Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 410.39□□□□□ -0.752e-12■■■■■ 67
AARSP49588 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-12■■■■■ 67
AARSP49588 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 66.8
AARSP49588 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 66.6
AARSP49588 LINC00963-201ENST00000412141 739 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 65.8
AARSP49588 LINC00963-204ENST00000427778 382 ntTSL 29.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 65.8
AARSP49588 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 421.1■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 65.5
AARSP49588 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 65.5
AARSP49588 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 65.5
AARSP49588 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 65.5
AARSP49588 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 517.5■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 65.5
AARSP49588 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 416.82■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 65.5
AARSP49588 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 215.84■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 65.5
AARSP49588 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 414.1□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 65.5
AARSP49588 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 513.44□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 65.5
AARSP49588 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 65.5
AARSP49588 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 65.2
AARSP49588 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.778e-9■■■■■ 62.5
AARSP49588 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.398e-9■■■■■ 62.5
AARSP49588 DHFR-205ENST00000511032 1474 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.68e-9■■■■■ 62.5
AARSP49588 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.818e-9■■■■■ 62.5
AARSP49588 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.848e-9■■■■■ 62.5
AARSP49588 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 35.4□□□□□ -1.548e-9■■■■■ 62.5
AARSP49588 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 34.18□□□□□ -1.748e-9■■■■■ 62.5
AARSP49588 FBXW11-207ENST00000519693 758 ntTSL 228.1■■■□□ 2.094e-6■■■■■ 62.2
AARSP49588 FBXW11-212ENST00000523843 2099 ntTSL 523.41■■□□□ 1.344e-6■■■■■ 62.2
AARSP49588 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.284e-6■■■■■ 62.2
AARSP49588 FBXW11-204ENST00000517395 636 ntTSL 323.02■■□□□ 1.284e-6■■■■■ 62.2
AARSP49588 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 62.2
AARSP49588 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 62.2
AARSP49588 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 314.2□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 62.2
AARSP49588 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 62.2
AARSP49588 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 316.95■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 61.9
AARSP49588 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.53e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-203ENST00000553359 797 ntTSL 230.46■■■□□ 2.473e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-213ENST00000555949 550 ntTSL 430.46■■■□□ 2.473e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.463e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.333e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.33e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-209ENST00000484352 1771 ntTSL 228.65■■■□□ 2.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.053e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 327.47■■□□□ 1.993e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIAS2-202ENST00000398654 2043 ntTSL 1 (best)27.36■■□□□ 1.973e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.963e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.953e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.953e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)27.02■■□□□ 1.923e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.911e-16■■■■■ 61.8
AARSP49588 RNF207-206ENST00000485539 1413 ntTSL 1 (best)26.96■■□□□ 1.913e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.93e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.863e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LRRC8B-204ENST00000449440 763 ntTSL 326.51■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NUMBL-208ENST00000599594 393 ntTSL 526.24■■□□□ 1.793e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-218ENST00000556868 1067 ntTSL 225.41■■□□□ 1.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.623e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-211ENST00000440422 659 ntTSL 525.07■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LIMK2-206ENST00000462625 1042 ntTSL 225.07■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-203ENST00000437202 1479 ntTSL 1 (best)24.89■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-218ENST00000522535 653 ntTSL 424.71■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ACSS2-216ENST00000484354 517 ntTSL 524.68■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.523e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.523e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.513e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZBTB7B-206ENST00000487542 873 ntTSL 224.22■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMEM80-205ENST00000526170 1047 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.19■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-217ENST00000556844 1050 ntTSL 223.5■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-201ENST00000352800 611 ntTSL 523.26■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-208ENST00000443147 2054 ntTSL 222.83■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CACTIN-205ENST00000587175 2216 ntTSL 522.74■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 422.69■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-205ENST00000465323 674 ntTSL 222.46■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CACTIN-209ENST00000591978 2283 nt22.39■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LRRC23-210ENST00000449039 729 ntTSL 322.24■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CACTIN-207ENST00000589321 1708 ntTSL 522.17■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-216ENST00000556715 1025 ntTSL 321.74■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)21.59■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-232ENST00000600209 881 ntTSL 521.56■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 321.54■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 61.8
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 362.8 ms