Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC10BA6NIK2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC10BA6NIK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC10BA6NIK2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC10BA6NIK2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms