Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PHYKPL-217ENST00000511716 562 ntTSL 310.21□□□□□ -0.773e-6■■■□□ 17.8
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PCBP1Q15365 IP6K2-217ENST00000443853 579 ntTSL 39.99□□□□□ -0.813e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 AC099811.2-201ENST00000585562 646 ntTSL 39.76□□□□□ -0.853e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 KANSL1-204ENST00000572218 9095 ntTSL 1 (best)9.21□□□□□ -0.933e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PHYKPL-215ENST00000510913 643 ntTSL 39.16□□□□□ -0.943e-6■■■□□ 17.8
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PCBP1Q15365 SRC-209ENST00000489153 551 ntTSL 35.96□□□□□ -1.463e-6■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 PEG10-201ENST00000465184 788 ntTSL 35.71□□□□□ -1.58e-16■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 SERBP1-208ENST00000493607 615 ntTSL 226.01■■□□□ 1.751e-7■■■□□ 17.8
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PCBP1Q15365 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.991e-7■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-7■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.11e-7■■■□□ 17.8
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PCBP1Q15365 C2-203ENST00000411571 773 ntTSL 515.22■□□□□ 0.033e-9■■■□□ 17.8
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PCBP1Q15365 C2-208ENST00000452202 539 ntTSL 413.76□□□□□ -0.213e-9■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 GATAD2B-211ENST00000637918 1027 ntTSL 513.25□□□□□ -0.293e-7■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.463e-7■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CLCN7-206ENST00000563822 851 ntTSL 516.39■□□□□ 0.218e-7■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 COPE-208ENST00000598969 1770 ntTSL 522.82■■□□□ 1.244e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.894e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.854e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.664e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.414e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 COPE-205ENST00000595984 434 ntTSL 313.51□□□□□ -0.254e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 COPE-210ENST00000600528 261 ntTSL 310.42□□□□□ -0.744e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CIZ1-209ENST00000420484 684 ntTSL 333.01■■■□□ 2.874e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CIZ1-211ENST00000467178 904 ntTSL 324.74■■□□□ 1.554e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CIZ1-221ENST00000488559 952 ntTSL 522.39■■□□□ 1.174e-8■■■□□ 17.8
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PCBP1Q15365 CIZ1-202ENST00000324544 809 ntTSL 312.11□□□□□ -0.474e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 CIZ1-224ENST00000498156 642 ntTSL 59.77□□□□□ -0.854e-8■■■□□ 17.8
PCBP1Q15365 TPI1-204ENST00000474253 427 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.384e-23■■■□□ 17.8
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PCBP1Q15365 PABPC1-221ENST00000522720 593 ntTSL 418.19■□□□□ 0.54e-40■■■□□ 17.7
PCBP1Q15365 PABPC1-210ENST00000519363 453 ntTSL 416.3■□□□□ 0.24e-40■■■□□ 17.7
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PCBP1Q15365 ATP5G2-207ENST00000552120 511 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.042e-7■■■□□ 17.7
PCBP1Q15365 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.953e-7■■■□□ 17.7
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PCBP1Q15365 MLEC-203ENST00000535413 617 ntTSL 211.09□□□□□ -0.632e-8■■■□□ 17.7
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PCBP1Q15365 ANXA11-204ENST00000437799 610 ntTSL 216.68■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 17.7
PCBP1Q15365 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.69e-8■■■□□ 17.7
PCBP1Q15365 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.49e-8■■■□□ 17.7
PCBP1Q15365 AL713998.1-201ENST00000412872 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-46■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 TXN2-205ENST00000487725 736 ntTSL 321.24■□□□□ 0.998e-7■■■□□ 17.6
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PCBP1Q15365 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.288e-8■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 HSPG2-212ENST00000493940 584 ntTSL 513.93□□□□□ -0.185e-7■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.958e-11■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.528e-11■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 LTBP3-210ENST00000528516 3935 ntTSL 1 (best)17.42■□□□□ 0.388e-11■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 FERMT3-208ENST00000545896 911 ntTSL 519.16■□□□□ 0.665e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.235e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 FANCA-220ENST00000566409 395 ntTSL 1 (best)16.26■□□□□ 0.195e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.115e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.025e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.115e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.435e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 FANCA-225ENST00000567621 618 ntTSL 311.02□□□□□ -0.655e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.695e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.44e-8■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.344e-8■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-8■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 CTSB-203ENST00000420692 2230 ntTSL 216.8■□□□□ 0.284e-8■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 VTN-202ENST00000539746 609 ntTSL 213.04□□□□□ -0.326e-7■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 ESPN-214ENST00000633239 1494 ntTSL 520.46■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 SLC39A14-207ENST00000518348 1086 ntTSL 212.82□□□□□ -0.361e-6■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.787e-7■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 HCFC1-204ENST00000461098 379 ntTSL 513.21□□□□□ -0.291e-9■■■□□ 17.6
PCBP1Q15365 LTBP4-223ENST00000598717 811 ntTSL 521.18■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 17.5
PCBP1Q15365 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-10■■■□□ 17.5
PCBP1Q15365 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-10■■■□□ 17.5
PCBP1Q15365 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-22■■■□□ 17.5
PCBP1Q15365 PCBP2-214ENST00000549272 445 ntTSL 26.04□□□□□ -1.441e-9■■■□□ 17.5
PCBP1Q15365 SCAF1-203ENST00000598359 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.22■□□□□ 0.033e-8■■■□□ 17.5
PCBP1Q15365 CKAP4-202ENST00000552828 831 ntTSL 313.23□□□□□ -0.291e-8■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 CKAP4-203ENST00000553039 573 ntTSL 45.76□□□□□ -1.491e-8■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 17.4
PCBP1Q15365 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 17.4
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