RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317555.6

PGAM5-201, Transcript of PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGAM5, Length 1,182 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5-201ENST00000317555 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.91■■■■■ 8.14
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PGAM5-201ENST00000317555 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.69■■■■■ 6.51
PGAM5-201ENST00000317555 NACADO15069 1562 aa55.47■■■■■ 6.47
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PGAM5-201ENST00000317555 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.45■■■■■ 6.31
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PGAM5-201ENST00000317555 SCRIBQ14160 1630 aa53.67■■■■■ 6.18
PGAM5-201ENST00000317555 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.39■■■■■ 6.14
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PGAM5-201ENST00000317555 SMARCA2P51531 1590 aa51.06■■■■■ 5.76
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PGAM5-201ENST00000317555 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.78■■■■■ 5.72
PGAM5-201ENST00000317555 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.77■■■■■ 5.72
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PGAM5-201ENST00000317555 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.65■■■■■ 5.54
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PGAM5-201ENST00000317555 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.56■■■■■ 5.52
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PGAM5-201ENST00000317555 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.13■■■■■ 5.46
PGAM5-201ENST00000317555 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.11■■■■■ 5.45
PGAM5-201ENST00000317555 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.1■■■■■ 5.45
PGAM5-201ENST00000317555 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.06■■■■■ 5.44
PGAM5-201ENST00000317555 WDR62O43379 1518 aa48.99■■■■■ 5.43
PGAM5-201ENST00000317555 PRDM2Q13029 1718 aa48.91■■■■■ 5.42
PGAM5-201ENST00000317555 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.9■■■■■ 5.42
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PGAM5-201ENST00000317555 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
PGAM5-201ENST00000317555 TOPBP1Q92547 1522 aa48.25■■■■■ 5.31
PGAM5-201ENST00000317555 ABCC8Q09428 1581 aa48.22■■■■■ 5.31
PGAM5-201ENST00000317555 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.16■■■■■ 5.3
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PGAM5-201ENST00000317555 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.9■■■■■ 5.26
PGAM5-201ENST00000317555 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.8■■■■■ 5.24
PGAM5-201ENST00000317555 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
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PGAM5-201ENST00000317555 CUX1P39880 1505 aa47.68■■■■■ 5.22
PGAM5-201ENST00000317555 OSCARQ8IYS5 282 aa47.63■■■■■ 5.22
PGAM5-201ENST00000317555 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.61■■■■■ 5.21
PGAM5-201ENST00000317555 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.59■■■■■ 5.21
PGAM5-201ENST00000317555 SOGA1O94964 1423 aa47.58■■■■■ 5.21
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PGAM5-201ENST00000317555 WDR97A6NE52 1622 aa47.38■■■■■ 5.18
PGAM5-201ENST00000317555 CHD1O14646 1710 aa47.25■■■■■ 5.15
PGAM5-201ENST00000317555 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.17■■■■■ 5.14
PGAM5-201ENST00000317555 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.15■■■■■ 5.14
PGAM5-201ENST00000317555 TOP2BQ02880 1626 aa47.14■■■■■ 5.14
PGAM5-201ENST00000317555 FBLN2P98095 1184 aa47.12■■■■■ 5.13
PGAM5-201ENST00000317555 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.12■■■■■ 5.13
PGAM5-201ENST00000317555 GRIN2BQ13224 1484 aa47.11■■■■■ 5.13
PGAM5-201ENST00000317555 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.1■■■■■ 5.13
PGAM5-201ENST00000317555 SYNJ1O43426 1573 aa47.09■■■■■ 5.13
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PGAM5-201ENST00000317555 PBRM1Q86U86 1689 aa47.03■■■■■ 5.12
PGAM5-201ENST00000317555 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47■■■■■ 5.11
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PGAM5-201ENST00000317555 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.96■■■■■ 5.11
PGAM5-201ENST00000317555 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.96■■■■■ 5.11
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PGAM5-201ENST00000317555 CEP170Q5SW79 1584 aa46.3■■■■■ 5
PGAM5-201ENST00000317555 KIF27Q86VH2 1401 aa46.24■■■■■ 4.99
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PGAM5-201ENST00000317555 CUL7Q14999 1698 aa46.05■■■■■ 4.96
PGAM5-201ENST00000317555 SHROOM2Q13796 1616 aa46.04■■■■■ 4.96
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PGAM5-201ENST00000317555 JPH4Q96JJ6 628 aa45.82■■■■■ 4.93
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