RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOMM40-201ENST00000252487 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.62■■■■■ 5.05
TOMM40-201ENST00000252487 SMARCA2P51531 1590 aa46.55■■■■■ 5.04
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TOMM40-201ENST00000252487 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.57■■■■■ 4.72
TOMM40-201ENST00000252487 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.46■■■■■ 4.71
TOMM40-201ENST00000252487 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.44■■■■■ 4.7
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TOMM40-201ENST00000252487 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.34■■■■■ 4.69
TOMM40-201ENST00000252487 SYNJ1O43426 1573 aa44.27■■■■■ 4.68
TOMM40-201ENST00000252487 CUX1P39880 1505 aa44.24■■■■■ 4.67
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM41Q8WV44 630 aa44.17■■■■■ 4.66
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TOMM40-201ENST00000252487 TOP2BQ02880 1626 aa44.1■■■■■ 4.65
TOMM40-201ENST00000252487 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.08■■■■■ 4.65
TOMM40-201ENST00000252487 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.08■■■■■ 4.65
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TOMM40-201ENST00000252487 WDR97A6NE52 1622 aa43.44■■■■■ 4.55
TOMM40-201ENST00000252487 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.42■■■■■ 4.54
TOMM40-201ENST00000252487 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
TOMM40-201ENST00000252487 IFT140Q96RY7 1462 aa43.4■■■■■ 4.54
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TOMM40-201ENST00000252487 KIF27Q86VH2 1401 aa43.26■■■■■ 4.52
TOMM40-201ENST00000252487 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.2■■■■■ 4.51
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TOMM40-201ENST00000252487 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.04■■■■■ 4.48
TOMM40-201ENST00000252487 PBRM1Q86U86 1689 aa43.01■■■■■ 4.48
TOMM40-201ENST00000252487 IGF1RP08069 1367 aa42.99■■■■■ 4.47
TOMM40-201ENST00000252487 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.92■■■■■ 4.46
TOMM40-201ENST00000252487 GRIN2BQ13224 1484 aa42.9■■■■■ 4.46
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TOMM40-201ENST00000252487 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.78■■■■■ 4.44
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TOMM40-201ENST00000252487 FBLN2P98095 1184 aa42.46■■■■■ 4.39
TOMM40-201ENST00000252487 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
TOMM40-201ENST00000252487 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
TOMM40-201ENST00000252487 GRIN2AQ12879 1464 aa42.39■■■■■ 4.38
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TOMM40-201ENST00000252487 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.21■■■■■ 4.35
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