RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449039.5

LRRC23-210, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-210ENST00000449039 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.53■■■■■ 5.68
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LRRC23-210ENST00000449039 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.8■■■■■ 4.44
LRRC23-210ENST00000449039 NACADO15069 1562 aa42.62■■■■■ 4.41
LRRC23-210ENST00000449039 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.57■■■■■ 4.41
LRRC23-210ENST00000449039 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.17■■■■■ 4.34
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LRRC23-210ENST00000449039 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.78■■■■■ 4.28
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LRRC23-210ENST00000449039 SCRIBQ14160 1630 aa41.16■■■■■ 4.18
LRRC23-210ENST00000449039 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.02■■■■■ 4.16
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LRRC23-210ENST00000449039 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.43■■■■■ 4.06
LRRC23-210ENST00000449039 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.26■■■■■ 4.04
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LRRC23-210ENST00000449039 SMARCA2P51531 1590 aa39.21■■■■□ 3.87
LRRC23-210ENST00000449039 HMGXB3Q12766 1538 aa39.06■■■■□ 3.84
LRRC23-210ENST00000449039 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.93■■■■□ 3.82
LRRC23-210ENST00000449039 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.92■■■■□ 3.82
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LRRC23-210ENST00000449039 NESP48681 1621 aa38.52■■■■□ 3.76
LRRC23-210ENST00000449039 WIZO95785 1651 aa38.48■■■■□ 3.75
LRRC23-210ENST00000449039 CUX2O14529 1486 aa38.41■■■■□ 3.74
LRRC23-210ENST00000449039 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.37■■■■□ 3.73
LRRC23-210ENST00000449039 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
LRRC23-210ENST00000449039 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.19■■■■□ 3.7
LRRC23-210ENST00000449039 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.18■■■■□ 3.7
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LRRC23-210ENST00000449039 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
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LRRC23-210ENST00000449039 CFTRP13569 1480 aa37.81■■■■□ 3.64
LRRC23-210ENST00000449039 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.78■■■■□ 3.64
LRRC23-210ENST00000449039 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.73■■■■□ 3.63
LRRC23-210ENST00000449039 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.72■■■■□ 3.63
LRRC23-210ENST00000449039 WDR62O43379 1518 aa37.65■■■■□ 3.62
LRRC23-210ENST00000449039 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.62■■■■□ 3.61
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LRRC23-210ENST00000449039 ABCC8Q09428 1581 aa37.06■■■■□ 3.52
LRRC23-210ENST00000449039 TOPBP1Q92547 1522 aa37.04■■■■□ 3.52
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LRRC23-210ENST00000449039 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
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LRRC23-210ENST00000449039 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.57■■■■□ 3.45
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LRRC23-210ENST00000449039 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.52■■■■□ 3.44
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LRRC23-210ENST00000449039 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
LRRC23-210ENST00000449039 WDR97A6NE52 1622 aa36.37■■■■□ 3.41
LRRC23-210ENST00000449039 FBLN2P98095 1184 aa36.31■■■■□ 3.4
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LRRC23-210ENST00000449039 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.16■■■■□ 3.38
LRRC23-210ENST00000449039 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.15■■■■□ 3.38
LRRC23-210ENST00000449039 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
LRRC23-210ENST00000449039 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
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LRRC23-210ENST00000449039 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.08■■■■□ 3.37
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LRRC23-210ENST00000449039 NUP160Q12769 1436 aa35.57■■■■□ 3.28
LRRC23-210ENST00000449039 CEP170Q5SW79 1584 aa35.52■■■■□ 3.28
LRRC23-210ENST00000449039 KIF27Q86VH2 1401 aa35.46■■■■□ 3.27
LRRC23-210ENST00000449039 IGF1RP08069 1367 aa35.38■■■■□ 3.25
LRRC23-210ENST00000449039 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
LRRC23-210ENST00000449039 SHROOM2Q13796 1616 aa35.34■■■■□ 3.25
LRRC23-210ENST00000449039 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.32■■■■□ 3.24
LRRC23-210ENST00000449039 CUL7Q14999 1698 aa35.28■■■■□ 3.24
LRRC23-210ENST00000449039 JPH4Q96JJ6 628 aa35.28■■■■□ 3.24
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