RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1-209ENST00000420484 NISCHQ9Y2I1 1504 aa73.43■■■■■ 9.35
CIZ1-209ENST00000420484 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa65.61■■■■■ 8.09
CIZ1-209ENST00000420484 ABCC9O60706 1549 aa64.87■■■■■ 7.98
CIZ1-209ENST00000420484 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa62.09■■■■■ 7.53
CIZ1-209ENST00000420484 NACADO15069 1562 aa61.83■■■■■ 7.49
CIZ1-209ENST00000420484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61.65■■■■■ 7.46
CIZ1-209ENST00000420484 MYO15BQ96JP2 1530 aa61.22■■■■■ 7.39
CIZ1-209ENST00000420484 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60.99■■■■■ 7.35
CIZ1-209ENST00000420484 UNC13AQ9UPW8 1703 aa60.76■■■■■ 7.32
CIZ1-209ENST00000420484 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa60.71■■■■■ 7.31
CIZ1-209ENST00000420484 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP60.51■■■■■ 7.28
CIZ1-209ENST00000420484 BICRAQ9NZM4 1560 aa60.27■■■■■ 7.24
CIZ1-209ENST00000420484 DNAJC5BQ9UF47 199 aa60.25■■■■■ 7.24
CIZ1-209ENST00000420484 SCRIBQ14160 1630 aa59.8■■■■■ 7.16
CIZ1-209ENST00000420484 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa59.5■■■■■ 7.12
CIZ1-209ENST00000420484 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP58.71■■■■■ 6.99
CIZ1-209ENST00000420484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa58.67■■■■■ 6.98
CIZ1-209ENST00000420484 CECR2Q9BXF3 1484 aa58.36■■■■■ 6.93
CIZ1-209ENST00000420484 SMARCA4P51532 1647 aa57.14■■■■■ 6.74
CIZ1-209ENST00000420484 NCAPD3P42695 1498 aa57.08■■■■■ 6.73
CIZ1-209ENST00000420484 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.99■■■■■ 6.71
CIZ1-209ENST00000420484 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56.95■■■■■ 6.71
CIZ1-209ENST00000420484 SMARCA2P51531 1590 aa56.88■■■■■ 6.7
CIZ1-209ENST00000420484 HMGXB3Q12766 1538 aa56.71■■■■■ 6.67
CIZ1-209ENST00000420484 MROH2BQ7Z745 1585 aa56.59■■■■■ 6.65
CIZ1-209ENST00000420484 PEG3Q9GZU2 1588 aa56.59■■■■■ 6.65
CIZ1-209ENST00000420484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP56.47■■■■■ 6.63
CIZ1-209ENST00000420484 WIZO95785 1651 aa55.97■■■■■ 6.55
CIZ1-209ENST00000420484 NESP48681 1621 aa55.95■■■■■ 6.55
CIZ1-209ENST00000420484 ERCC6Q03468 1493 aa55.94■■■■■ 6.55
CIZ1-209ENST00000420484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa55.68■■■■■ 6.5
CIZ1-209ENST00000420484 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55.67■■■■■ 6.5
CIZ1-209ENST00000420484 CUX2O14529 1486 aa55.62■■■■■ 6.49
CIZ1-209ENST00000420484 CADPSQ9ULU8 1353 aa55.37■■■■■ 6.45
CIZ1-209ENST00000420484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa55.31■■■■■ 6.45
CIZ1-209ENST00000420484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa55.29■■■■■ 6.44
CIZ1-209ENST00000420484 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP55.29■■■■■ 6.44
CIZ1-209ENST00000420484 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP55.25■■■■■ 6.44
CIZ1-209ENST00000420484 CFTRP13569 1480 aa54.89■■■■■ 6.38
CIZ1-209ENST00000420484 MRC2Q9UBG0 1479 aa54.79■■■■■ 6.36
CIZ1-209ENST00000420484 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.79■■■■■ 6.36
CIZ1-209ENST00000420484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54.73■■■■■ 6.35
CIZ1-209ENST00000420484 CEP164Q9UPV0 1460 aa54.72■■■■■ 6.35
CIZ1-209ENST00000420484 CCDC88BA6NC98 1476 aa54.67■■■■■ 6.34
CIZ1-209ENST00000420484 WDR62O43379 1518 aa54.65■■■■■ 6.34
CIZ1-209ENST00000420484 PRDM2Q13029 1718 aa54.47■■■■■ 6.31
CIZ1-209ENST00000420484 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP54.25■■■■■ 6.28
CIZ1-209ENST00000420484 TOPBP1Q92547 1522 aa53.78■■■■■ 6.2
CIZ1-209ENST00000420484 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.72■■■■■ 6.19
CIZ1-209ENST00000420484 ABCC8Q09428 1581 aa53.72■■■■■ 6.19
