RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503639.7

HOPX-206, Transcript of HOP homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOPX, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPX-206ENST00000503639 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.15■■■■■ 8.5
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HOPX-206ENST00000503639 ABCC9O60706 1549 aa60.55■■■■■ 7.28
HOPX-206ENST00000503639 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.89■■■■■ 6.86
HOPX-206ENST00000503639 NACADO15069 1562 aa57.65■■■■■ 6.82
HOPX-206ENST00000503639 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.1■■■■■ 6.73
HOPX-206ENST00000503639 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.07■■■■■ 6.73
HOPX-206ENST00000503639 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.66■■■■■ 6.66
HOPX-206ENST00000503639 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.54■■■■■ 6.64
HOPX-206ENST00000503639 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.54■■■■■ 6.64
HOPX-206ENST00000503639 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.44■■■■■ 6.63
HOPX-206ENST00000503639 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.41■■■■■ 6.62
HOPX-206ENST00000503639 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.25■■■■■ 6.6
HOPX-206ENST00000503639 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.64■■■■■ 6.5
HOPX-206ENST00000503639 SCRIBQ14160 1630 aa55.42■■■■■ 6.46
HOPX-206ENST00000503639 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.79■■■■■ 6.36
HOPX-206ENST00000503639 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.78■■■■■ 6.36
HOPX-206ENST00000503639 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.59■■■■■ 6.33
HOPX-206ENST00000503639 NCAPD3P42695 1498 aa53.26■■■■■ 6.12
HOPX-206ENST00000503639 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.07■■■■■ 6.09
HOPX-206ENST00000503639 SMARCA4P51532 1647 aa53.04■■■■■ 6.08
HOPX-206ENST00000503639 SMARCA2P51531 1590 aa52.92■■■■■ 6.06
HOPX-206ENST00000503639 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.85■■■■■ 6.05
HOPX-206ENST00000503639 HMGXB3Q12766 1538 aa52.84■■■■■ 6.05
HOPX-206ENST00000503639 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.67■■■■■ 6.02
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HOPX-206ENST00000503639 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.45■■■■■ 5.99
HOPX-206ENST00000503639 ERCC6Q03468 1493 aa52.23■■■■■ 5.95
HOPX-206ENST00000503639 CUX2O14529 1486 aa52.22■■■■■ 5.95
HOPX-206ENST00000503639 NESP48681 1621 aa52.13■■■■■ 5.94
HOPX-206ENST00000503639 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.93■■■■■ 5.9
HOPX-206ENST00000503639 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.86■■■■■ 5.89
HOPX-206ENST00000503639 WIZO95785 1651 aa51.77■■■■■ 5.88
HOPX-206ENST00000503639 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.61■■■■■ 5.85
HOPX-206ENST00000503639 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.61■■■■■ 5.85
HOPX-206ENST00000503639 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.59■■■■■ 5.85
HOPX-206ENST00000503639 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.53■■■■■ 5.84
HOPX-206ENST00000503639 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.45■■■■■ 5.83
HOPX-206ENST00000503639 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
HOPX-206ENST00000503639 CFTRP13569 1480 aa51.1■■■■■ 5.77
HOPX-206ENST00000503639 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.1■■■■■ 5.77
HOPX-206ENST00000503639 WDR62O43379 1518 aa51.02■■■■■ 5.76
HOPX-206ENST00000503639 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.94■■■■■ 5.75
HOPX-206ENST00000503639 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.93■■■■■ 5.74
HOPX-206ENST00000503639 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.64■■■■■ 5.7
HOPX-206ENST00000503639 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.52■■■■■ 5.68
HOPX-206ENST00000503639 PRDM2Q13029 1718 aa50.5■■■■■ 5.67
HOPX-206ENST00000503639 TOPBP1Q92547 1522 aa50.01■■■■■ 5.6
HOPX-206ENST00000503639 ABCC8Q09428 1581 aa50.01■■■■■ 5.6
HOPX-206ENST00000503639 IFT140Q96RY7 1462 aa49.96■■■■■ 5.59
HOPX-206ENST00000503639 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.86■■■■■ 5.57
HOPX-206ENST00000503639 OSCARQ8IYS5 282 aa49.84■■■■■ 5.57
HOPX-206ENST00000503639 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.8■■■■■ 5.56
HOPX-206ENST00000503639 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.6■■■■■ 5.53
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HOPX-206ENST00000503639 TRIM41Q8WV44 630 aa49.42■■■■■ 5.5
HOPX-206ENST00000503639 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.38■■■■■ 5.5
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HOPX-206ENST00000503639 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.28■■■■■ 5.48
HOPX-206ENST00000503639 CUX1P39880 1505 aa49.26■■■■■ 5.48
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HOPX-206ENST00000503639 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.22■■■■■ 5.47
HOPX-206ENST00000503639 WDR97A6NE52 1622 aa49.18■■■■■ 5.46
HOPX-206ENST00000503639 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.11■■■■■ 5.45
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HOPX-206ENST00000503639 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.09■■■■■ 5.45
HOPX-206ENST00000503639 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.09■■■■■ 5.45
HOPX-206ENST00000503639 CHD1O14646 1710 aa49.05■■■■■ 5.44
HOPX-206ENST00000503639 ARHGEF11O15085 1522 aa49.01■■■■■ 5.44
HOPX-206ENST00000503639 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.86■■■■■ 5.41
HOPX-206ENST00000503639 GRIN2BQ13224 1484 aa48.86■■■■■ 5.41
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HOPX-206ENST00000503639 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.78■■■■■ 5.4
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HOPX-206ENST00000503639 SYNJ2O15056 1496 aa48.67■■■■■ 5.38
HOPX-206ENST00000503639 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
HOPX-206ENST00000503639 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.63■■■■■ 5.38
HOPX-206ENST00000503639 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.63■■■■■ 5.38
HOPX-206ENST00000503639 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.59■■■■■ 5.37
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HOPX-206ENST00000503639 PBRM1Q86U86 1689 aa48.58■■■■■ 5.37
HOPX-206ENST00000503639 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.58■■■■■ 5.37
HOPX-206ENST00000503639 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.56■■■■■ 5.36
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HOPX-206ENST00000503639 ARAP1Q96P48 1450 aa48.55■■■■■ 5.36
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HOPX-206ENST00000503639 ADAMTS12P58397 1594 aa48.2■■■■■ 5.31
HOPX-206ENST00000503639 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.17■■■■■ 5.3
HOPX-206ENST00000503639 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.14■■■■■ 5.3
HOPX-206ENST00000503639 NUP160Q12769 1436 aa48.12■■■■■ 5.29
HOPX-206ENST00000503639 CEP170Q5SW79 1584 aa48■■■■■ 5.27
HOPX-206ENST00000503639 SHROOM2Q13796 1616 aa47.85■■■■■ 5.25
HOPX-206ENST00000503639 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
HOPX-206ENST00000503639 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.8■■■■■ 5.24
HOPX-206ENST00000503639 IGF1RP08069 1367 aa47.64■■■■■ 5.22
HOPX-206ENST00000503639 KIF27Q86VH2 1401 aa47.62■■■■■ 5.21
HOPX-206ENST00000503639 JPH4Q96JJ6 628 aa47.58■■■■■ 5.21
HOPX-206ENST00000503639 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
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