RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556868.1

SLC25A29-218, Transcript of solute carrier family 25 member 29, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A29, Length 1,067 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A29-218ENST00000556868 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.38■■■■■ 6.78
SLC25A29-218ENST00000556868 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.29■■■■■ 5.8
SLC25A29-218ENST00000556868 ABCC9O60706 1549 aa49.89■■■■■ 5.58
SLC25A29-218ENST00000556868 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.18■■■■■ 5.3
SLC25A29-218ENST00000556868 NACADO15069 1562 aa48.13■■■■■ 5.3
SLC25A29-218ENST00000556868 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.92■■■■■ 5.26
SLC25A29-218ENST00000556868 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
SLC25A29-218ENST00000556868 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.65■■■■■ 5.22
SLC25A29-218ENST00000556868 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.53■■■■■ 5.2
SLC25A29-218ENST00000556868 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.17■■■■■ 5.14
SLC25A29-218ENST00000556868 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.69■■■■■ 5.07
SLC25A29-218ENST00000556868 SCRIBQ14160 1630 aa46.52■■■■■ 5.04
SLC25A29-218ENST00000556868 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.44■■■■■ 5.02
SLC25A29-218ENST00000556868 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.42■■■■■ 5.02
SLC25A29-218ENST00000556868 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.74■■■■■ 4.91
SLC25A29-218ENST00000556868 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
SLC25A29-218ENST00000556868 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.27■■■■■ 4.84
SLC25A29-218ENST00000556868 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.91■■■■■ 4.78
SLC25A29-218ENST00000556868 SMARCA4P51532 1647 aa44.6■■■■■ 4.73
SLC25A29-218ENST00000556868 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
SLC25A29-218ENST00000556868 SMARCA2P51531 1590 aa44.35■■■■■ 4.69
SLC25A29-218ENST00000556868 NCAPD3P42695 1498 aa44.34■■■■■ 4.69
SLC25A29-218ENST00000556868 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.29■■■■■ 4.68
SLC25A29-218ENST00000556868 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.27■■■■■ 4.68
SLC25A29-218ENST00000556868 HMGXB3Q12766 1538 aa44.22■■■■■ 4.67
SLC25A29-218ENST00000556868 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.14■■■■■ 4.66
SLC25A29-218ENST00000556868 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
SLC25A29-218ENST00000556868 WIZO95785 1651 aa43.69■■■■■ 4.58
SLC25A29-218ENST00000556868 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
SLC25A29-218ENST00000556868 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
SLC25A29-218ENST00000556868 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.27■■■■■ 4.52
SLC25A29-218ENST00000556868 NESP48681 1621 aa43.15■■■■■ 4.5
SLC25A29-218ENST00000556868 ERCC6Q03468 1493 aa43.06■■■■■ 4.48
SLC25A29-218ENST00000556868 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.96■■■■■ 4.47
SLC25A29-218ENST00000556868 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.86■■■■■ 4.45
SLC25A29-218ENST00000556868 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.82■■■■■ 4.45
SLC25A29-218ENST00000556868 CUX2O14529 1486 aa42.81■■■■■ 4.44
SLC25A29-218ENST00000556868 CFTRP13569 1480 aa42.76■■■■■ 4.44
SLC25A29-218ENST00000556868 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
SLC25A29-218ENST00000556868 PRDM2Q13029 1718 aa42.68■■■■■ 4.42
SLC25A29-218ENST00000556868 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.66■■■■■ 4.42
SLC25A29-218ENST00000556868 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.49■■■■■ 4.39
SLC25A29-218ENST00000556868 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.49■■■■■ 4.39
SLC25A29-218ENST00000556868 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.45■■■■■ 4.39
SLC25A29-218ENST00000556868 WDR62O43379 1518 aa42.39■■■■■ 4.38
SLC25A29-218ENST00000556868 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
SLC25A29-218ENST00000556868 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
SLC25A29-218ENST00000556868 ABCC8Q09428 1581 aa41.91■■■■■ 4.3
