RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556844.1

SLC25A29-217, Transcript of solute carrier family 25 member 29, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A29, Length 1,050 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A29-217ENST00000556844 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.92■■■■■ 6.22
SLC25A29-217ENST00000556844 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.36■■■■■ 5.33
SLC25A29-217ENST00000556844 ABCC9O60706 1549 aa47.69■■■■■ 5.22
SLC25A29-217ENST00000556844 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.68■■■■■ 4.9
SLC25A29-217ENST00000556844 NACADO15069 1562 aa45.48■■■■■ 4.87
SLC25A29-217ENST00000556844 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.03■■■■■ 4.8
SLC25A29-217ENST00000556844 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.98■■■■■ 4.79
SLC25A29-217ENST00000556844 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.9■■■■■ 4.78
SLC25A29-217ENST00000556844 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
SLC25A29-217ENST00000556844 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.62■■■■■ 4.73
SLC25A29-217ENST00000556844 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.43■■■■■ 4.7
SLC25A29-217ENST00000556844 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.34■■■■■ 4.69
SLC25A29-217ENST00000556844 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.29■■■■■ 4.68
SLC25A29-217ENST00000556844 SCRIBQ14160 1630 aa43.97■■■■■ 4.63
SLC25A29-217ENST00000556844 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.83■■■■■ 4.61
SLC25A29-217ENST00000556844 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
SLC25A29-217ENST00000556844 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.22■■■■■ 4.51
SLC25A29-217ENST00000556844 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.92■■■■■ 4.46
SLC25A29-217ENST00000556844 SMARCA4P51532 1647 aa42.04■■■■■ 4.32
SLC25A29-217ENST00000556844 NCAPD3P42695 1498 aa41.92■■■■■ 4.3
SLC25A29-217ENST00000556844 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.87■■■■■ 4.29
SLC25A29-217ENST00000556844 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
SLC25A29-217ENST00000556844 SMARCA2P51531 1590 aa41.8■■■■■ 4.28
SLC25A29-217ENST00000556844 HMGXB3Q12766 1538 aa41.75■■■■■ 4.27
SLC25A29-217ENST00000556844 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.66■■■■■ 4.26
SLC25A29-217ENST00000556844 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.55■■■■■ 4.24
SLC25A29-217ENST00000556844 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
SLC25A29-217ENST00000556844 NESP48681 1621 aa41.15■■■■■ 4.18
SLC25A29-217ENST00000556844 WIZO95785 1651 aa41.14■■■■■ 4.18
SLC25A29-217ENST00000556844 ERCC6Q03468 1493 aa41.09■■■■■ 4.17
SLC25A29-217ENST00000556844 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.99■■■■■ 4.15
SLC25A29-217ENST00000556844 CUX2O14529 1486 aa40.97■■■■■ 4.15
SLC25A29-217ENST00000556844 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.79■■■■■ 4.12
SLC25A29-217ENST00000556844 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
SLC25A29-217ENST00000556844 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
SLC25A29-217ENST00000556844 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
SLC25A29-217ENST00000556844 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.61■■■■■ 4.09
SLC25A29-217ENST00000556844 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.59■■■■■ 4.09
SLC25A29-217ENST00000556844 CFTRP13569 1480 aa40.32■■■■■ 4.04
SLC25A29-217ENST00000556844 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.3■■■■■ 4.04
SLC25A29-217ENST00000556844 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC25A29-217ENST00000556844 WDR62O43379 1518 aa40.26■■■■■ 4.03
SLC25A29-217ENST00000556844 PRDM2Q13029 1718 aa40.23■■■■■ 4.03
SLC25A29-217ENST00000556844 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.21■■■■■ 4.03
SLC25A29-217ENST00000556844 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.19■■■■■ 4.03
SLC25A29-217ENST00000556844 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.07■■■■■ 4.01
SLC25A29-217ENST00000556844 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
