RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366654.4

FAM89A-201, Transcript of family with sequence similarity 89 member A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM89A, Length 1,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM89A-201ENST00000366654 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.04■■■■■ 8.48
FAM89A-201ENST00000366654 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.37■■■■■ 7.25
FAM89A-201ENST00000366654 ABCC9O60706 1549 aa59■■■■■ 7.04
FAM89A-201ENST00000366654 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.9■■■■■ 6.7
FAM89A-201ENST00000366654 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.77■■■■■ 6.68
FAM89A-201ENST00000366654 NACADO15069 1562 aa56.74■■■■■ 6.67
FAM89A-201ENST00000366654 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.7■■■■■ 6.67
FAM89A-201ENST00000366654 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.42■■■■■ 6.62
FAM89A-201ENST00000366654 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.26■■■■■ 6.6
FAM89A-201ENST00000366654 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.52■■■■■ 6.48
FAM89A-201ENST00000366654 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.21■■■■■ 6.43
FAM89A-201ENST00000366654 SCRIBQ14160 1630 aa55.17■■■■■ 6.42
FAM89A-201ENST00000366654 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.07■■■■■ 6.41
FAM89A-201ENST00000366654 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.42■■■■■ 6.3
FAM89A-201ENST00000366654 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.04■■■■■ 6.24
FAM89A-201ENST00000366654 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.6■■■■■ 6.17
FAM89A-201ENST00000366654 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.36■■■■■ 6.13
FAM89A-201ENST00000366654 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.03■■■■■ 6.08
FAM89A-201ENST00000366654 SMARCA4P51532 1647 aa52.76■■■■■ 6.04
FAM89A-201ENST00000366654 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.71■■■■■ 6.03
FAM89A-201ENST00000366654 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.46■■■■■ 5.99
FAM89A-201ENST00000366654 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.43■■■■■ 5.98
FAM89A-201ENST00000366654 NCAPD3P42695 1498 aa52.36■■■■■ 5.97
FAM89A-201ENST00000366654 SMARCA2P51531 1590 aa52.36■■■■■ 5.97
FAM89A-201ENST00000366654 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.21■■■■■ 5.95
FAM89A-201ENST00000366654 HMGXB3Q12766 1538 aa52.11■■■■■ 5.93
FAM89A-201ENST00000366654 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.02■■■■■ 5.92
FAM89A-201ENST00000366654 WIZO95785 1651 aa51.92■■■■■ 5.9
FAM89A-201ENST00000366654 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.92■■■■■ 5.9
FAM89A-201ENST00000366654 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.33■■■■■ 5.81
FAM89A-201ENST00000366654 NESP48681 1621 aa51.12■■■■■ 5.77
FAM89A-201ENST00000366654 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.95■■■■■ 5.75
FAM89A-201ENST00000366654 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.87■■■■■ 5.73
FAM89A-201ENST00000366654 ERCC6Q03468 1493 aa50.83■■■■■ 5.73
FAM89A-201ENST00000366654 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.83■■■■■ 5.73
FAM89A-201ENST00000366654 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.77■■■■■ 5.72
FAM89A-201ENST00000366654 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.63■■■■■ 5.7
FAM89A-201ENST00000366654 CFTRP13569 1480 aa50.59■■■■■ 5.69
FAM89A-201ENST00000366654 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.49■■■■■ 5.67
FAM89A-201ENST00000366654 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.29■■■■■ 5.64
FAM89A-201ENST00000366654 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.25■■■■■ 5.63
FAM89A-201ENST00000366654 PRDM2Q13029 1718 aa50.2■■■■■ 5.63
FAM89A-201ENST00000366654 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.2■■■■■ 5.63
FAM89A-201ENST00000366654 CUX2O14529 1486 aa50.18■■■■■ 5.62
FAM89A-201ENST00000366654 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.09■■■■■ 5.61
FAM89A-201ENST00000366654 WDR62O43379 1518 aa49.91■■■■■ 5.58
FAM89A-201ENST00000366654 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
FAM89A-201ENST00000366654 TOPBP1Q92547 1522 aa49.51■■■■■ 5.52
FAM89A-201ENST00000366654 ABCC8Q09428 1581 aa49.47■■■■■ 5.51
FAM89A-201ENST00000366654 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.44■■■■■ 5.51
FAM89A-201ENST00000366654 CUX1P39880 1505 aa49.19■■■■■ 5.47
FAM89A-201ENST00000366654 IFT140Q96RY7 1462 aa49.14■■■■■ 5.46
FAM89A-201ENST00000366654 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.1■■■■■ 5.45
FAM89A-201ENST00000366654 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.01■■■■■ 5.44
FAM89A-201ENST00000366654 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.95■■■■■ 5.43
FAM89A-201ENST00000366654 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
FAM89A-201ENST00000366654 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.93■■■■■ 5.42
FAM89A-201ENST00000366654 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.92■■■■■ 5.42
FAM89A-201ENST00000366654 SOGA1O94964 1423 aa48.92■■■■■ 5.42
FAM89A-201ENST00000366654 SYNJ1O43426 1573 aa48.82■■■■■ 5.41
FAM89A-201ENST00000366654 TOP2BQ02880 1626 aa48.81■■■■■ 5.4
FAM89A-201ENST00000366654 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.78■■■■■ 5.4
FAM89A-201ENST00000366654 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.72■■■■■ 5.39
FAM89A-201ENST00000366654 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.7■■■■■ 5.39
FAM89A-201ENST00000366654 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.65■■■■■ 5.38
FAM89A-201ENST00000366654 WDR97A6NE52 1622 aa48.56■■■■■ 5.36
FAM89A-201ENST00000366654 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.52■■■■■ 5.36
FAM89A-201ENST00000366654 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.5■■■■■ 5.35
FAM89A-201ENST00000366654 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.34■■■■■ 5.33
FAM89A-201ENST00000366654 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.31■■■■■ 5.32
FAM89A-201ENST00000366654 GRIN2BQ13224 1484 aa48.3■■■■■ 5.32
FAM89A-201ENST00000366654 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.22■■■■■ 5.31
FAM89A-201ENST00000366654 PBRM1Q86U86 1689 aa48.22■■■■■ 5.31
FAM89A-201ENST00000366654 OSCARQ8IYS5 282 aa48.2■■■■■ 5.31
FAM89A-201ENST00000366654 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.14■■■■■ 5.3
FAM89A-201ENST00000366654 FBLN2P98095 1184 aa48.12■■■■■ 5.29
FAM89A-201ENST00000366654 CHD1O14646 1710 aa48.1■■■■■ 5.29
FAM89A-201ENST00000366654 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
FAM89A-201ENST00000366654 SYNJ2O15056 1496 aa47.97■■■■■ 5.27
FAM89A-201ENST00000366654 TRIM41Q8WV44 630 aa47.96■■■■■ 5.27
FAM89A-201ENST00000366654 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.94■■■■■ 5.26
FAM89A-201ENST00000366654 KIF27Q86VH2 1401 aa47.91■■■■■ 5.26
FAM89A-201ENST00000366654 ADAMTS12P58397 1594 aa47.84■■■■■ 5.25
FAM89A-201ENST00000366654 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.77■■■■■ 5.24
FAM89A-201ENST00000366654 IGF1RP08069 1367 aa47.72■■■■■ 5.23
FAM89A-201ENST00000366654 GRIN2AQ12879 1464 aa47.69■■■■■ 5.22
FAM89A-201ENST00000366654 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.62■■■■■ 5.21
FAM89A-201ENST00000366654 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.58■■■■■ 5.21
FAM89A-201ENST00000366654 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.55■■■■■ 5.2
FAM89A-201ENST00000366654 CUL7Q14999 1698 aa47.53■■■■■ 5.2
FAM89A-201ENST00000366654 CEP170Q5SW79 1584 aa47.45■■■■■ 5.19
FAM89A-201ENST00000366654 NUP160Q12769 1436 aa47.45■■■■■ 5.19
FAM89A-201ENST00000366654 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.44■■■■■ 5.18
FAM89A-201ENST00000366654 ARHGEF11O15085 1522 aa47.39■■■■■ 5.18
FAM89A-201ENST00000366654 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.38■■■■■ 5.18
FAM89A-201ENST00000366654 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.38■■■■■ 5.18
FAM89A-201ENST00000366654 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.38■■■■■ 5.18
FAM89A-201ENST00000366654 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.16■■■■■ 5.14
FAM89A-201ENST00000366654 EEA1Q15075 1411 aa47.07■■■■■ 5.13
FAM89A-201ENST00000366654 SHROOM2Q13796 1616 aa47.07■■■■■ 5.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms