Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-132■■■■■ 9811.8
AARSP49588 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-132■■■■■ 9811.8
AARSP49588 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-132■■■■■ 9811.8
AARSP49588 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.152e-132■■■■■ 9811.8
AARSP49588 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.762e-132■■■■■ 9811.8
AARSP49588 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 317.3■□□□□ 0.362e-132■■■■■ 8732.6
AARSP49588 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.151e-323■■■■■ 386.4
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AARSP49588 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)23.03■■□□□ 1.283e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.03■□□□□ 0.83e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.673e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.313e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.213e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.81□□□□□ -0.843e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.78□□□□□ -0.843e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.71□□□□□ -1.023e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 44.73□□□□□ -1.653e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 54.21□□□□□ -1.743e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 53.74□□□□□ -1.813e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.183e-49■■■■■ 252.4
AARSP49588 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)22.3■■□□□ 1.165e-25■■■■■ 227
AARSP49588 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.525e-25■■■■■ 227
AARSP49588 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.221e-12■■■■■ 160.6
AARSP49588 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.914e-34■■■■■ 138.7
AARSP49588 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 124
AARSP49588 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 124
AARSP49588 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.96□□□□□ -1.461e-8■■■■■ 124
AARSP49588 BEND7-205ENST00000466271 990 ntTSL 529.31■■■□□ 2.283e-12■■■■■ 123.6
AARSP49588 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-12■■■■■ 123.6
AARSP49588 BEND7-202ENST00000378605 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.533e-12■■■■■ 123.6
AARSP49588 VCL-203ENST00000461383 268 ntTSL 23.65□□□□□ -1.833e-12■■■■■ 123.6
AARSP49588 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.423e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.333e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.253e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 ADD3-201ENST00000277900 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.723e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 ADD3-203ENST00000360162 3114 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.813e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.423e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 GPHN-207ENST00000555456 841 ntTSL 25.78□□□□□ -1.483e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 GPHN-205ENST00000544752 2514 ntTSL 25.78□□□□□ -1.483e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 ADD3-205ENST00000468251 697 ntTSL 52.99□□□□□ -1.933e-11■■■■■ 113.3
AARSP49588 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 218.28■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 109.9
AARSP49588 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 109.9
AARSP49588 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 106.5
AARSP49588 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.43e-10■■■■■ 103
AARSP49588 CSNK1G2-205ENST00000589385 896 ntTSL 520.08■□□□□ 0.813e-10■■■■■ 103
AARSP49588 MAD1L1-221ENST00000486340 646 ntTSL 318.55■□□□□ 0.563e-10■■■■■ 103
AARSP49588 CSNK1G2-209ENST00000591752 648 ntTSL 518.37■□□□□ 0.533e-10■■■■■ 103
AARSP49588 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 417.65■□□□□ 0.423e-10■■■■■ 103
AARSP49588 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-10■■■■■ 103
AARSP49588 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-10■■■■■ 103
AARSP49588 PNPLA7-203ENST00000434090 2419 ntTSL 516.66■□□□□ 0.263e-10■■■■■ 103
AARSP49588 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 103
AARSP49588 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-10■■■■■ 103
AARSP49588 COX15-201ENST00000016171 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.453e-10■■■■■ 103
AARSP49588 COX15-202ENST00000370483 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-10■■■■■ 103
AARSP49588 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-10■■■■■ 103
AARSP49588 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.543e-10■■■■■ 103
AARSP49588 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 311.42□□□□□ -0.583e-10■■■■■ 103
AARSP49588 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.033e-10■■■■■ 103
AARSP49588 MAD1L1-217ENST00000469871 477 ntTSL 37.8□□□□□ -1.163e-10■■■■■ 103
AARSP49588 TIA1-216ENST00000486392 514 ntTSL 36.31□□□□□ -1.43e-10■■■■■ 103
AARSP49588 TIA1-217ENST00000495774 533 ntTSL 22.51□□□□□ -2.013e-10■■■■■ 103
AARSP49588 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.773e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.22■■□□□ 1.313e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.283e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 CACNA1C-230ENST00000543114 577 ntTSL 421.37■■□□□ 1.013e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 320.36■□□□□ 0.853e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 518.71■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 517.23■□□□□ 0.353e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.69■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 316.05■□□□□ 0.162e-17■■■■■ 92.7
AARSP49588 FAM102A-207ENST00000494606 536 ntTSL 315.92■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 215.87■□□□□ 0.132e-17■■■■■ 92.7
AARSP49588 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-17■■■■■ 92.7
AARSP49588 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-17■■■■■ 92.7
AARSP49588 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.122e-17■■■■■ 92.7
AARSP49588 FAM102A-206ENST00000493175 423 ntTSL 314.01□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-17■■■■■ 92.7
AARSP49588 WDR81-208ENST00000464528 4432 ntTSL 213.8□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 AC005342.1-201ENST00000354425 629 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.543e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-17■■■■■ 92.7
AARSP49588 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-17■■■■■ 92.7
AARSP49588 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 37.84□□□□□ -1.153e-9■■■■■ 92.7
AARSP49588 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 35.55□□□□□ -1.523e-9■■■■■ 92.7
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