RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405636.6

TOMM40-202, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-202ENST00000405636 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.13■■■■■ 7.38
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TOMM40-202ENST00000405636 NACADO15069 1562 aa50.21■■■■■ 5.63
TOMM40-202ENST00000405636 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.18■■■■■ 5.62
TOMM40-202ENST00000405636 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.02■■■■■ 5.6
TOMM40-202ENST00000405636 SCRIBQ14160 1630 aa49.38■■■■■ 5.49
TOMM40-202ENST00000405636 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.35■■■■■ 5.49
TOMM40-202ENST00000405636 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.09■■■■■ 5.45
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TOMM40-202ENST00000405636 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
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TOMM40-202ENST00000405636 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.63■■■■■ 5.05
TOMM40-202ENST00000405636 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.62■■■■■ 5.05
TOMM40-202ENST00000405636 SMARCA2P51531 1590 aa46.55■■■■■ 5.04
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TOMM40-202ENST00000405636 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.92■■■■■ 4.78
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TOMM40-202ENST00000405636 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.63■■■■■ 4.74
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TOMM40-202ENST00000405636 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.57■■■■■ 4.73
TOMM40-202ENST00000405636 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.57■■■■■ 4.72
TOMM40-202ENST00000405636 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.46■■■■■ 4.71
TOMM40-202ENST00000405636 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.44■■■■■ 4.7
TOMM40-202ENST00000405636 ERCC6Q03468 1493 aa44.34■■■■■ 4.69
TOMM40-202ENST00000405636 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.34■■■■■ 4.69
TOMM40-202ENST00000405636 SYNJ1O43426 1573 aa44.27■■■■■ 4.68
TOMM40-202ENST00000405636 CUX1P39880 1505 aa44.24■■■■■ 4.67
TOMM40-202ENST00000405636 TRIM41Q8WV44 630 aa44.17■■■■■ 4.66
TOMM40-202ENST00000405636 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
TOMM40-202ENST00000405636 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.11■■■■■ 4.65
TOMM40-202ENST00000405636 TOP2BQ02880 1626 aa44.1■■■■■ 4.65
TOMM40-202ENST00000405636 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.08■■■■■ 4.65
TOMM40-202ENST00000405636 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.08■■■■■ 4.65
TOMM40-202ENST00000405636 TOPBP1Q92547 1522 aa44.07■■■■■ 4.64
TOMM40-202ENST00000405636 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
TOMM40-202ENST00000405636 WDR62O43379 1518 aa43.92■■■■■ 4.62
TOMM40-202ENST00000405636 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.88■■■■■ 4.62
TOMM40-202ENST00000405636 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
TOMM40-202ENST00000405636 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.67■■■■■ 4.58
TOMM40-202ENST00000405636 CUX2O14529 1486 aa43.61■■■■■ 4.57
TOMM40-202ENST00000405636 SOGA1O94964 1423 aa43.59■■■■■ 4.57
TOMM40-202ENST00000405636 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
TOMM40-202ENST00000405636 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.47■■■■■ 4.55
TOMM40-202ENST00000405636 WDR97A6NE52 1622 aa43.44■■■■■ 4.55
TOMM40-202ENST00000405636 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.42■■■■■ 4.54
TOMM40-202ENST00000405636 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
TOMM40-202ENST00000405636 IFT140Q96RY7 1462 aa43.4■■■■■ 4.54
TOMM40-202ENST00000405636 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
TOMM40-202ENST00000405636 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
TOMM40-202ENST00000405636 KIF27Q86VH2 1401 aa43.26■■■■■ 4.52
TOMM40-202ENST00000405636 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.2■■■■■ 4.51
TOMM40-202ENST00000405636 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.18■■■■■ 4.51e-6■■■■□ 26.4
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TOMM40-202ENST00000405636 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.11■■■■■ 4.49
TOMM40-202ENST00000405636 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.04■■■■■ 4.48
TOMM40-202ENST00000405636 PBRM1Q86U86 1689 aa43.01■■■■■ 4.48
TOMM40-202ENST00000405636 IGF1RP08069 1367 aa42.99■■■■■ 4.47
TOMM40-202ENST00000405636 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.92■■■■■ 4.46
TOMM40-202ENST00000405636 GRIN2BQ13224 1484 aa42.9■■■■■ 4.46
TOMM40-202ENST00000405636 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.89■■■■■ 4.46
TOMM40-202ENST00000405636 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.78■■■■■ 4.44
TOMM40-202ENST00000405636 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.78■■■■■ 4.44
TOMM40-202ENST00000405636 PRXQ9BXM0 1461 aa42.78■■■■■ 4.44
TOMM40-202ENST00000405636 CUL7Q14999 1698 aa42.76■■■■■ 4.44
TOMM40-202ENST00000405636 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.75■■■■■ 4.43
TOMM40-202ENST00000405636 KIF21BO75037 1637 aa42.74■■■■■ 4.43
TOMM40-202ENST00000405636 ADAMTS12P58397 1594 aa42.71■■■■■ 4.43
TOMM40-202ENST00000405636 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.7■■■■■ 4.43
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TOMM40-202ENST00000405636 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.6■■■■■ 4.41
TOMM40-202ENST00000405636 GOLGA3Q08378 1498 aa42.59■■■■■ 4.41
TOMM40-202ENST00000405636 SYNJ2O15056 1496 aa42.49■■■■■ 4.39
TOMM40-202ENST00000405636 FBLN2P98095 1184 aa42.46■■■■■ 4.39
TOMM40-202ENST00000405636 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
TOMM40-202ENST00000405636 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
TOMM40-202ENST00000405636 GRIN2AQ12879 1464 aa42.39■■■■■ 4.38
TOMM40-202ENST00000405636 CHD1O14646 1710 aa42.39■■■■■ 4.38
TOMM40-202ENST00000405636 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.25■■■■■ 4.35
TOMM40-202ENST00000405636 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.21■■■■■ 4.35
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