RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547956.1

CHST11-203, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHST11, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11-203ENST00000547956 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.95■■■■■ 7.35
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CHST11-203ENST00000547956 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.89■■■■■ 5.74
CHST11-203ENST00000547956 NACADO15069 1562 aa50.85■■■■■ 5.73
CHST11-203ENST00000547956 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.78■■■■■ 5.72
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CHST11-203ENST00000547956 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.42■■■■■ 5.66
CHST11-203ENST00000547956 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.73■■■■■ 5.55
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CHST11-203ENST00000547956 SCRIBQ14160 1630 aa49.39■■■■■ 5.5
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CHST11-203ENST00000547956 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.81■■■■■ 5.4
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CHST11-203ENST00000547956 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.81■■■■■ 5.24
CHST11-203ENST00000547956 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.47■■■■■ 5.19
CHST11-203ENST00000547956 SMARCA4P51532 1647 aa47.25■■■■■ 5.15
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CHST11-203ENST00000547956 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.98■■■■■ 5.11
CHST11-203ENST00000547956 NCAPD3P42695 1498 aa46.94■■■■■ 5.1
CHST11-203ENST00000547956 SMARCA2P51531 1590 aa46.92■■■■■ 5.1
CHST11-203ENST00000547956 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.78■■■■■ 5.08
CHST11-203ENST00000547956 HMGXB3Q12766 1538 aa46.7■■■■■ 5.07
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CHST11-203ENST00000547956 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.67■■■■■ 4.9
CHST11-203ENST00000547956 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.59■■■■■ 4.89
CHST11-203ENST00000547956 ERCC6Q03468 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
CHST11-203ENST00000547956 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.46■■■■■ 4.87
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CHST11-203ENST00000547956 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.38■■■■■ 4.86
CHST11-203ENST00000547956 CFTRP13569 1480 aa45.33■■■■■ 4.85
CHST11-203ENST00000547956 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.22■■■■■ 4.83
CHST11-203ENST00000547956 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.05■■■■■ 4.8
CHST11-203ENST00000547956 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
CHST11-203ENST00000547956 CUX2O14529 1486 aa45.02■■■■■ 4.8
CHST11-203ENST00000547956 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.98■■■■■ 4.79
CHST11-203ENST00000547956 PRDM2Q13029 1718 aa44.97■■■■■ 4.79
CHST11-203ENST00000547956 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.88■■■■■ 4.78
CHST11-203ENST00000547956 WDR62O43379 1518 aa44.72■■■■■ 4.75
CHST11-203ENST00000547956 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
CHST11-203ENST00000547956 ABCC8Q09428 1581 aa44.36■■■■■ 4.69
CHST11-203ENST00000547956 TOPBP1Q92547 1522 aa44.34■■■■■ 4.69
CHST11-203ENST00000547956 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.3■■■■■ 4.68
CHST11-203ENST00000547956 CUX1P39880 1505 aa44.05■■■■■ 4.64
CHST11-203ENST00000547956 IFT140Q96RY7 1462 aa44.03■■■■■ 4.64
CHST11-203ENST00000547956 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
CHST11-203ENST00000547956 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.89■■■■■ 4.62
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CHST11-203ENST00000547956 SOGA1O94964 1423 aa43.82■■■■■ 4.61
CHST11-203ENST00000547956 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.82■■■■■ 4.61
CHST11-203ENST00000547956 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.8■■■■■ 4.6
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CHST11-203ENST00000547956 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.7■■■■■ 4.59
CHST11-203ENST00000547956 SYNJ1O43426 1573 aa43.7■■■■■ 4.59
CHST11-203ENST00000547956 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.66■■■■■ 4.58
CHST11-203ENST00000547956 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
CHST11-203ENST00000547956 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.62■■■■■ 4.57
CHST11-203ENST00000547956 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
CHST11-203ENST00000547956 WDR97A6NE52 1622 aa43.5■■■■■ 4.55
CHST11-203ENST00000547956 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.48■■■■■ 4.55
CHST11-203ENST00000547956 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.31■■■■■ 4.52
CHST11-203ENST00000547956 GRIN2BQ13224 1484 aa43.28■■■■■ 4.52
CHST11-203ENST00000547956 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.27■■■■■ 4.52
CHST11-203ENST00000547956 OSCARQ8IYS5 282 aa43.22■■■■■ 4.51
CHST11-203ENST00000547956 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.19■■■■■ 4.51
CHST11-203ENST00000547956 PBRM1Q86U86 1689 aa43.18■■■■■ 4.5
CHST11-203ENST00000547956 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
CHST11-203ENST00000547956 FBLN2P98095 1184 aa43.1■■■■■ 4.49
CHST11-203ENST00000547956 CHD1O14646 1710 aa43.08■■■■■ 4.49
CHST11-203ENST00000547956 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
CHST11-203ENST00000547956 SYNJ2O15056 1496 aa42.98■■■■■ 4.47
CHST11-203ENST00000547956 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.96■■■■■ 4.47
CHST11-203ENST00000547956 TRIM41Q8WV44 630 aa42.91■■■■■ 4.46
CHST11-203ENST00000547956 KIF27Q86VH2 1401 aa42.9■■■■■ 4.46
CHST11-203ENST00000547956 ADAMTS12P58397 1594 aa42.84■■■■■ 4.45
CHST11-203ENST00000547956 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.81■■■■■ 4.44
CHST11-203ENST00000547956 IGF1RP08069 1367 aa42.74■■■■■ 4.43
CHST11-203ENST00000547956 GRIN2AQ12879 1464 aa42.72■■■■■ 4.43
CHST11-203ENST00000547956 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.61■■■■■ 4.41
CHST11-203ENST00000547956 CUL7Q14999 1698 aa42.57■■■■■ 4.41
CHST11-203ENST00000547956 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.56■■■■■ 4.4
CHST11-203ENST00000547956 NUP160Q12769 1436 aa42.52■■■■■ 4.4
CHST11-203ENST00000547956 CEP170Q5SW79 1584 aa42.49■■■■■ 4.39
CHST11-203ENST00000547956 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.49■■■■■ 4.39
CHST11-203ENST00000547956 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.48■■■■■ 4.39
CHST11-203ENST00000547956 ARHGEF11O15085 1522 aa42.47■■■■■ 4.39
CHST11-203ENST00000547956 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
CHST11-203ENST00000547956 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
CHST11-203ENST00000547956 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
CHST11-203ENST00000547956 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.23■■■■■ 4.35
CHST11-203ENST00000547956 SHROOM2Q13796 1616 aa42.17■■■■■ 4.34
CHST11-203ENST00000547956 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.16■■■■■ 4.34
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