Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IFNW1P05000 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IFNW1P05000 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
IFNW1P05000 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFNW1P05000 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
IFNW1P05000 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IFNW1P05000 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IFNW1P05000 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IFNW1P05000 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IFNW1P05000 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFNW1P05000 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFNW1P05000 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFNW1P05000 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFNW1P05000 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFNW1P05000 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFNW1P05000 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFNW1P05000 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFNW1P05000 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFNW1P05000 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
IFNW1P05000 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFNW1P05000 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFNW1P05000 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFNW1P05000 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFNW1P05000 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFNW1P05000 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFNW1P05000 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFNW1P05000 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFNW1P05000 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFNW1P05000 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNW1P05000 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFNW1P05000 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNW1P05000 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNW1P05000 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNW1P05000 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNW1P05000 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNW1P05000 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNW1P05000 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFNW1P05000 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNW1P05000 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFNW1P05000 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFNW1P05000 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNW1P05000 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNW1P05000 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFNW1P05000 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNW1P05000 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
IFNW1P05000 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNW1P05000 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNW1P05000 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNW1P05000 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNW1P05000 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNW1P05000 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNW1P05000 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNW1P05000 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNW1P05000 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNW1P05000 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNW1P05000 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNW1P05000 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNW1P05000 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFNW1P05000 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNW1P05000 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNW1P05000 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFNW1P05000 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNW1P05000 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFNW1P05000 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFNW1P05000 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNW1P05000 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNW1P05000 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNW1P05000 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNW1P05000 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNW1P05000 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNW1P05000 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNW1P05000 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNW1P05000 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNW1P05000 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNW1P05000 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNW1P05000 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFNW1P05000 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNW1P05000 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNW1P05000 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNW1P05000 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNW1P05000 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNW1P05000 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFNW1P05000 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNW1P05000 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNW1P05000 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNW1P05000 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNW1P05000 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNW1P05000 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNW1P05000 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNW1P05000 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNW1P05000 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNW1P05000 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNW1P05000 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNW1P05000 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNW1P05000 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNW1P05000 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNW1P05000 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNW1P05000 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFNW1P05000 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFNW1P05000 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms