RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224073.5

EDF1-201, Transcript of endothelial differentiation related factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EDF1, Length 640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1-201ENST00000224073 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.3■■■□□ 2.6
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EDF1-201ENST00000224073 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.55■■□□□ 1.84
EDF1-201ENST00000224073 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.46■■□□□ 1.83
EDF1-201ENST00000224073 NACADO15069 1562 aa26.3■■□□□ 1.8
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EDF1-201ENST00000224073 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
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EDF1-201ENST00000224073 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.74■■□□□ 1.71
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EDF1-201ENST00000224073 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.08■■□□□ 1.61
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EDF1-201ENST00000224073 NCAPD3P42695 1498 aa24.31■■□□□ 1.48
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EDF1-201ENST00000224073 SMARCA2P51531 1590 aa24.21■■□□□ 1.47
EDF1-201ENST00000224073 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.2■■□□□ 1.46
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EDF1-201ENST00000224073 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.03■■□□□ 1.44
EDF1-201ENST00000224073 NESP48681 1621 aa24.01■■□□□ 1.43
EDF1-201ENST00000224073 ERCC6Q03468 1493 aa23.97■■□□□ 1.43
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EDF1-201ENST00000224073 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.64■■□□□ 1.38
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EDF1-201ENST00000224073 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.49■■□□□ 1.35
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EDF1-201ENST00000224073 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.39■■□□□ 1.34
EDF1-201ENST00000224073 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.36■■□□□ 1.33
EDF1-201ENST00000224073 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.36■■□□□ 1.33
EDF1-201ENST00000224073 WDR62O43379 1518 aa23.3■■□□□ 1.32
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EDF1-201ENST00000224073 TOPBP1Q92547 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
EDF1-201ENST00000224073 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
EDF1-201ENST00000224073 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.88■■□□□ 1.25
EDF1-201ENST00000224073 IFT140Q96RY7 1462 aa22.86■■□□□ 1.25
EDF1-201ENST00000224073 ABCC8Q09428 1581 aa22.81■■□□□ 1.24
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EDF1-201ENST00000224073 FBLN2P98095 1184 aa22.62■■□□□ 1.21
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EDF1-201ENST00000224073 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.48■■□□□ 1.19
EDF1-201ENST00000224073 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
EDF1-201ENST00000224073 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
EDF1-201ENST00000224073 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
EDF1-201ENST00000224073 WDR97A6NE52 1622 aa22.43■■□□□ 1.18
EDF1-201ENST00000224073 SYNJ1O43426 1573 aa22.42■■□□□ 1.18
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EDF1-201ENST00000224073 GRIN2BQ13224 1484 aa22.4■■□□□ 1.18
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EDF1-201ENST00000224073 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.33■■□□□ 1.17
EDF1-201ENST00000224073 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.32■■□□□ 1.16
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EDF1-201ENST00000224073 SYNJ2O15056 1496 aa22.29■■□□□ 1.16
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EDF1-201ENST00000224073 ARAP1Q96P48 1450 aa22.22■■□□□ 1.15
EDF1-201ENST00000224073 ADAMTS12P58397 1594 aa22.15■■□□□ 1.14
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EDF1-201ENST00000224073 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.06■■□□□ 1.12
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EDF1-201ENST00000224073 NUP160Q12769 1436 aa22.01■■□□□ 1.11
EDF1-201ENST00000224073 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
EDF1-201ENST00000224073 IGF1RP08069 1367 aa21.94■■□□□ 1.1
EDF1-201ENST00000224073 KIF27Q86VH2 1401 aa21.93■■□□□ 1.1
EDF1-201ENST00000224073 SHROOM2Q13796 1616 aa21.87■■□□□ 1.09
EDF1-201ENST00000224073 JPH4Q96JJ6 628 aa21.86■■□□□ 1.09
EDF1-201ENST00000224073 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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