RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.12■■■■■ 5.77
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PKDCC-201ENST00000294964 ABCC9O60706 1549 aa42.92■■■■■ 4.46
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PKDCC-201ENST00000294964 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.31■■■■■ 4.36
PKDCC-201ENST00000294964 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.24■■■■■ 4.35
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PKDCC-201ENST00000294964 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.95■■■■■ 4.31
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PKDCC-201ENST00000294964 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.66■■■■■ 4.26
PKDCC-201ENST00000294964 HRCP23327 699 aa41.49■■■■■ 4.23
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PKDCC-201ENST00000294964 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.94■■■■■ 4.14
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PKDCC-201ENST00000294964 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.58■■■■■ 4.09
PKDCC-201ENST00000294964 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.5■■■■■ 4.07
PKDCC-201ENST00000294964 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.49■■■■■ 4.07
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PKDCC-201ENST00000294964 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
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PKDCC-201ENST00000294964 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.63■■■■□ 3.94
PKDCC-201ENST00000294964 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.5■■■■□ 3.91
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PKDCC-201ENST00000294964 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
PKDCC-201ENST00000294964 SMARCA4P51532 1647 aa39.45■■■■□ 3.91
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PKDCC-201ENST00000294964 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
PKDCC-201ENST00000294964 WIZO95785 1651 aa39.17■■■■□ 3.86
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
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PKDCC-201ENST00000294964 TRIM41Q8WV44 630 aa38.97■■■■□ 3.83
PKDCC-201ENST00000294964 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
PKDCC-201ENST00000294964 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.91■■■■□ 3.82
PKDCC-201ENST00000294964 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
PKDCC-201ENST00000294964 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.86■■■■□ 3.81
PKDCC-201ENST00000294964 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.85■■■■□ 3.81
PKDCC-201ENST00000294964 SMARCA2P51531 1590 aa38.85■■■■□ 3.81
PKDCC-201ENST00000294964 MYT1Q01538 1121 aa38.74■■■■□ 3.79
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PKDCC-201ENST00000294964 NCAPD3P42695 1498 aa38.65■■■■□ 3.78
PKDCC-201ENST00000294964 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
PKDCC-201ENST00000294964 HMGXB3Q12766 1538 aa38.57■■■■□ 3.77
PKDCC-201ENST00000294964 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.4■■■■□ 3.74
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PKDCC-201ENST00000294964 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.29■■■■□ 3.72
PKDCC-201ENST00000294964 NEUROD1Q13562 356 aa38.21■■■■□ 3.71
PKDCC-201ENST00000294964 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa38■■■■□ 3.67
PKDCC-201ENST00000294964 ABCC8Q09428 1581 aa37.88■■■■□ 3.65
PKDCC-201ENST00000294964 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
PKDCC-201ENST00000294964 CFTRP13569 1480 aa37.65■■■■□ 3.62
PKDCC-201ENST00000294964 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.6■■■■□ 3.61
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PKDCC-201ENST00000294964 NESP48681 1621 aa37.54■■■■□ 3.6
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PKDCC-201ENST00000294964 PRDM2Q13029 1718 aa37.5■■■■□ 3.59
PKDCC-201ENST00000294964 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
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PKDCC-201ENST00000294964 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.2■■■■□ 3.55
PKDCC-201ENST00000294964 CEP162Q5TB80 1403 aa37.16■■■■□ 3.54
PKDCC-201ENST00000294964 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.12■■■■□ 3.53
PKDCC-201ENST00000294964 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.12■■■■□ 3.53
PKDCC-201ENST00000294964 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.11■■■■□ 3.53
PKDCC-201ENST00000294964 SYNJ1O43426 1573 aa37.06■■■■□ 3.52
PKDCC-201ENST00000294964 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.03■■■■□ 3.52
PKDCC-201ENST00000294964 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.99■■■■□ 3.51
PKDCC-201ENST00000294964 CUX1P39880 1505 aa36.97■■■■□ 3.51
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PKDCC-201ENST00000294964 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.79■■■■□ 3.48
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
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PKDCC-201ENST00000294964 WDR62O43379 1518 aa36.59■■■■□ 3.45
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PKDCC-201ENST00000294964 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.43■■■■□ 3.42
PKDCC-201ENST00000294964 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
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PKDCC-201ENST00000294964 WDR97A6NE52 1622 aa36.31■■■■□ 3.4
PKDCC-201ENST00000294964 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
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PKDCC-201ENST00000294964 APLP2Q06481 763 aa36.23■■■■□ 3.39
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