RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.42■■■■■ 7.9
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.27■■■■■ 6.76
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCC9O60706 1549 aa55.98■■■■■ 6.55
GTF3C4-202ENST00000483873 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.83■■■■■ 6.21
GTF3C4-202ENST00000483873 NACADO15069 1562 aa53.77■■■■■ 6.2
GTF3C4-202ENST00000483873 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.75■■■■■ 6.19
GTF3C4-202ENST00000483873 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.69■■■■■ 6.19
GTF3C4-202ENST00000483873 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.42■■■■■ 6.14
GTF3C4-202ENST00000483873 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.25■■■■■ 6.11
GTF3C4-202ENST00000483873 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.8■■■■■ 6.04
GTF3C4-202ENST00000483873 SCRIBQ14160 1630 aa52.32■■■■■ 5.97
GTF3C4-202ENST00000483873 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.29■■■■■ 5.96
GTF3C4-202ENST00000483873 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.28■■■■■ 5.96
GTF3C4-202ENST00000483873 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.57■■■■■ 5.85
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.43■■■■■ 5.82
GTF3C4-202ENST00000483873 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.86■■■■■ 5.73
GTF3C4-202ENST00000483873 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.65■■■■■ 5.7
GTF3C4-202ENST00000483873 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.24■■■■■ 5.63
GTF3C4-202ENST00000483873 SMARCA4P51532 1647 aa50.02■■■■■ 5.6
GTF3C4-202ENST00000483873 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.91■■■■■ 5.58
GTF3C4-202ENST00000483873 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.7■■■■■ 5.55
GTF3C4-202ENST00000483873 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.67■■■■■ 5.54
GTF3C4-202ENST00000483873 SMARCA2P51531 1590 aa49.59■■■■■ 5.53
GTF3C4-202ENST00000483873 NCAPD3P42695 1498 aa49.58■■■■■ 5.53
GTF3C4-202ENST00000483873 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.48■■■■■ 5.51
GTF3C4-202ENST00000483873 HMGXB3Q12766 1538 aa49.39■■■■■ 5.5
GTF3C4-202ENST00000483873 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.27■■■■■ 5.48
GTF3C4-202ENST00000483873 WIZO95785 1651 aa49.21■■■■■ 5.47
GTF3C4-202ENST00000483873 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.1■■■■■ 5.45
GTF3C4-202ENST00000483873 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.62■■■■■ 5.37
GTF3C4-202ENST00000483873 NESP48681 1621 aa48.5■■■■■ 5.35
GTF3C4-202ENST00000483873 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.32■■■■■ 5.33
GTF3C4-202ENST00000483873 ERCC6Q03468 1493 aa48.19■■■■■ 5.31
GTF3C4-202ENST00000483873 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.15■■■■■ 5.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.04■■■■■ 5.28
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.99■■■■■ 5.27
GTF3C4-202ENST00000483873 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.92■■■■■ 5.26
GTF3C4-202ENST00000483873 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
GTF3C4-202ENST00000483873 CFTRP13569 1480 aa47.9■■■■■ 5.26
GTF3C4-202ENST00000483873 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.24
GTF3C4-202ENST00000483873 PRDM2Q13029 1718 aa47.69■■■■■ 5.22
GTF3C4-202ENST00000483873 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.64■■■■■ 5.22
GTF3C4-202ENST00000483873 CUX2O14529 1486 aa47.63■■■■■ 5.21
GTF3C4-202ENST00000483873 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.57■■■■■ 5.21
GTF3C4-202ENST00000483873 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.49■■■■■ 5.19
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR62O43379 1518 aa47.35■■■■■ 5.17
GTF3C4-202ENST00000483873 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.97■■■■■ 5.11
GTF3C4-202ENST00000483873 TOPBP1Q92547 1522 aa46.91■■■■■ 5.1
GTF3C4-202ENST00000483873 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.86■■■■■ 5.09
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCC8Q09428 1581 aa46.81■■■■■ 5.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CUX1P39880 1505 aa46.62■■■■■ 5.05
GTF3C4-202ENST00000483873 IFT140Q96RY7 1462 aa46.54■■■■■ 5.04
GTF3C4-202ENST00000483873 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
GTF3C4-202ENST00000483873 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
GTF3C4-202ENST00000483873 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.42■■■■■ 5.02
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
GTF3C4-202ENST00000483873 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.34■■■■■ 5.01
GTF3C4-202ENST00000483873 SOGA1O94964 1423 aa46.27■■■■■ 5
GTF3C4-202ENST00000483873 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
GTF3C4-202ENST00000483873 SYNJ1O43426 1573 aa46.26■■■■■ 5
GTF3C4-202ENST00000483873 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
GTF3C4-202ENST00000483873 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.25■■■■■ 4.99
GTF3C4-202ENST00000483873 TOP2BQ02880 1626 aa46.21■■■■■ 4.99
GTF3C4-202ENST00000483873 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.13■■■■■ 4.97
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR97A6NE52 1622 aa46.12■■■■■ 4.97
GTF3C4-202ENST00000483873 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.94■■■■■ 4.94
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.82■■■■■ 4.93
GTF3C4-202ENST00000483873 PBRM1Q86U86 1689 aa45.79■■■■■ 4.92
GTF3C4-202ENST00000483873 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.76■■■■■ 4.92
GTF3C4-202ENST00000483873 GRIN2BQ13224 1484 aa45.73■■■■■ 4.91
GTF3C4-202ENST00000483873 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.72■■■■■ 4.91
GTF3C4-202ENST00000483873 CHD1O14646 1710 aa45.71■■■■■ 4.91
GTF3C4-202ENST00000483873 OSCARQ8IYS5 282 aa45.61■■■■■ 4.89
GTF3C4-202ENST00000483873 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
GTF3C4-202ENST00000483873 FBLN2P98095 1184 aa45.51■■■■■ 4.88
GTF3C4-202ENST00000483873 SYNJ2O15056 1496 aa45.43■■■■■ 4.86
GTF3C4-202ENST00000483873 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.39■■■■■ 4.86
GTF3C4-202ENST00000483873 ADAMTS12P58397 1594 aa45.38■■■■■ 4.85
GTF3C4-202ENST00000483873 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF27Q86VH2 1401 aa45.27■■■■■ 4.84
GTF3C4-202ENST00000483873 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.21■■■■■ 4.83
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIM41Q8WV44 630 aa45.18■■■■■ 4.82
GTF3C4-202ENST00000483873 GRIN2AQ12879 1464 aa45.18■■■■■ 4.82
GTF3C4-202ENST00000483873 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.14■■■■■ 4.82
GTF3C4-202ENST00000483873 IGF1RP08069 1367 aa45.09■■■■■ 4.81
GTF3C4-202ENST00000483873 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.04■■■■■ 4.8
GTF3C4-202ENST00000483873 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.04■■■■■ 4.8
GTF3C4-202ENST00000483873 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.04■■■■■ 4.8
GTF3C4-202ENST00000483873 CUL7Q14999 1698 aa45.03■■■■■ 4.8
GTF3C4-202ENST00000483873 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.01■■■■■ 4.8
GTF3C4-202ENST00000483873 CEP170Q5SW79 1584 aa45.01■■■■■ 4.8
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGEF11O15085 1522 aa45■■■■■ 4.79
GTF3C4-202ENST00000483873 NUP160Q12769 1436 aa44.95■■■■■ 4.79
GTF3C4-202ENST00000483873 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.82■■■■■ 4.77
GTF3C4-202ENST00000483873 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.74■■■■■ 4.75
GTF3C4-202ENST00000483873 SHROOM2Q13796 1616 aa44.66■■■■■ 4.74
GTF3C4-202ENST00000483873 ARAP1Q96P48 1450 aa44.65■■■■■ 4.74
GTF3C4-202ENST00000483873 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.59■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 461.8 ms