Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNW1P05000 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNW1P05000 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNW1P05000 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms