2-208ENST00000617642 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.88■■■■■ 4.61
PIK3R2-208ENST00000617642 CUL7Q14999 1698 aa43.85■■■■■ 4.61
PIK3R2-208ENST00000617642 ADAMTS12P58397 1594 aa43.83■■■■■ 4.61
PIK3R2-208ENST00000617642 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.79■■■■■ 4.6
PIK3R2-208ENST00000617642 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.77■■■■■ 4.6
PIK3R2-208ENST00000617642 SYNJ2O15056 1496 aa43.74■■■■■ 4.59
PIK3R2-208ENST00000617642 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
PIK3R2-208ENST00000617642 FBLN2P98095 1184 aa43.67■■■■■ 4.58
PIK3R2-208ENST00000617642 PRXQ9BXM0 1461 aa43.66■■■■■ 4.58
PIK3R2-208ENST00000617642 CHD1O14646 1710 aa43.63■■■■■ 4.57
PIK3R2-208ENST00000617642 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.61■■■■■ 4.57
PIK3R2-208ENST00000617642 GRIN2AQ12879 1464 aa43.57■■■■■ 4.56
PIK3R2-208ENST00000617642 KIF21BO75037 1637 aa43.54■■■■■ 4.56
PIK3R2-208ENST00000617642 GOLGA3Q08378 1498 aa43.37■■■■■ 4.53
PIK3R2-208ENST00000617642 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.36■■■■■ 4.53
PIK3R2-208ENST00000617642 NUP160Q12769 1436 aa43.32■■■■■ 4.53
PIK3R2-208ENST00000617642 CEP170Q5SW79 1584 aa43.31■■■■■ 4.52
PIK3R2-208ENST00000617642 OSCARQ8IYS5 282 aa43.31■■■■■ 4.52
PIK3R2-208ENST00000617642 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms