Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBPP18428 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBPP18428 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBPP18428 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBPP18428 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBPP18428 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBPP18428 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBPP18428 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBPP18428 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBPP18428 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBPP18428 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LBPP18428 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBPP18428 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBPP18428 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBPP18428 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBPP18428 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LBPP18428 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LBPP18428 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LBPP18428 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LBPP18428 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LBPP18428 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LBPP18428 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LBPP18428 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LBPP18428 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LBPP18428 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LBPP18428 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LBPP18428 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LBPP18428 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LBPP18428 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LBPP18428 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LBPP18428 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LBPP18428 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LBPP18428 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LBPP18428 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LBPP18428 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBPP18428 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBPP18428 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBPP18428 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBPP18428 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LBPP18428 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBPP18428 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBPP18428 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBPP18428 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LBPP18428 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LBPP18428 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBPP18428 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBPP18428 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBPP18428 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LBPP18428 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBPP18428 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBPP18428 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBPP18428 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBPP18428 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBPP18428 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBPP18428 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBPP18428 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBPP18428 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBPP18428 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBPP18428 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBPP18428 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBPP18428 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBPP18428 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBPP18428 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBPP18428 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBPP18428 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBPP18428 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBPP18428 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBPP18428 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBPP18428 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBPP18428 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBPP18428 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBPP18428 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBPP18428 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBPP18428 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBPP18428 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBPP18428 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBPP18428 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBPP18428 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBPP18428 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBPP18428 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBPP18428 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LBPP18428 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LBPP18428 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBPP18428 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LBPP18428 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LBPP18428 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LBPP18428 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBPP18428 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBPP18428 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBPP18428 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LBPP18428 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms