RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368216.8

RRNAD1-201, Transcript of ribosomal RNA adenine dimethylase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRNAD1, Length 2,254 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRNAD1-201ENST00000368216 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.21■■■■■ 5.47
RRNAD1-201ENST00000368216 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.23■■■■■ 4.35
RRNAD1-201ENST00000368216 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
RRNAD1-201ENST00000368216 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
RRNAD1-201ENST00000368216 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.6■■■■■ 4.25
RRNAD1-201ENST00000368216 HRCP23327 699 aa41.39■■■■■ 4.22
RRNAD1-201ENST00000368216 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
RRNAD1-201ENST00000368216 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.21■■■■■ 4.19
RRNAD1-201ENST00000368216 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.64■■■■■ 4.1
RRNAD1-201ENST00000368216 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.59■■■■■ 4.09
RRNAD1-201ENST00000368216 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.22■■■■■ 4.03
RRNAD1-201ENST00000368216 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
RRNAD1-201ENST00000368216 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
RRNAD1-201ENST00000368216 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.86■■■■□ 3.97
RRNAD1-201ENST00000368216 ABCC9O60706 1549 aa39.65■■■■□ 3.94
RRNAD1-201ENST00000368216 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
RRNAD1-201ENST00000368216 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
RRNAD1-201ENST00000368216 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
RRNAD1-201ENST00000368216 TRIM41Q8WV44 630 aa39.01■■■■□ 3.84
RRNAD1-201ENST00000368216 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.01■■■■□ 3.84
RRNAD1-201ENST00000368216 SCRIBQ14160 1630 aa38.9■■■■□ 3.82
RRNAD1-201ENST00000368216 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
RRNAD1-201ENST00000368216 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
RRNAD1-201ENST00000368216 NACADO15069 1562 aa38.23■■■■□ 3.71
RRNAD1-201ENST00000368216 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.22■■■■□ 3.71
RRNAD1-201ENST00000368216 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.21■■■■□ 3.71
RRNAD1-201ENST00000368216 WIZO95785 1651 aa38.07■■■■□ 3.68
RRNAD1-201ENST00000368216 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.06■■■■□ 3.68
RRNAD1-201ENST00000368216 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
RRNAD1-201ENST00000368216 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
RRNAD1-201ENST00000368216 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
RRNAD1-201ENST00000368216 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
RRNAD1-201ENST00000368216 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.92■■■■□ 3.66
RRNAD1-201ENST00000368216 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.88■■■■□ 3.65
RRNAD1-201ENST00000368216 NEUROD1Q13562 356 aa37.77■■■■□ 3.64
RRNAD1-201ENST00000368216 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
RRNAD1-201ENST00000368216 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
RRNAD1-201ENST00000368216 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
RRNAD1-201ENST00000368216 CEP162Q5TB80 1403 aa37.55■■■■□ 3.6
RRNAD1-201ENST00000368216 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.51■■■■□ 3.6
RRNAD1-201ENST00000368216 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa37.49■■■■□ 3.59
RRNAD1-201ENST00000368216 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.48■■■■□ 3.59
RRNAD1-201ENST00000368216 EEA1Q15075 1411 aa37.46■■■■□ 3.59
RRNAD1-201ENST00000368216 ABCC8Q09428 1581 aa37.45■■■■□ 3.59
RRNAD1-201ENST00000368216 MYT1Q01538 1121 aa37.44■■■■□ 3.58
RRNAD1-201ENST00000368216 SMARCA2P51531 1590 aa37.37■■■■□ 3.57
RRNAD1-201ENST00000368216 SMARCA4P51532 1647 aa37.32■■■■□ 3.57
RRNAD1-201ENST00000368216 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
RRNAD1-201ENST00000368216 SOGA1O94964 1423 aa37.26■■■■□ 3.55
RRNAD1-201ENST00000368216 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.17■■■■□ 3.54
RRNAD1-201ENST00000368216 GOLGA3Q08378 1498 aa37.15■■■■□ 3.54
RRNAD1-201ENST00000368216 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
RRNAD1-201ENST00000368216 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
RRNAD1-201ENST00000368216 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37■■■■□ 3.51
RRNAD1-201ENST00000368216 KIF21BO75037 1637 aa36.88■■■■□ 3.49
RRNAD1-201ENST00000368216 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.86■■■■□ 3.49
RRNAD1-201ENST00000368216 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.82■■■■□ 3.49
RRNAD1-201ENST00000368216 MIER1Q8N108 512 aa36.73■■■■□ 3.47
RRNAD1-201ENST00000368216 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
RRNAD1-201ENST00000368216 CLIP1P30622 1438 aa36.69■■■■□ 3.46
RRNAD1-201ENST00000368216 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.69■■■■□ 3.46
RRNAD1-201ENST00000368216 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
RRNAD1-201ENST00000368216 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.66■■■■□ 3.46
RRNAD1-201ENST00000368216 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
RRNAD1-201ENST00000368216 SYNJ1O43426 1573 aa36.59■■■■□ 3.45
RRNAD1-201ENST00000368216 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.5■■■■□ 3.43
RRNAD1-201ENST00000368216 APLP2Q06481 763 aa36.46■■■■□ 3.43
RRNAD1-201ENST00000368216 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.35■■■■□ 3.41
RRNAD1-201ENST00000368216 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.3■■■■□ 3.4
RRNAD1-201ENST00000368216 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
RRNAD1-201ENST00000368216 TOP2BQ02880 1626 aa36.16■■■■□ 3.38
RRNAD1-201ENST00000368216 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.16■■■■□ 3.38
RRNAD1-201ENST00000368216 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.13■■■■□ 3.37
RRNAD1-201ENST00000368216 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.05■■■■□ 3.36
RRNAD1-201ENST00000368216 ARAP1Q96P48 1450 aa36.02■■■■□ 3.36
RRNAD1-201ENST00000368216 PRXQ9BXM0 1461 aa36.01■■■■□ 3.35
RRNAD1-201ENST00000368216 CUX2O14529 1486 aa35.99■■■■□ 3.35
RRNAD1-201ENST00000368216 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
RRNAD1-201ENST00000368216 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.99■■■■□ 3.35
RRNAD1-201ENST00000368216 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
RRNAD1-201ENST00000368216 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
RRNAD1-201ENST00000368216 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
RRNAD1-201ENST00000368216 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.72■■■■□ 3.31
RRNAD1-201ENST00000368216 KIF27Q86VH2 1401 aa35.63■■■■□ 3.29
RRNAD1-201ENST00000368216 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa35.6■■■■□ 3.29
RRNAD1-201ENST00000368216 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.56■■■■□ 3.28
RRNAD1-201ENST00000368216 CUX1P39880 1505 aa35.55■■■■□ 3.28
RRNAD1-201ENST00000368216 MAP3K1Q13233 1512 aa35.52■■■■□ 3.28
RRNAD1-201ENST00000368216 MAPKBP1O60336 1514 aa35.51■■■■□ 3.28
RRNAD1-201ENST00000368216 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.46■■■■□ 3.27
RRNAD1-201ENST00000368216 HMGXB3Q12766 1538 aa35.45■■■■□ 3.27
RRNAD1-201ENST00000368216 ANP32EQ9BTT0 268 aa35.4■■■■□ 3.26
RRNAD1-201ENST00000368216 TIAM1Q13009 1591 aa35.39■■■■□ 3.26
RRNAD1-201ENST00000368216 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.35■■■■□ 3.25
RRNAD1-201ENST00000368216 NCAPD3P42695 1498 aa35.33■■■■□ 3.25
RRNAD1-201ENST00000368216 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.27■■■■□ 3.24
RRNAD1-201ENST00000368216 ITGAEP38570 1179 aa35.27■■■■□ 3.24
RRNAD1-201ENST00000368216 KCNH8Q96L42 1107 aa35.27■■■■□ 3.24
RRNAD1-201ENST00000368216 CFTRP13569 1480 aa35.27■■■■□ 3.24
RRNAD1-201ENST00000368216 WDR97A6NE52 1622 aa35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms