RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319242.7

GFRA4-202, Transcript of GDNF family receptor alpha 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA4, Length 900 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4-202ENST00000319242 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.29■■■■■ 8.04
GFRA4-202ENST00000319242 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.06■■■■■ 6.89
GFRA4-202ENST00000319242 ABCC9O60706 1549 aa57.13■■■■■ 6.74
GFRA4-202ENST00000319242 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.8■■■■■ 6.36
GFRA4-202ENST00000319242 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.76■■■■■ 6.36
GFRA4-202ENST00000319242 NACADO15069 1562 aa54.7■■■■■ 6.35
GFRA4-202ENST00000319242 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.32■■■■■ 6.29
GFRA4-202ENST00000319242 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.28■■■■■ 6.28
GFRA4-202ENST00000319242 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.98■■■■■ 6.23
GFRA4-202ENST00000319242 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.52■■■■■ 6.16
GFRA4-202ENST00000319242 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.43■■■■■ 6.14
GFRA4-202ENST00000319242 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.41■■■■■ 6.14
GFRA4-202ENST00000319242 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.17■■■■■ 6.1
GFRA4-202ENST00000319242 SCRIBQ14160 1630 aa53.02■■■■■ 6.08
GFRA4-202ENST00000319242 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.54■■■■■ 6
GFRA4-202ENST00000319242 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.78■■■■■ 5.88
GFRA4-202ENST00000319242 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.63■■■■■ 5.86
GFRA4-202ENST00000319242 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.35■■■■■ 5.81
GFRA4-202ENST00000319242 SMARCA4P51532 1647 aa50.68■■■■■ 5.7
GFRA4-202ENST00000319242 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.6■■■■■ 5.69
GFRA4-202ENST00000319242 NCAPD3P42695 1498 aa50.51■■■■■ 5.68
GFRA4-202ENST00000319242 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.51■■■■■ 5.68
GFRA4-202ENST00000319242 SMARCA2P51531 1590 aa50.39■■■■■ 5.66
GFRA4-202ENST00000319242 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.33■■■■■ 5.65
GFRA4-202ENST00000319242 HMGXB3Q12766 1538 aa50.18■■■■■ 5.62
GFRA4-202ENST00000319242 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.17■■■■■ 5.62
GFRA4-202ENST00000319242 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.06■■■■■ 5.6
GFRA4-202ENST00000319242 WIZO95785 1651 aa49.76■■■■■ 5.56
GFRA4-202ENST00000319242 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.68■■■■■ 5.54
GFRA4-202ENST00000319242 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.68■■■■■ 5.54
GFRA4-202ENST00000319242 NESP48681 1621 aa49.37■■■■■ 5.49
GFRA4-202ENST00000319242 ERCC6Q03468 1493 aa49.25■■■■■ 5.47
GFRA4-202ENST00000319242 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
GFRA4-202ENST00000319242 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.16■■■■■ 5.46
GFRA4-202ENST00000319242 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.04■■■■■ 5.44
GFRA4-202ENST00000319242 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.89■■■■■ 5.42
GFRA4-202ENST00000319242 CUX2O14529 1486 aa48.78■■■■■ 5.4
GFRA4-202ENST00000319242 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.71■■■■■ 5.39
GFRA4-202ENST00000319242 CFTRP13569 1480 aa48.68■■■■■ 5.38
GFRA4-202ENST00000319242 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.67■■■■■ 5.38
GFRA4-202ENST00000319242 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.61■■■■■ 5.37
GFRA4-202ENST00000319242 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.46■■■■■ 5.35
GFRA4-202ENST00000319242 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.41■■■■■ 5.34
GFRA4-202ENST00000319242 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.38■■■■■ 5.34
GFRA4-202ENST00000319242 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
GFRA4-202ENST00000319242 WDR62O43379 1518 aa48.21■■■■■ 5.31
GFRA4-202ENST00000319242 PRDM2Q13029 1718 aa48.19■■■■■ 5.31
GFRA4-202ENST00000319242 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
GFRA4-202ENST00000319242 TOPBP1Q92547 1522 aa47.66■■■■■ 5.22
GFRA4-202ENST00000319242 ABCC8Q09428 1581 aa47.63■■■■■ 5.22
GFRA4-202ENST00000319242 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.55■■■■■ 5.2
GFRA4-202ENST00000319242 IFT140Q96RY7 1462 aa47.4■■■■■ 5.18
GFRA4-202ENST00000319242 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
GFRA4-202ENST00000319242 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
GFRA4-202ENST00000319242 CUX1P39880 1505 aa47.22■■■■■ 5.15
GFRA4-202ENST00000319242 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
GFRA4-202ENST00000319242 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.09■■■■■ 5.13
GFRA4-202ENST00000319242 SOGA1O94964 1423 aa47.08■■■■■ 5.13
GFRA4-202ENST00000319242 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.07■■■■■ 5.13
GFRA4-202ENST00000319242 TRIM41Q8WV44 630 aa47.06■■■■■ 5.12
GFRA4-202ENST00000319242 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
GFRA4-202ENST00000319242 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.95■■■■■ 5.11
GFRA4-202ENST00000319242 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
GFRA4-202ENST00000319242 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.85■■■■■ 5.09
GFRA4-202ENST00000319242 OSCARQ8IYS5 282 aa46.8■■■■■ 5.08
GFRA4-202ENST00000319242 TOP2BQ02880 1626 aa46.72■■■■■ 5.07
GFRA4-202ENST00000319242 SYNJ1O43426 1573 aa46.71■■■■■ 5.07
GFRA4-202ENST00000319242 WDR97A6NE52 1622 aa46.7■■■■■ 5.07
GFRA4-202ENST00000319242 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.7■■■■■ 5.07
GFRA4-202ENST00000319242 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.62■■■■■ 5.05
GFRA4-202ENST00000319242 GRIN2BQ13224 1484 aa46.52■■■■■ 5.04
GFRA4-202ENST00000319242 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.51■■■■■ 5.04
GFRA4-202ENST00000319242 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.49■■■■■ 5.03
GFRA4-202ENST00000319242 FBLN2P98095 1184 aa46.48■■■■■ 5.03
GFRA4-202ENST00000319242 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.42■■■■■ 5.02
GFRA4-202ENST00000319242 CHD1O14646 1710 aa46.42■■■■■ 5.02
GFRA4-202ENST00000319242 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
GFRA4-202ENST00000319242 PBRM1Q86U86 1689 aa46.35■■■■■ 5.01
GFRA4-202ENST00000319242 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.3■■■■■ 5
GFRA4-202ENST00000319242 SYNJ2O15056 1496 aa46.24■■■■■ 4.99
GFRA4-202ENST00000319242 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.04■■■■■ 4.96
GFRA4-202ENST00000319242 ADAMTS12P58397 1594 aa46■■■■■ 4.95
GFRA4-202ENST00000319242 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.99■■■■■ 4.95
GFRA4-202ENST00000319242 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.99■■■■■ 4.95
GFRA4-202ENST00000319242 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.99■■■■■ 4.95
GFRA4-202ENST00000319242 ARHGEF11O15085 1522 aa45.98■■■■■ 4.95
GFRA4-202ENST00000319242 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.96■■■■■ 4.95
GFRA4-202ENST00000319242 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.94■■■■■ 4.95
GFRA4-202ENST00000319242 GRIN2AQ12879 1464 aa45.92■■■■■ 4.94
GFRA4-202ENST00000319242 KIF27Q86VH2 1401 aa45.89■■■■■ 4.94
GFRA4-202ENST00000319242 IGF1RP08069 1367 aa45.77■■■■■ 4.92
GFRA4-202ENST00000319242 NUP160Q12769 1436 aa45.73■■■■■ 4.91
GFRA4-202ENST00000319242 CEP170Q5SW79 1584 aa45.68■■■■■ 4.9
GFRA4-202ENST00000319242 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.65■■■■■ 4.9
GFRA4-202ENST00000319242 ARAP1Q96P48 1450 aa45.61■■■■■ 4.89
GFRA4-202ENST00000319242 CUL7Q14999 1698 aa45.55■■■■■ 4.88
GFRA4-202ENST00000319242 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.48■■■■■ 4.87
GFRA4-202ENST00000319242 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.44■■■■■ 4.86
GFRA4-202ENST00000319242 SHROOM2Q13796 1616 aa45.36■■■■■ 4.85
GFRA4-202ENST00000319242 JPH4Q96JJ6 628 aa45.33■■■■■ 4.85
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