CIZ1-209ENST00000420484 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53.66■■■■■ 6.18
CIZ1-209ENST00000420484 IFT140Q96RY7 1462 aa53.6■■■■■ 6.17
CIZ1-209ENST00000420484 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP53.46■■■■■ 6.15
CIZ1-209ENST00000420484 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP53.28■■■■■ 6.12
CIZ1-209ENST00000420484 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP53.27■■■■■ 6.12
CIZ1-209ENST00000420484 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP53.21■■■■■ 6.11
CIZ1-209ENST00000420484 OSCARQ8IYS5 282 aa53.21■■■■■ 6.11
CIZ1-209ENST00000420484 CUX1P39880 1505 aa53.12■■■■■ 6.09
CIZ1-209ENST00000420484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53.07■■■■■ 6.09
CIZ1-209ENST00000420484 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP53.07■■■■■ 6.093e-7■■■■□ 21.4
CIZ1-209ENST00000420484 SOGA1O94964 1423 aa53.05■■■■■ 6.08
CIZ1-209ENST00000420484 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53.05■■■■■ 6.08
CIZ1-209ENST00000420484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.85■■■■■ 6.05
CIZ1-209ENST00000420484 WDR97A6NE52 1622 aa52.77■■■■■ 6.04
CIZ1-209ENST00000420484 CHD1O14646 1710 aa52.71■■■■■ 6.03
CIZ1-209ENST00000420484 TRIM41Q8WV44 630 aa52.66■■■■■ 6.02
CIZ1-209ENST00000420484 FBLN2P98095 1184 aa52.56■■■■■ 6
CIZ1-209ENST00000420484 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa52.53■■■■■ 6
CIZ1-209ENST00000420484 GRIN2BQ13224 1484 aa52.5■■■■■ 6
CIZ1-209ENST00000420484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52.49■■■■■ 5.994e-7■■■□□ 16.7
CIZ1-209ENST00000420484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa52.49■■■■■ 5.99
CIZ1-209ENST00000420484 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa52.49■■■■■ 5.99
CIZ1-209ENST00000420484 TOP2BQ02880 1626 aa52.48■■■■■ 5.99
CIZ1-209ENST00000420484 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa52.46■■■■■ 5.99
CIZ1-209ENST00000420484 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa52.46■■■■■ 5.99
CIZ1-209ENST00000420484 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa52.46■■■■■ 5.99
CIZ1-209ENST00000420484 SYNJ1O43426 1573 aa52.44■■■■■ 5.99
CIZ1-209ENST00000420484 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP52.43■■■■■ 5.98
CIZ1-209ENST00000420484 GAPVD1Q14C86 1478 aa52.42■■■■■ 5.98
CIZ1-209ENST00000420484 PBRM1Q86U86 1689 aa52.39■■■■■ 5.98
CIZ1-209ENST00000420484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52.37■■■■■ 5.97
CIZ1-209ENST00000420484 ARHGEF11O15085 1522 aa52.35■■■■■ 5.97
CIZ1-209ENST00000420484 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP52.29■■■■■ 5.96
CIZ1-209ENST00000420484 SYNJ2O15056 1496 aa52.24■■■■■ 5.95
CIZ1-209ENST00000420484 CLASP1Q7Z460 1538 aa52.1■■■■■ 5.93
CIZ1-209ENST00000420484 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.91■■■■■ 5.9
CIZ1-209ENST00000420484 ADAMTS12P58397 1594 aa51.9■■■■■ 5.9
CIZ1-209ENST00000420484 ARAP1Q96P48 1450 aa51.87■■■■■ 5.89
CIZ1-209ENST00000420484 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51.85■■■■■ 5.89
CIZ1-209ENST00000420484 GRIN2AQ12879 1464 aa51.83■■■■■ 5.89
CIZ1-209ENST00000420484 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51.78■■■■■ 5.88
CIZ1-209ENST00000420484 CEP170Q5SW79 1584 aa51.63■■■■■ 5.86
CIZ1-209ENST00000420484 NUP160Q12769 1436 aa51.63■■■■■ 5.86
CIZ1-209ENST00000420484 KIF27Q86VH2 1401 aa51.45■■■■■ 5.83
CIZ1-209ENST00000420484 IGF1RP08069 1367 aa51.36■■■■■ 5.81
CIZ1-209ENST00000420484 SHROOM2Q13796 1616 aa51.35■■■■■ 5.81
CIZ1-209ENST00000420484 ERCC6L2Q5T890 1561 aa51.34■■■■■ 5.81
CIZ1-209ENST00000420484 CUL7Q14999 1698 aa51.25■■■■■ 5.8
CIZ1-209ENST00000420484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa51.16■■■■■ 5.78
CIZ1-209ENST00000420484 JPH4Q96JJ6 628 aa51.11■■■■■ 5.77
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