RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599594.1

NUMBL-208, Transcript of NUMB like, endocytic adaptor protein, humanhuman

TSL 5

Gene NUMBL, Length 393 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBL-208ENST00000599594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.37■■■■■ 6.93
NUMBL-208ENST00000599594 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.75■■■■■ 5.88
NUMBL-208ENST00000599594 ABCC9O60706 1549 aa50.16■■■■■ 5.62
NUMBL-208ENST00000599594 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.72■■■■■ 5.39
NUMBL-208ENST00000599594 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.58■■■■■ 5.37
NUMBL-208ENST00000599594 NACADO15069 1562 aa48.49■■■■■ 5.35
NUMBL-208ENST00000599594 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.47■■■■■ 5.35
NUMBL-208ENST00000599594 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.32■■■■■ 5.33
NUMBL-208ENST00000599594 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.3■■■■■ 5.32
NUMBL-208ENST00000599594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.46■■■■■ 5.19
NUMBL-208ENST00000599594 SCRIBQ14160 1630 aa47.27■■■■■ 5.16
NUMBL-208ENST00000599594 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.98■■■■■ 5.11
NUMBL-208ENST00000599594 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.92■■■■■ 5.1
NUMBL-208ENST00000599594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.49■■■■■ 5.03
NUMBL-208ENST00000599594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
NUMBL-208ENST00000599594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.57■■■■■ 4.89
NUMBL-208ENST00000599594 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.42■■■■■ 4.86
NUMBL-208ENST00000599594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.41■■■■■ 4.86
NUMBL-208ENST00000599594 SMARCA4P51532 1647 aa45.23■■■■■ 4.83
NUMBL-208ENST00000599594 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
NUMBL-208ENST00000599594 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.01■■■■■ 4.8
NUMBL-208ENST00000599594 SMARCA2P51531 1590 aa44.82■■■■■ 4.76
NUMBL-208ENST00000599594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.81■■■■■ 4.76
NUMBL-208ENST00000599594 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.74■■■■■ 4.75
NUMBL-208ENST00000599594 NCAPD3P42695 1498 aa44.71■■■■■ 4.75
NUMBL-208ENST00000599594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
NUMBL-208ENST00000599594 WIZO95785 1651 aa44.59■■■■■ 4.73
NUMBL-208ENST00000599594 HMGXB3Q12766 1538 aa44.57■■■■■ 4.73
NUMBL-208ENST00000599594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
NUMBL-208ENST00000599594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
NUMBL-208ENST00000599594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
NUMBL-208ENST00000599594 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.57■■■■■ 4.56
NUMBL-208ENST00000599594 NESP48681 1621 aa43.55■■■■■ 4.56
NUMBL-208ENST00000599594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.51■■■■■ 4.56
NUMBL-208ENST00000599594 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.43■■■■■ 4.54
NUMBL-208ENST00000599594 CFTRP13569 1480 aa43.28■■■■■ 4.52
NUMBL-208ENST00000599594 ERCC6Q03468 1493 aa43.2■■■■■ 4.51
NUMBL-208ENST00000599594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.16■■■■■ 4.5
NUMBL-208ENST00000599594 PRDM2Q13029 1718 aa43.13■■■■■ 4.49
NUMBL-208ENST00000599594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.11■■■■■ 4.49
NUMBL-208ENST00000599594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.96■■■■■ 4.47
NUMBL-208ENST00000599594 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.87■■■■■ 4.45
NUMBL-208ENST00000599594 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.44
NUMBL-208ENST00000599594 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.72■■■■■ 4.43
NUMBL-208ENST00000599594 WDR62O43379 1518 aa42.57■■■■■ 4.41
NUMBL-208ENST00000599594 CUX2O14529 1486 aa42.56■■■■■ 4.4
NUMBL-208ENST00000599594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