SLC25A29-218ENST00000556868 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.84■■■■■ 4.29
SLC25A29-218ENST00000556868 TOPBP1Q92547 1522 aa41.82■■■■■ 4.29
SLC25A29-218ENST00000556868 IFT140Q96RY7 1462 aa41.61■■■■■ 4.25
SLC25A29-218ENST00000556868 CUX1P39880 1505 aa41.45■■■■■ 4.23
SLC25A29-218ENST00000556868 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
SLC25A29-218ENST00000556868 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
SLC25A29-218ENST00000556868 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.4■■■■■ 4.22
SLC25A29-218ENST00000556868 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
SLC25A29-218ENST00000556868 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.31■■■■■ 4.2
SLC25A29-218ENST00000556868 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
SLC25A29-218ENST00000556868 WDR97A6NE52 1622 aa41.29■■■■■ 4.2
SLC25A29-218ENST00000556868 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.22■■■■■ 4.19
SLC25A29-218ENST00000556868 SOGA1O94964 1423 aa41.18■■■■■ 4.18
SLC25A29-218ENST00000556868 TOP2BQ02880 1626 aa41.17■■■■■ 4.18
SLC25A29-218ENST00000556868 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.15■■■■■ 4.18
SLC25A29-218ENST00000556868 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.17
SLC25A29-218ENST00000556868 SYNJ1O43426 1573 aa41.07■■■■■ 4.16
SLC25A29-218ENST00000556868 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.162e-6■■■□□ 15.2
SLC25A29-218ENST00000556868 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.98■■■■■ 4.15
SLC25A29-218ENST00000556868 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.89■■■■■ 4.14
SLC25A29-218ENST00000556868 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SLC25A29-218ENST00000556868 PBRM1Q86U86 1689 aa40.85■■■■■ 4.13
SLC25A29-218ENST00000556868 CHD1O14646 1710 aa40.82■■■■■ 4.13
SLC25A29-218ENST00000556868 GRIN2BQ13224 1484 aa40.82■■■■■ 4.12
SLC25A29-218ENST00000556868 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
SLC25A29-218ENST00000556868 OSCARQ8IYS5 282 aa40.79■■■■■ 4.12
SLC25A29-218ENST00000556868 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.78■■■■■ 4.12
SLC25A29-218ENST00000556868 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.74■■■■■ 4.11
SLC25A29-218ENST00000556868 SYNJ2O15056 1496 aa40.59■■■■■ 4.09
SLC25A29-218ENST00000556868 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.54■■■■■ 4.08
SLC25A29-218ENST00000556868 ADAMTS12P58397 1594 aa40.49■■■■■ 4.07
SLC25A29-218ENST00000556868 FBLN2P98095 1184 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC25A29-218ENST00000556868 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
SLC25A29-218ENST00000556868 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.37■■■■■ 4.05
SLC25A29-218ENST00000556868 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.33■■■■■ 4.05
SLC25A29-218ENST00000556868 GRIN2AQ12879 1464 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC25A29-218ENST00000556868 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC25A29-218ENST00000556868 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC25A29-218ENST00000556868 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC25A29-218ENST00000556868 KIF27Q86VH2 1401 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC25A29-218ENST00000556868 ARHGEF11O15085 1522 aa40.27■■■■■ 4.04
SLC25A29-218ENST00000556868 CUL7Q14999 1698 aa40.21■■■■■ 4.03
SLC25A29-218ENST00000556868 NUP160Q12769 1436 aa40.16■■■■■ 4.02
SLC25A29-218ENST00000556868 CEP170Q5SW79 1584 aa40.11■■■■■ 4.01
SLC25A29-218ENST00000556868 IGF1RP08069 1367 aa40.05■■■■■ 4
SLC25A29-218ENST00000556868 SHROOM2Q13796 1616 aa39.96■■■■□ 3.99
SLC25A29-218ENST00000556868 ARAP1Q96P48 1450 aa39.92■■■■□ 3.98
SLC25A29-218ENST00000556868 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.91■■■■□ 3.98
SLC25A29-218ENST00000556868 TRIM41Q8WV44 630 aa39.89■■■■□ 3.98
SLC25A29-218ENST00000556868 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.82■■■■□ 3.96
SLC25A29-218ENST00000556868 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.72■■■■□ 3.95
SLC25A29-218ENST00000556868 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.65■■■■□ 3.94
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