RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546689.1

CHST11-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHST11, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11-202ENST00000546689 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.83■■■■■ 7.49
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CHST11-202ENST00000546689 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.85■■■■■ 5.41
CHST11-202ENST00000546689 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.55■■■■■ 5.36
CHST11-202ENST00000546689 SMARCA4P51532 1647 aa48.03■■■■■ 5.28
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CHST11-202ENST00000546689 SMARCA2P51531 1590 aa47.72■■■■■ 5.23
CHST11-202ENST00000546689 NCAPD3P42695 1498 aa47.71■■■■■ 5.23
CHST11-202ENST00000546689 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.69■■■■■ 5.22
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CHST11-202ENST00000546689 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.19■■■■■ 4.98
CHST11-202ENST00000546689 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.12■■■■■ 4.97
CHST11-202ENST00000546689 CUX2O14529 1486 aa46.05■■■■■ 4.96
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CHST11-202ENST00000546689 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
CHST11-202ENST00000546689 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.88■■■■■ 4.94
CHST11-202ENST00000546689 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.85■■■■■ 4.93
CHST11-202ENST00000546689 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.78■■■■■ 4.92
CHST11-202ENST00000546689 PRDM2Q13029 1718 aa45.77■■■■■ 4.92
CHST11-202ENST00000546689 WDR62O43379 1518 aa45.58■■■■■ 4.89
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CHST11-202ENST00000546689 ABCC8Q09428 1581 aa45.08■■■■■ 4.81
CHST11-202ENST00000546689 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.06■■■■■ 4.8
CHST11-202ENST00000546689 IFT140Q96RY7 1462 aa44.85■■■■■ 4.77
CHST11-202ENST00000546689 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.8■■■■■ 4.76
CHST11-202ENST00000546689 CUX1P39880 1505 aa44.74■■■■■ 4.75
CHST11-202ENST00000546689 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
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CHST11-202ENST00000546689 SYNJ1O43426 1573 aa44.33■■■■■ 4.69
CHST11-202ENST00000546689 TOP2BQ02880 1626 aa44.32■■■■■ 4.68
CHST11-202ENST00000546689 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.31■■■■■ 4.68
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CHST11-202ENST00000546689 WDR97A6NE52 1622 aa44.21■■■■■ 4.67
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CHST11-202ENST00000546689 FBLN2P98095 1184 aa44.1■■■■■ 4.65
CHST11-202ENST00000546689 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.06■■■■■ 4.64
CHST11-202ENST00000546689 GRIN2BQ13224 1484 aa44.04■■■■■ 4.64
CHST11-202ENST00000546689 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.04■■■■■ 4.64
CHST11-202ENST00000546689 CHD1O14646 1710 aa44.04■■■■■ 4.64
CHST11-202ENST00000546689 PBRM1Q86U86 1689 aa44.01■■■■■ 4.64
CHST11-202ENST00000546689 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.98■■■■■ 4.63
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CHST11-202ENST00000546689 TRIM41Q8WV44 630 aa43.51■■■■■ 4.56
CHST11-202ENST00000546689 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.51■■■■■ 4.56
CHST11-202ENST00000546689 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.51■■■■■ 4.56
CHST11-202ENST00000546689 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.51■■■■■ 4.56
CHST11-202ENST00000546689 GRIN2AQ12879 1464 aa43.47■■■■■ 4.55
CHST11-202ENST00000546689 ARHGEF11O15085 1522 aa43.45■■■■■ 4.55
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CHST11-202ENST00000546689 CEP170Q5SW79 1584 aa43.28■■■■■ 4.52
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CHST11-202ENST00000546689 NUP160Q12769 1436 aa43.22■■■■■ 4.51
CHST11-202ENST00000546689 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.18■■■■■ 4.5
CHST11-202ENST00000546689 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.12■■■■■ 4.49
CHST11-202ENST00000546689 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.12■■■■■ 4.49
CHST11-202ENST00000546689 ARAP1Q96P48 1450 aa43.09■■■■■ 4.49
CHST11-202ENST00000546689 SHROOM2Q13796 1616 aa42.92■■■■■ 4.46
CHST11-202ENST00000546689 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.9■■■■■ 4.46
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