RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455982.2

DENR-202, Transcript of density regulated re-initiation and release factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene DENR, Length 1,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENR-202ENST00000455982 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.47■■■■■ 8.07
DENR-202ENST00000455982 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.25■■■■■ 6.92
DENR-202ENST00000455982 ABCC9O60706 1549 aa56.71■■■■■ 6.67
DENR-202ENST00000455982 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.71■■■■■ 6.35
DENR-202ENST00000455982 NACADO15069 1562 aa54.7■■■■■ 6.35
DENR-202ENST00000455982 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.59■■■■■ 6.33
DENR-202ENST00000455982 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.48■■■■■ 6.31
DENR-202ENST00000455982 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.4■■■■■ 6.3
DENR-202ENST00000455982 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.26■■■■■ 6.28
DENR-202ENST00000455982 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.5■■■■■ 6.15
DENR-202ENST00000455982 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.05■■■■■ 6.08
DENR-202ENST00000455982 SCRIBQ14160 1630 aa53.02■■■■■ 6.08
DENR-202ENST00000455982 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.93■■■■■ 6.06
DENR-202ENST00000455982 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.61■■■■■ 6.01
DENR-202ENST00000455982 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.9■■■■■ 5.9
DENR-202ENST00000455982 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.63■■■■■ 5.86
DENR-202ENST00000455982 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.37■■■■■ 5.81
DENR-202ENST00000455982 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.98■■■■■ 5.75
DENR-202ENST00000455982 SMARCA4P51532 1647 aa50.79■■■■■ 5.72
DENR-202ENST00000455982 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.76■■■■■ 5.72
DENR-202ENST00000455982 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.46■■■■■ 5.67
DENR-202ENST00000455982 SMARCA2P51531 1590 aa50.45■■■■■ 5.67
DENR-202ENST00000455982 NCAPD3P42695 1498 aa50.45■■■■■ 5.67
DENR-202ENST00000455982 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.43■■■■■ 5.66
DENR-202ENST00000455982 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.36■■■■■ 5.65
DENR-202ENST00000455982 HMGXB3Q12766 1538 aa50.25■■■■■ 5.63
DENR-202ENST00000455982 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.04■■■■■ 5.6
DENR-202ENST00000455982 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.89■■■■■ 5.58
DENR-202ENST00000455982 WIZO95785 1651 aa49.88■■■■■ 5.58
DENR-202ENST00000455982 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
DENR-202ENST00000455982 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.12■■■■■ 5.45
DENR-202ENST00000455982 NESP48681 1621 aa49.12■■■■■ 5.45
DENR-202ENST00000455982 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.94■■■■■ 5.43
DENR-202ENST00000455982 ERCC6Q03468 1493 aa48.88■■■■■ 5.42
DENR-202ENST00000455982 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.77■■■■■ 5.4
DENR-202ENST00000455982 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.73■■■■■ 5.39
DENR-202ENST00000455982 CFTRP13569 1480 aa48.71■■■■■ 5.39
DENR-202ENST00000455982 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.61■■■■■ 5.37
DENR-202ENST00000455982 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
DENR-202ENST00000455982 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.45■■■■■ 5.35
DENR-202ENST00000455982 PRDM2Q13029 1718 aa48.43■■■■■ 5.34
DENR-202ENST00000455982 CUX2O14529 1486 aa48.42■■■■■ 5.34
DENR-202ENST00000455982 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.38■■■■■ 5.34
DENR-202ENST00000455982 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.33■■■■■ 5.33
DENR-202ENST00000455982 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.24■■■■■ 5.31
DENR-202ENST00000455982 WDR62O43379 1518 aa48.12■■■■■ 5.29
DENR-202ENST00000455982 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