SLC25A29-217ENST00000556844 TOPBP1Q92547 1522 aa39.53■■■■□ 3.92
SLC25A29-217ENST00000556844 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.46■■■■□ 3.91
SLC25A29-217ENST00000556844 ABCC8Q09428 1581 aa39.42■■■■□ 3.9
SLC25A29-217ENST00000556844 IFT140Q96RY7 1462 aa39.37■■■■□ 3.89
SLC25A29-217ENST00000556844 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
SLC25A29-217ENST00000556844 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
SLC25A29-217ENST00000556844 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
SLC25A29-217ENST00000556844 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
SLC25A29-217ENST00000556844 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
SLC25A29-217ENST00000556844 CUX1P39880 1505 aa39.04■■■■□ 3.84
SLC25A29-217ENST00000556844 OSCARQ8IYS5 282 aa38.98■■■■□ 3.83
SLC25A29-217ENST00000556844 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.96■■■■□ 3.83
SLC25A29-217ENST00000556844 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.94■■■■□ 3.82
SLC25A29-217ENST00000556844 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.93■■■■□ 3.82
SLC25A29-217ENST00000556844 CHD1O14646 1710 aa38.9■■■■□ 3.82
SLC25A29-217ENST00000556844 WDR97A6NE52 1622 aa38.87■■■■□ 3.81
SLC25A29-217ENST00000556844 SOGA1O94964 1423 aa38.87■■■■□ 3.81
SLC25A29-217ENST00000556844 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
SLC25A29-217ENST00000556844 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.69■■■■□ 3.78
SLC25A29-217ENST00000556844 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.69■■■■□ 3.78
SLC25A29-217ENST00000556844 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.69■■■■□ 3.78
SLC25A29-217ENST00000556844 TRIM41Q8WV44 630 aa38.64■■■■□ 3.78
SLC25A29-217ENST00000556844 PBRM1Q86U86 1689 aa38.63■■■■□ 3.77
SLC25A29-217ENST00000556844 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.63■■■■□ 3.77
SLC25A29-217ENST00000556844 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.6■■■■□ 3.77
SLC25A29-217ENST00000556844 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.57■■■■□ 3.77
SLC25A29-217ENST00000556844 TOP2BQ02880 1626 aa38.56■■■■□ 3.76
SLC25A29-217ENST00000556844 ARHGEF11O15085 1522 aa38.56■■■■□ 3.76
SLC25A29-217ENST00000556844 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.55■■■■□ 3.76
SLC25A29-217ENST00000556844 GRIN2BQ13224 1484 aa38.54■■■■□ 3.76
SLC25A29-217ENST00000556844 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
SLC25A29-217ENST00000556844 SYNJ1O43426 1573 aa38.53■■■■□ 3.76
SLC25A29-217ENST00000556844 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.47■■■■□ 3.75
SLC25A29-217ENST00000556844 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.46■■■■□ 3.75
SLC25A29-217ENST00000556844 FBLN2P98095 1184 aa38.42■■■■□ 3.74
SLC25A29-217ENST00000556844 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.39■■■■□ 3.74
SLC25A29-217ENST00000556844 SYNJ2O15056 1496 aa38.38■■■■□ 3.73
SLC25A29-217ENST00000556844 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
SLC25A29-217ENST00000556844 ADAMTS12P58397 1594 aa38.22■■■■□ 3.71
SLC25A29-217ENST00000556844 ARAP1Q96P48 1450 aa38.22■■■■□ 3.71
SLC25A29-217ENST00000556844 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.1■■■■□ 3.69
SLC25A29-217ENST00000556844 GRIN2AQ12879 1464 aa38.09■■■■□ 3.69
SLC25A29-217ENST00000556844 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.02■■■■□ 3.68
SLC25A29-217ENST00000556844 CEP170Q5SW79 1584 aa38■■■■□ 3.67
SLC25A29-217ENST00000556844 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.97■■■■□ 3.67
SLC25A29-217ENST00000556844 NUP160Q12769 1436 aa37.95■■■■□ 3.67
SLC25A29-217ENST00000556844 SHROOM2Q13796 1616 aa37.86■■■■□ 3.65
SLC25A29-217ENST00000556844 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.8■■■■□ 3.64
SLC25A29-217ENST00000556844 CUL7Q14999 1698 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC25A29-217ENST00000556844 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC25A29-217ENST00000556844 KIF27Q86VH2 1401 aa37.66■■■■□ 3.62
SLC25A29-217ENST00000556844 IGF1RP08069 1367 aa37.59■■■■□ 3.61
SLC25A29-217ENST00000556844 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
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