RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519363.1

PABPC1-210, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 4

Gene PABPC1, Length 453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-210ENST00000519363 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.69■■■■□ 3.14
PABPC1-210ENST00000519363 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.54■■■□□ 2.48
PABPC1-210ENST00000519363 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PABPC1-210ENST00000519363 ABCC9O60706 1549 aa28.81■■■□□ 2.2
PABPC1-210ENST00000519363 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.81■■■□□ 2.2
PABPC1-210ENST00000519363 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.59■■■□□ 2.17
PABPC1-210ENST00000519363 NACADO15069 1562 aa28.41■■■□□ 2.14
PABPC1-210ENST00000519363 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.36■■■□□ 2.13
PABPC1-210ENST00000519363 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.21■■■□□ 2.11
PABPC1-210ENST00000519363 SCRIBQ14160 1630 aa27.84■■■□□ 2.05
PABPC1-210ENST00000519363 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.83■■■□□ 2.04
PABPC1-210ENST00000519363 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.67■■■□□ 2.02
PABPC1-210ENST00000519363 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.34■■□□□ 1.97
PABPC1-210ENST00000519363 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
PABPC1-210ENST00000519363 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.87■■□□□ 1.89
PABPC1-210ENST00000519363 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PABPC1-210ENST00000519363 SMARCA4P51532 1647 aa26.76■■□□□ 1.87
PABPC1-210ENST00000519363 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PABPC1-210ENST00000519363 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.73■■□□□ 1.87
PABPC1-210ENST00000519363 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PABPC1-210ENST00000519363 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PABPC1-210ENST00000519363 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.51■■□□□ 1.83
PABPC1-210ENST00000519363 WIZO95785 1651 aa26.5■■□□□ 1.83
PABPC1-210ENST00000519363 SMARCA2P51531 1590 aa26.37■■□□□ 1.81
PABPC1-210ENST00000519363 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PABPC1-210ENST00000519363 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.31■■□□□ 1.8
PABPC1-210ENST00000519363 HMGXB3Q12766 1538 aa26.2■■□□□ 1.79
PABPC1-210ENST00000519363 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.17■■□□□ 1.78
PABPC1-210ENST00000519363 NCAPD3P42695 1498 aa26.17■■□□□ 1.78
PABPC1-210ENST00000519363 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PABPC1-210ENST00000519363 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.93■■□□□ 1.74
PABPC1-210ENST00000519363 PRDM2Q13029 1718 aa25.54■■□□□ 1.68
PABPC1-210ENST00000519363 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.52■■□□□ 1.68
PABPC1-210ENST00000519363 CFTRP13569 1480 aa25.5■■□□□ 1.67
PABPC1-210ENST00000519363 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.45■■□□□ 1.66
PABPC1-210ENST00000519363 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.42■■□□□ 1.66
PABPC1-210ENST00000519363 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.38■■□□□ 1.65
PABPC1-210ENST00000519363 ABCC8Q09428 1581 aa25.28■■□□□ 1.64
PABPC1-210ENST00000519363 NESP48681 1621 aa25.22■■□□□ 1.63
PABPC1-210ENST00000519363 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
PABPC1-210ENST00000519363 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.15■■□□□ 1.62
PABPC1-210ENST00000519363 TRIM41Q8WV44 630 aa25.13■■□□□ 1.61
PABPC1-210ENST00000519363 SYNJ1O43426 1573 aa25.13■■□□□ 1.61
PABPC1-210ENST00000519363 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.12■■□□□ 1.61
PABPC1-210ENST00000519363 TOP2BQ02880 1626 aa25.11■■□□□ 1.61
PABPC1-210ENST00000519363 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.1■■□□□ 1.61
PABPC1-210ENST00000519363 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.05■■□□□ 1.6
PABPC1-210ENST00000519363 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.05■■□□□ 1.6