DENR-202ENST00000455982 ABCC8Q09428 1581 aa47.67■■■■■ 5.22
DENR-202ENST00000455982 TOPBP1Q92547 1522 aa47.63■■■■■ 5.22
DENR-202ENST00000455982 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.62■■■■■ 5.21
DENR-202ENST00000455982 IFT140Q96RY7 1462 aa47.32■■■■■ 5.17
DENR-202ENST00000455982 CUX1P39880 1505 aa47.31■■■■■ 5.16
DENR-202ENST00000455982 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
DENR-202ENST00000455982 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
DENR-202ENST00000455982 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.12■■■■■ 5.13
DENR-202ENST00000455982 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
DENR-202ENST00000455982 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.04■■■■■ 5.12
DENR-202ENST00000455982 SOGA1O94964 1423 aa46.99■■■■■ 5.11
DENR-202ENST00000455982 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.98■■■■■ 5.11
DENR-202ENST00000455982 TOP2BQ02880 1626 aa46.97■■■■■ 5.11
DENR-202ENST00000455982 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.96■■■■■ 5.11
DENR-202ENST00000455982 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
DENR-202ENST00000455982 SYNJ1O43426 1573 aa46.92■■■■■ 5.1
DENR-202ENST00000455982 WDR97A6NE52 1622 aa46.85■■■■■ 5.09
DENR-202ENST00000455982 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.76■■■■■ 5.086e-9■■■■■ 45.1
DENR-202ENST00000455982 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.72■■■■■ 5.07
DENR-202ENST00000455982 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.71■■■■■ 5.07
DENR-202ENST00000455982 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.06
DENR-202ENST00000455982 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.54■■■■■ 5.04
DENR-202ENST00000455982 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.49■■■■■ 5.03
DENR-202ENST00000455982 GRIN2BQ13224 1484 aa46.48■■■■■ 5.03
DENR-202ENST00000455982 PBRM1Q86U86 1689 aa46.43■■■■■ 5.02
DENR-202ENST00000455982 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.02
DENR-202ENST00000455982 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.38■■■■■ 5.01
DENR-202ENST00000455982 OSCARQ8IYS5 282 aa46.33■■■■■ 5.01
DENR-202ENST00000455982 CHD1O14646 1710 aa46.31■■■■■ 5
DENR-202ENST00000455982 SYNJ2O15056 1496 aa46.18■■■■■ 4.98
DENR-202ENST00000455982 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.17■■■■■ 4.98
DENR-202ENST00000455982 FBLN2P98095 1184 aa46.09■■■■■ 4.97
DENR-202ENST00000455982 ADAMTS12P58397 1594 aa46.08■■■■■ 4.97
DENR-202ENST00000455982 KIF27Q86VH2 1401 aa46.05■■■■■ 4.96
DENR-202ENST00000455982 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
DENR-202ENST00000455982 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.97■■■■■ 4.95
DENR-202ENST00000455982 GRIN2AQ12879 1464 aa45.89■■■■■ 4.94
DENR-202ENST00000455982 TRIM41Q8WV44 630 aa45.89■■■■■ 4.94
DENR-202ENST00000455982 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.83■■■■■ 4.93
DENR-202ENST00000455982 IGF1RP08069 1367 aa45.82■■■■■ 4.93
DENR-202ENST00000455982 CUL7Q14999 1698 aa45.79■■■■■ 4.92
DENR-202ENST00000455982 NUP160Q12769 1436 aa45.7■■■■■ 4.91
DENR-202ENST00000455982 CEP170Q5SW79 1584 aa45.66■■■■■ 4.9
DENR-202ENST00000455982 ARHGEF11O15085 1522 aa45.65■■■■■ 4.9
DENR-202ENST00000455982 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.64■■■■■ 4.9
DENR-202ENST00000455982 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.64■■■■■ 4.9
DENR-202ENST00000455982 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.64■■■■■ 4.9
DENR-202ENST00000455982 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.6■■■■■ 4.89
DENR-202ENST00000455982 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.54■■■■■ 4.88
DENR-202ENST00000455982 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.42■■■■■ 4.86
DENR-202ENST00000455982 SHROOM2Q13796 1616 aa45.38■■■■■ 4.86
DENR-202ENST00000455982 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.32■■■■■ 4.85
DENR-202ENST00000455982 ARAP1Q96P48 1450 aa45.29■■■■■ 4.84
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