RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.75■■■■■ 8.44
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LMO1-202ENST00000428101 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.45■■■■■ 6.79
LMO1-202ENST00000428101 NACADO15069 1562 aa57.18■■■■■ 6.74
LMO1-202ENST00000428101 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.97■■■■■ 6.71
LMO1-202ENST00000428101 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.55■■■■■ 6.64
LMO1-202ENST00000428101 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.24■■■■■ 6.59
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LMO1-202ENST00000428101 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.15■■■■■ 6.58
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LMO1-202ENST00000428101 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.05■■■■■ 6.4
LMO1-202ENST00000428101 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.4■■■■■ 6.3
LMO1-202ENST00000428101 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.38■■■■■ 6.3
LMO1-202ENST00000428101 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.16■■■■■ 6.26
LMO1-202ENST00000428101 NCAPD3P42695 1498 aa52.81■■■■■ 6.04
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LMO1-202ENST00000428101 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.71■■■■■ 6.03
LMO1-202ENST00000428101 SMARCA2P51531 1590 aa52.55■■■■■ 6
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LMO1-202ENST00000428101 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.22■■■■■ 5.95
LMO1-202ENST00000428101 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.18■■■■■ 5.94
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LMO1-202ENST00000428101 NESP48681 1621 aa51.85■■■■■ 5.89
LMO1-202ENST00000428101 CUX2O14529 1486 aa51.67■■■■■ 5.86
LMO1-202ENST00000428101 WIZO95785 1651 aa51.62■■■■■ 5.85
LMO1-202ENST00000428101 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.52■■■■■ 5.84
LMO1-202ENST00000428101 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.3■■■■■ 5.8
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LMO1-202ENST00000428101 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.19■■■■■ 5.79
LMO1-202ENST00000428101 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.18■■■■■ 5.78
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LMO1-202ENST00000428101 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.73■■■■■ 5.71
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LMO1-202ENST00000428101 WDR62O43379 1518 aa50.62■■■■■ 5.69
LMO1-202ENST00000428101 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.61■■■■■ 5.69
LMO1-202ENST00000428101 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.42■■■■■ 5.66
LMO1-202ENST00000428101 PRDM2Q13029 1718 aa50.25■■■■■ 5.64
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LMO1-202ENST00000428101 TOPBP1Q92547 1522 aa49.73■■■■■ 5.55
LMO1-202ENST00000428101 ABCC8Q09428 1581 aa49.62■■■■■ 5.53
LMO1-202ENST00000428101 IFT140Q96RY7 1462 aa49.6■■■■■ 5.53
LMO1-202ENST00000428101 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.56■■■■■ 5.52
LMO1-202ENST00000428101 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.51■■■■■ 5.52
LMO1-202ENST00000428101 OSCARQ8IYS5 282 aa49.4■■■■■ 5.5
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LMO1-202ENST00000428101 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.12■■■■■ 5.45
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LMO1-202ENST00000428101 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.07■■■■■ 5.45
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LMO1-202ENST00000428101 SOGA1O94964 1423 aa49.02■■■■■ 5.44
LMO1-202ENST00000428101 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.99■■■■■ 5.43
LMO1-202ENST00000428101 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.41
LMO1-202ENST00000428101 CHD1O14646 1710 aa48.8■■■■■ 5.4
LMO1-202ENST00000428101 WDR97A6NE52 1622 aa48.75■■■■■ 5.39
LMO1-202ENST00000428101 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.72■■■■■ 5.39
LMO1-202ENST00000428101 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.72■■■■■ 5.39
LMO1-202ENST00000428101 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.72■■■■■ 5.39
LMO1-202ENST00000428101 FBLN2P98095 1184 aa48.66■■■■■ 5.38
LMO1-202ENST00000428101 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.61■■■■■ 5.37
LMO1-202ENST00000428101 ARHGEF11O15085 1522 aa48.6■■■■■ 5.37
LMO1-202ENST00000428101 GRIN2BQ13224 1484 aa48.53■■■■■ 5.36
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LMO1-202ENST00000428101 PBRM1Q86U86 1689 aa48.38■■■■■ 5.34
LMO1-202ENST00000428101 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.36■■■■■ 5.33
LMO1-202ENST00000428101 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.36■■■■■ 5.33
LMO1-202ENST00000428101 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.35■■■■■ 5.33
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LMO1-202ENST00000428101 SYNJ1O43426 1573 aa48.32■■■■■ 5.33
LMO1-202ENST00000428101 SYNJ2O15056 1496 aa48.32■■■■■ 5.33
LMO1-202ENST00000428101 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.26■■■■■ 5.32
LMO1-202ENST00000428101 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.23■■■■■ 5.31
LMO1-202ENST00000428101 ARAP1Q96P48 1450 aa48.16■■■■■ 5.3
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LMO1-202ENST00000428101 GRIN2AQ12879 1464 aa47.91■■■■■ 5.26
LMO1-202ENST00000428101 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.86■■■■■ 5.25
LMO1-202ENST00000428101 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.83■■■■■ 5.25
LMO1-202ENST00000428101 NUP160Q12769 1436 aa47.76■■■■■ 5.24
LMO1-202ENST00000428101 CEP170Q5SW79 1584 aa47.75■■■■■ 5.23
LMO1-202ENST00000428101 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.56■■■■■ 5.2
LMO1-202ENST00000428101 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.51■■■■■ 5.2
LMO1-202ENST00000428101 SHROOM2Q13796 1616 aa47.5■■■■■ 5.19
LMO1-202ENST00000428101 KIF27Q86VH2 1401 aa47.4■■■■■ 5.18
LMO1-202ENST00000428101 IGF1RP08069 1367 aa47.39■■■■■ 5.18
LMO1-202ENST00000428101 JPH4Q96JJ6 628 aa47.28■■■■■ 5.16
LMO1-202ENST00000428101 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.25■■■■■ 5.16
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