PABPC1-210ENST00000519363 CUX1P39880 1505 aa25.03■■□□□ 1.6
PABPC1-210ENST00000519363 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.97■■□□□ 1.59
PABPC1-210ENST00000519363 TOPBP1Q92547 1522 aa24.87■■□□□ 1.57
PABPC1-210ENST00000519363 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-210ENST00000519363 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.83■■□□□ 1.56
PABPC1-210ENST00000519363 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.79■■□□□ 1.56
PABPC1-210ENST00000519363 EEA1Q15075 1411 aa24.78■■□□□ 1.56
PABPC1-210ENST00000519363 ERCC6Q03468 1493 aa24.77■■□□□ 1.56
PABPC1-210ENST00000519363 WDR62O43379 1518 aa24.75■■□□□ 1.55
PABPC1-210ENST00000519363 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PABPC1-210ENST00000519363 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PABPC1-210ENST00000519363 SOGA1O94964 1423 aa24.7■■□□□ 1.55
PABPC1-210ENST00000519363 WDR97A6NE52 1622 aa24.66■■□□□ 1.54
PABPC1-210ENST00000519363 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.62■■□□□ 1.53
PABPC1-210ENST00000519363 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.61■■□□□ 1.53
PABPC1-210ENST00000519363 KIF27Q86VH2 1401 aa24.59■■□□□ 1.53
PABPC1-210ENST00000519363 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PABPC1-210ENST00000519363 CUX2O14529 1486 aa24.55■■□□□ 1.52
PABPC1-210ENST00000519363 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.55■■□□□ 1.52
PABPC1-210ENST00000519363 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PABPC1-210ENST00000519363 KIF21BO75037 1637 aa24.5■■□□□ 1.51
PABPC1-210ENST00000519363 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.5■■□□□ 1.51
PABPC1-210ENST00000519363 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.48■■□□□ 1.51
PABPC1-210ENST00000519363 IFT140Q96RY7 1462 aa24.48■■□□□ 1.51
PABPC1-210ENST00000519363 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.39■■□□□ 1.49
PABPC1-210ENST00000519363 PRXQ9BXM0 1461 aa24.38■■□□□ 1.49
PABPC1-210ENST00000519363 GOLGA3Q08378 1498 aa24.38■■□□□ 1.49
PABPC1-210ENST00000519363 CUL7Q14999 1698 aa24.36■■□□□ 1.49
PABPC1-210ENST00000519363 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.34■■□□□ 1.49
PABPC1-210ENST00000519363 PBRM1Q86U86 1689 aa24.34■■□□□ 1.49
PABPC1-210ENST00000519363 IGF1RP08069 1367 aa24.33■■□□□ 1.49
PABPC1-210ENST00000519363 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.33■■□□□ 1.49
PABPC1-210ENST00000519363 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PABPC1-210ENST00000519363 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PABPC1-210ENST00000519363 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.26■■□□□ 1.47
PABPC1-210ENST00000519363 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PABPC1-210ENST00000519363 GRIN2BQ13224 1484 aa24.22■■□□□ 1.47
PABPC1-210ENST00000519363 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.479e-6■■□□□ 13.1
PABPC1-210ENST00000519363 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.21■■□□□ 1.47
PABPC1-210ENST00000519363 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.21■■□□□ 1.47
PABPC1-210ENST00000519363 ADAMTS12P58397 1594 aa24.18■■□□□ 1.46
PABPC1-210ENST00000519363 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.1■■□□□ 1.45
PABPC1-210ENST00000519363 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PABPC1-210ENST00000519363 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.09■■□□□ 1.45
PABPC1-210ENST00000519363 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PABPC1-210ENST00000519363 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.07■■□□□ 1.44
PABPC1-210ENST00000519363 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.05■■□□□ 1.44
PABPC1-210ENST00000519363 CEP162Q5TB80 1403 aa24.04■■□□□ 1.44
PABPC1-210ENST00000519363 SYNJ2O15056 1496 aa23.97■■□□□ 1.43
PABPC1-210ENST00000519363 GRIN2AQ12879 1464 aa23.94■■□□□ 1.42
PABPC1-210ENST00000519363 CLIP1P30622 1438 aa23.92■■□□□ 1.42
PABPC1-210ENST00000519363 CHD1O14646 1710 aa23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms