RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.07■■■■■ 7.85
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.79■■■■■ 6.68
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC9O60706 1549 aa55.09■■■■■ 6.41
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.43■■■■■ 6.14
CRIP1-201ENST00000330233 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.42■■■■■ 6.14
CRIP1-201ENST00000330233 NACADO15069 1562 aa53.31■■■■■ 6.13
CRIP1-201ENST00000330233 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.27■■■■■ 6.12
CRIP1-201ENST00000330233 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.15■■■■■ 6.1
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.07■■■■■ 6.09
CRIP1-201ENST00000330233 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.06■■■■■ 5.92
CRIP1-201ENST00000330233 SCRIBQ14160 1630 aa51.79■■■■■ 5.88
CRIP1-201ENST00000330233 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.59■■■■■ 5.85
CRIP1-201ENST00000330233 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.56■■■■■ 5.84
CRIP1-201ENST00000330233 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.13■■■■■ 5.78
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.18■■■■■ 5.62
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.18■■■■■ 5.62
CRIP1-201ENST00000330233 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.89■■■■■ 5.58
CRIP1-201ENST00000330233 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.82■■■■■ 5.57
CRIP1-201ENST00000330233 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.65■■■■■ 5.54
CRIP1-201ENST00000330233 SMARCA4P51532 1647 aa49.61■■■■■ 5.53
CRIP1-201ENST00000330233 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.35■■■■■ 5.49
CRIP1-201ENST00000330233 SMARCA2P51531 1590 aa49.24■■■■■ 5.47
CRIP1-201ENST00000330233 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.23■■■■■ 5.47
CRIP1-201ENST00000330233 NCAPD3P42695 1498 aa49.18■■■■■ 5.46
CRIP1-201ENST00000330233 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.14■■■■■ 5.46
CRIP1-201ENST00000330233 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.97■■■■■ 5.43
CRIP1-201ENST00000330233 HMGXB3Q12766 1538 aa48.95■■■■■ 5.43
CRIP1-201ENST00000330233 WIZO95785 1651 aa48.87■■■■■ 5.41
CRIP1-201ENST00000330233 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
CRIP1-201ENST00000330233 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
CRIP1-201ENST00000330233 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
CRIP1-201ENST00000330233 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.82■■■■■ 5.25
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.82■■■■■ 5.25
CRIP1-201ENST00000330233 NESP48681 1621 aa47.79■■■■■ 5.24
CRIP1-201ENST00000330233 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.78■■■■■ 5.24
CRIP1-201ENST00000330233 CFTRP13569 1480 aa47.55■■■■■ 5.2
CRIP1-201ENST00000330233 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.51■■■■■ 5.2
CRIP1-201ENST00000330233 ERCC6Q03468 1493 aa47.5■■■■■ 5.19
CRIP1-201ENST00000330233 PRDM2Q13029 1718 aa47.3■■■■■ 5.16
CRIP1-201ENST00000330233 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.28■■■■■ 5.16
CRIP1-201ENST00000330233 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.2■■■■■ 5.15
CRIP1-201ENST00000330233 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.1■■■■■ 5.13
CRIP1-201ENST00000330233 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
CRIP1-201ENST00000330233 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.93■■■■■ 5.1
CRIP1-201ENST00000330233 CUX2O14529 1486 aa46.85■■■■■ 5.09
CRIP1-201ENST00000330233 WDR62O43379 1518 aa46.74■■■■■ 5.07
CRIP1-201ENST00000330233 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC8Q09428 1581 aa46.61■■■■■ 5.05
CRIP1-201ENST00000330233 TOPBP1Q92547 1522 aa46.48■■■■■ 5.03
CRIP1-201ENST00000330233 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.47■■■■■ 5.03
CRIP1-201ENST00000330233 CUX1P39880 1505 aa46.27■■■■■ 5
CRIP1-201ENST00000330233 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.18■■■■■ 4.98
CRIP1-201ENST00000330233 IFT140Q96RY7 1462 aa46.11■■■■■ 4.97
CRIP1-201ENST00000330233 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
CRIP1-201ENST00000330233 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.06■■■■■ 4.96
CRIP1-201ENST00000330233 TOP2BQ02880 1626 aa46.03■■■■■ 4.96
CRIP1-201ENST00000330233 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.02■■■■■ 4.96
CRIP1-201ENST00000330233 SOGA1O94964 1423 aa45.98■■■■■ 4.95
CRIP1-201ENST00000330233 SYNJ1O43426 1573 aa45.98■■■■■ 4.95
CRIP1-201ENST00000330233 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.95
CRIP1-201ENST00000330233 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.89■■■■■ 4.94
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
CRIP1-201ENST00000330233 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.66■■■■■ 4.9
CRIP1-201ENST00000330233 WDR97A6NE52 1622 aa45.66■■■■■ 4.9
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
CRIP1-201ENST00000330233 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.64■■■■■ 4.9
CRIP1-201ENST00000330233 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM41Q8WV44 630 aa45.47■■■■■ 4.87
CRIP1-201ENST00000330233 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.44■■■■■ 4.86
CRIP1-201ENST00000330233 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.41■■■■■ 4.86
CRIP1-201ENST00000330233 GRIN2BQ13224 1484 aa45.37■■■■■ 4.85
CRIP1-201ENST00000330233 PBRM1Q86U86 1689 aa45.31■■■■■ 4.84
CRIP1-201ENST00000330233 KIF27Q86VH2 1401 aa45.21■■■■■ 4.83
CRIP1-201ENST00000330233 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
CRIP1-201ENST00000330233 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.2■■■■■ 4.83
CRIP1-201ENST00000330233 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.16■■■■■ 4.82
CRIP1-201ENST00000330233 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.14■■■■■ 4.82
CRIP1-201ENST00000330233 FBLN2P98095 1184 aa45.07■■■■■ 4.81
CRIP1-201ENST00000330233 OSCARQ8IYS5 282 aa45.07■■■■■ 4.81
CRIP1-201ENST00000330233 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
CRIP1-201ENST00000330233 CHD1O14646 1710 aa45.04■■■■■ 4.8
CRIP1-201ENST00000330233 SYNJ2O15056 1496 aa45.02■■■■■ 4.8
CRIP1-201ENST00000330233 IGF1RP08069 1367 aa44.97■■■■■ 4.79
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.95■■■■■ 4.79
CRIP1-201ENST00000330233 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.94■■■■■ 4.79
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS12P58397 1594 aa44.92■■■■■ 4.78
CRIP1-201ENST00000330233 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.86■■■■■ 4.77
CRIP1-201ENST00000330233 CUL7Q14999 1698 aa44.83■■■■■ 4.77
CRIP1-201ENST00000330233 GRIN2AQ12879 1464 aa44.77■■■■■ 4.76
CRIP1-201ENST00000330233 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.72■■■■■ 4.75
CRIP1-201ENST00000330233 EEA1Q15075 1411 aa44.67■■■■■ 4.74
CRIP1-201ENST00000330233 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.56■■■■■ 4.72
CRIP1-201ENST00000330233 NUP160Q12769 1436 aa44.55■■■■■ 4.72
CRIP1-201ENST00000330233 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.51■■■■■ 4.72
CRIP1-201ENST00000330233 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.5■■■■■ 4.71
CRIP1-201ENST00000330233 CEP170Q5SW79 1584 aa44.5■■■■■ 4.71
CRIP1-201ENST00000330233 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
CRIP1-201ENST00000330233 PRXQ9BXM0 1461 aa44.41■■■■■ 4.7
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.27■■■■■ 4.68
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF11O15085 1522 aa44.22■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms