RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-208ENST00000551676 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.79■■■■■ 7
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.32■■■■■ 5.81
PPP1CC-208ENST00000551676 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
PPP1CC-208ENST00000551676 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.69■■■■■ 5.39
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCC9O60706 1549 aa48.58■■■■■ 5.37
PPP1CC-208ENST00000551676 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.43■■■■■ 5.34
PPP1CC-208ENST00000551676 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.18■■■■■ 5.3
PPP1CC-208ENST00000551676 NACADO15069 1562 aa47.86■■■■■ 5.25
PPP1CC-208ENST00000551676 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.69■■■■■ 5.22
PPP1CC-208ENST00000551676 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.45■■■■■ 5.19
PPP1CC-208ENST00000551676 SCRIBQ14160 1630 aa47.08■■■■■ 5.13
PPP1CC-208ENST00000551676 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.4■■■■■ 5.02
PPP1CC-208ENST00000551676 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.04■■■■■ 4.96
PPP1CC-208ENST00000551676 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
PPP1CC-208ENST00000551676 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.79■■■■■ 4.92
PPP1CC-208ENST00000551676 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.66■■■■■ 4.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.56■■■■■ 4.88
PPP1CC-208ENST00000551676 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.39■■■■■ 4.86
PPP1CC-208ENST00000551676 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
PPP1CC-208ENST00000551676 SMARCA4P51532 1647 aa45.19■■■■■ 4.82
PPP1CC-208ENST00000551676 WIZO95785 1651 aa44.95■■■■■ 4.79
PPP1CC-208ENST00000551676 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.71■■■■■ 4.75
PPP1CC-208ENST00000551676 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
PPP1CC-208ENST00000551676 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
PPP1CC-208ENST00000551676 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.52■■■■■ 4.72
PPP1CC-208ENST00000551676 SMARCA2P51531 1590 aa44.48■■■■■ 4.71
PPP1CC-208ENST00000551676 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
PPP1CC-208ENST00000551676 NCAPD3P42695 1498 aa44.2■■■■■ 4.67
PPP1CC-208ENST00000551676 HMGXB3Q12766 1538 aa44.09■■■■■ 4.65
PPP1CC-208ENST00000551676 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.09■■■■■ 4.65
PPP1CC-208ENST00000551676 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.98■■■■■ 4.63
PPP1CC-208ENST00000551676 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.91■■■■■ 4.62
PPP1CC-208ENST00000551676 TRIM41Q8WV44 630 aa43.16■■■■■ 4.5
PPP1CC-208ENST00000551676 CFTRP13569 1480 aa43.16■■■■■ 4.5
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCC8Q09428 1581 aa43.04■■■■■ 4.48
PPP1CC-208ENST00000551676 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.03■■■■■ 4.48
PPP1CC-208ENST00000551676 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.02■■■■■ 4.48
PPP1CC-208ENST00000551676 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.85■■■■■ 4.45
PPP1CC-208ENST00000551676 PRDM2Q13029 1718 aa42.82■■■■■ 4.45
PPP1CC-208ENST00000551676 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.67■■■■■ 4.42
PPP1CC-208ENST00000551676 SYNJ1O43426 1573 aa42.66■■■■■ 4.42
PPP1CC-208ENST00000551676 NESP48681 1621 aa42.61■■■■■ 4.41
PPP1CC-208ENST00000551676 TOP2BQ02880 1626 aa42.53■■■■■ 4.4
PPP1CC-208ENST00000551676 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.52■■■■■ 4.4
PPP1CC-208ENST00000551676 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.49■■■■■ 4.39
PPP1CC-208ENST00000551676 CUX1P39880 1505 aa42.45■■■■■ 4.39
PPP1CC-208ENST00000551676 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.35■■■■■ 4.37
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
PPP1CC-208ENST00000551676 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP1CC-208ENST00000551676 SOGA1O94964 1423 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP1CC-208ENST00000551676 EEA1Q15075 1411 aa42.22■■■■■ 4.35
PPP1CC-208ENST00000551676 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.16■■■■■ 4.34
PPP1CC-208ENST00000551676 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.12■■■■■ 4.33
PPP1CC-208ENST00000551676 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.09■■■■■ 4.33
PPP1CC-208ENST00000551676 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.07■■■■■ 4.32
PPP1CC-208ENST00000551676 TOPBP1Q92547 1522 aa42.04■■■■■ 4.32
PPP1CC-208ENST00000551676 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
PPP1CC-208ENST00000551676 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.99■■■■■ 4.31
PPP1CC-208ENST00000551676 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.97■■■■■ 4.31
PPP1CC-208ENST00000551676 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
PPP1CC-208ENST00000551676 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.81■■■■■ 4.28
PPP1CC-208ENST00000551676 KIF27Q86VH2 1401 aa41.79■■■■■ 4.28
PPP1CC-208ENST00000551676 CUX2O14529 1486 aa41.68■■■■■ 4.26
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.66■■■■■ 4.26
PPP1CC-208ENST00000551676 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.66■■■■■ 4.26
PPP1CC-208ENST00000551676 ERCC6Q03468 1493 aa41.66■■■■■ 4.26
PPP1CC-208ENST00000551676 KIF21BO75037 1637 aa41.63■■■■■ 4.25
PPP1CC-208ENST00000551676 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.61■■■■■ 4.25
PPP1CC-208ENST00000551676 WDR62O43379 1518 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP1CC-208ENST00000551676 GOLGA3Q08378 1498 aa41.57■■■■■ 4.25
PPP1CC-208ENST00000551676 PRXQ9BXM0 1461 aa41.51■■■■■ 4.24
PPP1CC-208ENST00000551676 WDR97A6NE52 1622 aa41.5■■■■■ 4.23
PPP1CC-208ENST00000551676 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
PPP1CC-208ENST00000551676 IGF1RP08069 1367 aa41.47■■■■■ 4.23
PPP1CC-208ENST00000551676 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.46■■■■■ 4.23
PPP1CC-208ENST00000551676 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
PPP1CC-208ENST00000551676 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.4■■■■■ 4.22
PPP1CC-208ENST00000551676 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.4■■■■■ 4.22
PPP1CC-208ENST00000551676 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
PPP1CC-208ENST00000551676 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.31■■■■■ 4.2
PPP1CC-208ENST00000551676 IFT140Q96RY7 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP1CC-208ENST00000551676 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
PPP1CC-208ENST00000551676 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.23■■■■■ 4.19
PPP1CC-208ENST00000551676 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.23■■■■■ 4.19
PPP1CC-208ENST00000551676 CEP162Q5TB80 1403 aa41.16■■■■■ 4.18
PPP1CC-208ENST00000551676 CUL7Q14999 1698 aa41.11■■■■■ 4.17
PPP1CC-208ENST00000551676 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.164e-8■■■■■ 43
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
PPP1CC-208ENST00000551676 GRIN2BQ13224 1484 aa40.95■■■■■ 4.15
PPP1CC-208ENST00000551676 PBRM1Q86U86 1689 aa40.94■■■■■ 4.14
PPP1CC-208ENST00000551676 CLIP1P30622 1438 aa40.89■■■■■ 4.14
PPP1CC-208ENST00000551676 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
PPP1CC-208ENST00000551676 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.81■■■■■ 4.12
PPP1CC-208ENST00000551676 ADAMTS12P58397 1594 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP1CC-208ENST00000551676 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.66■■■■■ 4.1
PPP1CC-208ENST00000551676 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
PPP1CC-208ENST00000551676 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
PPP1CC-208ENST00000551676 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.58■■■■■ 4.09
PPP1CC-208ENST00000551676 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.54■■■■■ 4.08
PPP1CC-208ENST00000551676 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.53■■■■■ 4.08
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