NUMBL-208ENST00000599594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.35■■■■■ 4.37
NUMBL-208ENST00000599594 TOPBP1Q92547 1522 aa42.34■■■■■ 4.37
NUMBL-208ENST00000599594 ABCC8Q09428 1581 aa42.34■■■■■ 4.37
NUMBL-208ENST00000599594 CUX1P39880 1505 aa42.2■■■■■ 4.35
NUMBL-208ENST00000599594 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
NUMBL-208ENST00000599594 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
NUMBL-208ENST00000599594 SYNJ1O43426 1573 aa41.99■■■■■ 4.31
NUMBL-208ENST00000599594 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.98■■■■■ 4.31
NUMBL-208ENST00000599594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
NUMBL-208ENST00000599594 TOP2BQ02880 1626 aa41.97■■■■■ 4.31
NUMBL-208ENST00000599594 IFT140Q96RY7 1462 aa41.95■■■■■ 4.31
NUMBL-208ENST00000599594 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
NUMBL-208ENST00000599594 SOGA1O94964 1423 aa41.83■■■■■ 4.29
NUMBL-208ENST00000599594 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.83■■■■■ 4.29
NUMBL-208ENST00000599594 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
NUMBL-208ENST00000599594 WDR97A6NE52 1622 aa41.67■■■■■ 4.26
NUMBL-208ENST00000599594 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
NUMBL-208ENST00000599594 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.58■■■■■ 4.25
NUMBL-208ENST00000599594 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.248e-7■■■□□ 17.6
NUMBL-208ENST00000599594 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
NUMBL-208ENST00000599594 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.42■■■■■ 4.22
NUMBL-208ENST00000599594 TRIM41Q8WV44 630 aa41.38■■■■■ 4.21
NUMBL-208ENST00000599594 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.36■■■■■ 4.21
NUMBL-208ENST00000599594 PBRM1Q86U86 1689 aa41.34■■■■■ 4.21
NUMBL-208ENST00000599594 GRIN2BQ13224 1484 aa41.29■■■■■ 4.2
NUMBL-208ENST00000599594 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.2■■■■■ 4.19
NUMBL-208ENST00000599594 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.17■■■■■ 4.18
NUMBL-208ENST00000599594 KIF27Q86VH2 1401 aa41.16■■■■■ 4.18
NUMBL-208ENST00000599594 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
NUMBL-208ENST00000599594 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.1■■■■■ 4.17
NUMBL-208ENST00000599594 CHD1O14646 1710 aa41.07■■■■■ 4.16
NUMBL-208ENST00000599594 ADAMTS12P58397 1594 aa40.99■■■■■ 4.15
NUMBL-208ENST00000599594 SYNJ2O15056 1496 aa40.97■■■■■ 4.15
NUMBL-208ENST00000599594 FBLN2P98095 1184 aa40.96■■■■■ 4.15
NUMBL-208ENST00000599594 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.94■■■■■ 4.14
NUMBL-208ENST00000599594 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
NUMBL-208ENST00000599594 IGF1RP08069 1367 aa40.9■■■■■ 4.14
NUMBL-208ENST00000599594 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.89■■■■■ 4.14
NUMBL-208ENST00000599594 CUL7Q14999 1698 aa40.86■■■■■ 4.13
NUMBL-208ENST00000599594 OSCARQ8IYS5 282 aa40.85■■■■■ 4.13
NUMBL-208ENST00000599594 GRIN2AQ12879 1464 aa40.77■■■■■ 4.12
NUMBL-208ENST00000599594 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.69■■■■■ 4.1
NUMBL-208ENST00000599594 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.68■■■■■ 4.1
NUMBL-208ENST00000599594 EEA1Q15075 1411 aa40.67■■■■■ 4.1
NUMBL-208ENST00000599594 CEP170Q5SW79 1584 aa40.58■■■■■ 4.09
NUMBL-208ENST00000599594 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.56■■■■■ 4.08
NUMBL-208ENST00000599594 NUP160Q12769 1436 aa40.55■■■■■ 4.08
NUMBL-208ENST00000599594 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
NUMBL-208ENST00000599594 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.53■■■■■ 4.08
NUMBL-208ENST00000599594 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.51■■■■■ 4.08
NUMBL-208ENST00000599594 PRXQ9BXM0 1461 aa40.47■■■■■ 4.07
NUMBL-208ENST00000599594 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.27■■■■■ 4.04
NUMBL-208ENST00000599594 KIF21BO75037 1637 aa40.26■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms